新疆地区汉族和维吾尔族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多态性与单倍型的比较

发布时间：2018-01-11 09:28

  本文关键词：新疆地区汉族和维吾尔族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多态性与单倍型的比较　出处：《细胞与分子免疫学杂志》2016年04期 　论文类型：期刊论文

  更多相关文章： 白细胞分化抗原 基因多态性 单倍型

【摘要】：目的了解中国新疆维吾尔自治区汉族和维吾尔族人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)、HLA-DQB1、HLA-DPB1高分辨分型基础上的基因多态性和单倍型分布的特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序基因分型(PCR-SBT)法对新疆地区188例汉族人群与90例维吾尔族人群进行HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因分型,直接计数法计算基因频率,应用Arlequin3.5软件以最大似然法获得单倍型频率。结果汉族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*09∶01(12.8%)、DQB1*03∶01(20.3%)和DPB1*05∶01(33.5%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*09∶01-DQB1*03∶03(8.8%)、DRB1*09∶01-DPB1*05∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*05∶01(9.6%)和DRB1*09∶01-DQB1*03∶03-DPB1*05∶01(6.3%)。维吾尔族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*07∶01(18.3%)、DQB1*03∶01(18.9%)和DPB1*04∶01(30.0%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*07∶01-DQB1*02∶02(16.1%)、DRB1*07∶01-DPB1*04∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*04∶01(7.3%)、DRB1*07∶01-DQB1*02∶02-DPB1*04∶01(7.4%)。两组人群中等位基因有显著差异的是∶DRB1*04∶04、DRB1*07∶01、DRB1*08∶03、DRB1*11∶04、DRB1*12∶02、DRB1*13∶01、DRB1*15∶01、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01、DPB1*04∶01和DPB1*05∶01。结论中国新疆汉族与维吾尔族人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1等位基因频率、单倍型频率分布均有自己的多态性特征。
[Abstract]:Objective to investigate the HLA-DQB1 HLA-DQB1 of human leukocyte antigen (DRB1) of the Han and Uygur nationalities in Xinjiang Uygur Autonomous region of China. The characteristics of polymorphism and haplotype distribution on the basis of HLA-DPB1 high resolution typing. Methods PCR-SBT was applied to genotyping by polymerase chain reaction-direct sequencing. Methods HLA-DRB1 was performed in 188 Han and 90 Uygur populations in Xinjiang. HLA-DQB1 alleles of HLA-DPB1 were genotyped and the frequency of HLA-DPB1 was calculated by direct counting method. Arlequin3.5 software was used to obtain haplotype frequencies by maximum likelihood method. Results the most frequent HLA-II genes in Han population were DRB1 / 09: 01 / 12.8). DQB1 03: 01: 20.3) and DPB105: 013.5. The highest frequency of haplotype was DRB1: 09: 01-DQB1 03: 038.8. DRB1 09: 01-DPB105: 015.0. DQB1: 01-DPB1: 05: 01-09.6) and DRB109-0901-DQB103: 03-DPB1-01-01-01-6.3). The most frequent HLA-II genes in Uygur population were DRB1: 07: 01. 3). DQB1: 03: 0118.9) and DPB1 / 04: 01 / 00.0. The highest frequency of haplotype was DRB1: 07: 01-DQB1: 02: 02: 16.1). DRB1 / 07: 01-DPB1 / 04: 01 / 05.0and DQB103: 01-DPB1 / 04: 01 / 07.3. DRB1 / 07: 01-DQB1 / 02: 02-DPB1 / 04: 017.4The allele of the two groups was significantly different from that of DRB1 / 04: 04: 04. DRB1 / 07: 01DRB1 / 08: 03DRB1 / 11: 04DRB1 / 12: 02DRB1 / 13: 01DRB1 / 1501. DQB1: 02: 02DQB1: 06: 01DPB1: 01 and DPB1 / 05: 01.Conclusion HLA-DRB1 of Han and Uygur populations in Xinjiang, China. The allele frequencies and haplotypes of HLA-DQB1 alleles had their own polymorphism characteristics.
【作者单位】： 石河子大学新疆地方病与民族高发病教育部重点实验室;石河子大学医学院第一附属医院感染性疾病科;
【基金】：国家自然科学基金(81160001)
【分类号】：R440
【正文快照】： 新疆维吾尔自治区(简称新疆)位于我国西北边陲,居住有汉族、维吾尔族、哈萨克族等47个民族,主要以汉族(40.1%)、维吾尔族(45.8%)人口最多[1]。维吾尔族世代居住在新疆,有自己独特的生活习惯和明显的面部、体格特征,因强烈的宗教信仰鲜有与外族通婚,其基因保守性好;新疆汉族是

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 梅善宗,朱承美;HLA单倍型传递概率简便计算法[J];中国法医学杂志;1996年04期

2 谢毓滨;王赤林;彭骅;李双;谢毓湘;;湖南地区人群HLA单倍型的多态性研究[J];临床输血与检验;2006年02期

3 潘尚领;陈晶;尹瑞兴;刘承武;黄龄瑾;陈文成;罗晓秋;陈进超;黄必冠;罗毅;;线粒体DNA单倍型与广西壮族自治区巴马地区长寿的关联[J];中华老年医学杂志;2006年05期

