多位点序列分型技术在深圳副溶血弧菌同源性分析中的应用研究

发布时间：2018-01-02 06:10

  本文关键词：多位点序列分型技术在深圳副溶血弧菌同源性分析中的应用研究　出处：《现代预防医学》2016年19期 　论文类型：期刊论文

  更多相关文章： 副溶血弧菌 tdh、trh毒力基因 同源性分析 基因分型 多位点序列分型 MLST

【摘要】：目的了解副溶血弧菌临床分离株的毒力基因、血清型及基因分型特征,探讨多位点序列分型(MLST)分型技术对其同源性分析的应用价值。方法收集深圳地区2007-2014年食物中毒及医院散发病例来源的68株副溶血弧菌菌株,对其进行血清型、毒力基因分析。选择副溶血弧菌MLST数据库提供的7个管家基因,PCR扩增测序后采用Bio Edit、e BURST等软件,对本次研究的68株副溶血弧菌进行MLST同源性分析。结果 68株副溶血弧菌共得到7种不同的血清型,优势血清型为O3∶K6(47/68),其余血清型分别为O4∶K8、O5∶K68、O4∶K13等。副溶血弧菌临床分离株94%为tdh+trh-。MIST分型将68株副溶血弧菌分为5个序列型(ST型),ST3为优势序列型(55/68),其余4种ST型中的ST189与ST345构成一个同源复合体CC345,且ST189为ST345的单位点变异型。结论深圳地区副溶血弧菌所致的腹泻病暴发疫情,其流行菌株ST型别多样化,疾病控制中需警惕非主流ST型别引起暴发可能。
[Abstract]:Objective to investigate the clinical isolates of Vibrio parahaemolyticus virulence genes, features and types of gene of serotype, multilocus sequence typing (MLST) typing technology on the application value of homology analysis. Methods 2007-2014 in Shenzhen area of food poisoning and hospital sources of sporadic cases of 68 strains of Vibrio parahaemolyticus strains, serum type the virulence gene analysis. 7 housekeeping genes with Vibrio parahaemolyticus MLST database, PCR sequencing by Bio Edit, e BURST, 68 strains of Vibrio parahaemolyticus in this study were MLST homology analysis. Results 68 strains of Vibrio parahaemolyticus were obtained from 7 different serotypes and the dominant serotype was O3: K6 (47/68), the other serotypes were O4, K8, O5, K68, O4, K13. Tdh+trh-.MIST typing of 68 strains of Vibrio parahaemolyticus strains were divided into 5 sequences of 94% isolates of Vibrio parahaemolyticus (ST type), clinical ST3 The advantage of sequence type (55/68), ST189 ST345 and other 4 kinds of ST type form a homologous complex CC345, ST189 and ST345 variant as a unit. An outbreak of diarrhea in Shenzhen area caused by the conclusion of Vibrio parahaemolyticus, the epidemic strains of ST type diversification, need to be wary of non mainstream type of ST may cause the outbreak of disease control.

【作者单位】： 深圳市福田区疾病预防控制中心;成都市食品药品检验研究院;
【基金】：深圳市福田区卫生公益性科研项目重点课题《关于不同来源的副溶血弧菌分子分型数据库的建立及评估》(FTWS2014005)
【分类号】：R440
【正文快照】： 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,简称VP)是一种嗜盐性细菌,广泛的存在于海水,生食水产品中,近几年由该菌引起的食物中毒及散发病例事件越来越多,已经成为广东省乃至全国感染性腹泻的首要病原[1-3]。2010-2014年广东省食源性疾病监测流行的副溶血性弧菌基本以血清型O3∶K6

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本文编号：1367994