4 朱文圣;郭建华;;基于单倍型的复杂疾病基因定位研究[J];数理统计与管理;2009年02期

5 陈芳琦,赵修竹;HLA扩展单倍型及其生物学意义[J];上海免疫学杂志;1992年02期

6 ;人补体第4成分基因在各种HLA单倍型上的结构特点及其规律性[J];同济医科大学学报;1995年03期

7 陈兴国,孔繁华,张蕊芳,金荔;我国藏族人群补体第四成分单倍型的分布分析[J];中国免疫学杂志;1996年01期

8 曾洁,王憬惺,孙水仙,陈强,米新玉,陈雪黎,宋宁,姚志强;四川造血干细胞捐献者资料库HLA-A,B,DRB1基因和单倍型研究[J];中国输血杂志;2005年05期

9 阎淑清;人类苯丙氨酸羟化酶位点的多态DNA单倍型及其与苯丙酮尿症的关系[J];国外医学.遗传学分册;1988年03期

10 黄飞;白种人中D(C)(e)单倍型的分子背景[J];国外医学.输血及血液学分册;2002年04期

相关会议论文 前10条

1 谢毓滨;王赤林;彭骅;李双;谢毓湘;;湖南地区人群HLA单倍型多态性的研究[A];中国输血协会第四届输血大会论文集[C];2006年

2 刘立波;赵桂苹;文杰;陈继兰;郑麦青;;鸡MHC B-L基因SNPs单倍型与免疫性状关系的研究[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年

3 赵书民;缪晓辉;徐文胜;谈顺良;;HLA-A*0207-B*4601单倍型与HBV持续感染相关[A];中华医学会第十二次全国病毒性肝炎及肝病学术会议论文汇编[C];2005年

4 陈争;张永科;范安;张亚男;吴艳平;赵倩君;周璨林;毛新民;藏玉亮;叶尔哈孜;哈森别克;爱哈布德力;卡马力亚;梁玲;古力努尔;马月辉;饶绍奇;;γ染色体单倍型群频率分布揭示新疆阿勒泰地区图瓦人的种族起源[A];中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编（2004-2008）[C];2008年

5 史磊;史荔;姚宇峰;褚嘉yP;;广西壮族HLA基因多态性及单倍型研究[A];第八次全国医学遗传学学术会议(中华医学会2009年医学遗传学年会)论文摘要汇编[C];2009年

6 侯旭敏;范维琥;;β_2肾上腺能受体基因单倍型与心力衰竭的关系[A];中华医学会心血管病分会第八次全国心血管病学术会议汇编[C];2004年

7 孙昌;张亚平;;海南黎族人群线粒体DNA序列多态分析[A];中国遗传学会七届一次青年研讨会暨上海高校模式生物E——研究院第一届模式生物学术研讨会论文汇编[C];2005年

8 韩凌霞;肖兵兵;牛成明;韩建林;司昌德;曲连东;;中国MHC特异单倍型SPF鸡群的建立[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年

9 周敏;夏梦娜;张细权;;cVIPR-1基因2个位点单核苷酸多态性与产蛋量的相关分析[A];第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2006年

10 孔庆鹏;姚永刚;孙昌;Hans-Ju rgen Bandelt;朱春龄;张亚平;;基于全序列的东亚人群mtDNA系统发育及汉族人群的遗传分化研究[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年

相关重要报纸文章 前8条

1 钟艳宇 记者 吴红月;亲缘间单倍型移植有了“优化选择法则”[N];科技日报;2014年

2 蔺玉红;单倍型移植治疗再障性贫血获成功[N];光明日报;2007年

3 闫煈;单倍型移植治疗重症再障[N];健康报;2007年

4 本报记者 余戈;狗的老家在中国[N];北京科技报;2004年

5 覃宏武;你了解单倍型移植吗？[N];中国妇女报;2006年

6 记者 姜澎;长寿取决于基因开关？[N];文汇报;2009年

7 苏晓;香港研究人员取得新突破[N];人民日报海外版;2003年

8 记者 吴佩;我国率先绘制出谷子基因组单倍型图谱[N];农民日报;2013年

相关博士学位论文 前5条

1 丁克越;不同单倍型块定义在单倍型块结构推断与htSNPs选择中的效应[D];中国协和医科大学;2004年

2 李红杰;中国北方古代人群Y染色体遗传多样性研究[D];吉林大学;2012年

3 付玉芹;内蒙古中南部古代人群的分子遗传学研究[D];吉林大学;2006年

4 谢承志;新疆塔里木盆地周边地区古代人群及山西虞弘墓主人DNA分析[D];吉林大学;2007年

5 洪坤学;中国四个民族HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因多态性研究[D];中国协和医科大学;1999年

相关硕士学位论文 前10条

1 曾真;基于cpDNA单倍型的银杏群体遗传与谱系分析[D];浙江大学;2008年

2 毛伟高;遗传印记效应检验及基于单倍型推断Hardy-Weinberg平衡律检验的统计方法研究[D];南方医科大学;2013年

3 成峰;广东东莞汉族mtDNA遗传多态性的研究[D];暨南大学;2007年

4 范积敏;中国南北方人群HLA-DQA1和DQB1基因多态性研究[D];南昌大学;2013年

5 赵红;对含有缺失基因型数据的家系进行单倍型推断的EM方法[D];东北师范大学;2006年

6 陈雪;广西壮族与海南黎族人群线粒体DNA群体遗传关系的研究[D];南方医科大学;2011年

7 崔望;基于Hi-C数据的单倍型三维空间结构及功能分析[D];华中农业大学;2015年

8 王洪志;不同鸡MHC单倍型的判定及同种异型抗血清的制备[D];扬州大学;2015年

9 刘婧;基于函数变换下的基因组关联研究[D];黑龙江大学;2008年

10 刘雪香;中国南北方2个汉族人群MICB基因和中国大陆4个人群HLA-E基因群体遗传学研究[D];中南大学;2012年

，

本文编号：1408997