中国临床多中心近平滑念珠菌流行病学、耐药性及唑类药物耐药机制研究

发布时间：2018-04-19 20:36

本文选题：近平滑念珠菌 + 鉴定　；参考：《北京协和医学院》2015年博士论文

【摘要】：[目的]评估中国医院侵袭性真菌监测网(CHIF-NET)10和11收集的近平滑念珠菌复合体原始鉴定和质谱鉴定结果：分析CHIF-NET 10和11血流分离的近平滑念珠菌的流行病学特点；分析近平滑念珠菌复合体体外药物敏感性并探索其对于唑类药物的耐药机制。[方法]经中心实验室分子生物学方法复核鉴定确认,CHIF-NET10和11从全国22家医院共收集到近平滑念珠菌复合体352株,包括C. parapsilosis sensu stricto 305株,C.metapsilosis 36株,C. orthopsilosis 11株,主要来源于血流、无菌体液等高质量标本。以复核鉴定结果为金标准,评价各单位原始常规方法鉴定结果,并评估Bruker MS和Vitek MS基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对近平滑念珠菌复合体的鉴定性能。采用微卫星分型对CHIF-NET 10和11血流分离的151株非重复近平滑念珠菌进行流行病学研究。采用已得到国际专家认可的YeastOne匕色微量肉汤稀释法测定352株近平滑念珠菌复合体对9种抗真菌药物的最小抑菌浓度(MIC)。对遗传背景一致的4株氟康唑敏感和耐药的C. parapsilosis sensu stricto进行全基因组测序和基因表达水平研究,探索唑类耐药机制。[结果]通过对22家医院分离的近平滑念珠菌进行临床信息分析,发现近平滑念珠菌分离于综合ICU、外科ICU和干部病房的比例较高；主要感染老年患者,年龄中位数是59岁,16%的患者大于80岁,并且这些患者的主要特点是有导管或接受胃肠营养,考虑为引起定植或感染的主要危险因素。与分子生物学鉴定结果相比,C. parapsilosis sensu stricto的各医院原始鉴定准确率为90.8%,9.2%的菌株被API 20C或Vitek 2错误鉴定为光滑念珠菌、季也蒙念珠菌等；常规方法无法鉴定C. metapsilosis和C. orthopsilosis。Bruker MS和Vitek MS对305株C. parapsilosis sensu stricto鉴定准确率分别达到了98.4%和97.7%。Bruker Biotyper3.0数据库中有C. metapsilosis和C. orthopsilosis参考图谱,但鉴定准确率仅分别为33.3%和27.3%; Vitek MS v2.0没有这两种菌的参考图谱而无法鉴定。使用微卫星分型方法对151株血流分离的非重复分离的近平滑念珠菌进行分型,共分为106个型别且散在分布,但在四川和北京的两家三甲医院病房内发现了菌株传播现象。而在天津一家三甲医院发生了C. parapsilosis sensu stricto的暴发事件,波及3个病房的91位患者。使用Sensititre YeastOne比色微量稀释试验测定体外药物敏感性,C. parapsilosis sensu stricto对氟康唑和伏立康唑的敏感性分别为93.8%和97.0%,C. metapsilosis和C. orthopsilosis对氟康唑和伏立康唑全部敏感；对伊曲康唑和泊沙康唑的MIC50和MIC90与国外的报道基本一致：近平滑念珠菌复合体对棘自菌素类药物均敏感,但MIC50和MIC90值整体高于其他念珠菌。对遗传背景一致的氟康唑敏感和耐药的配对菌株进行比较基因组学研究,筛选出耐药相关基因MRR1, MRR1基因发生突变(T2957C)引起MRRl和MDRl基因的高表达,进而引起唑类耐药。[结论]我们首次在国内评估了Bruker MS和Vitek MS鉴定近平滑念珠菌复合体的性能,证明二者对于C. parapsilosis sensu stricto的鉴定准确率很高。首次对全国多中心收集的近平滑念珠菌利用微卫星分型进行分子流行病学研究,证明在我国存在近平滑念珠菌传播流行甚至暴发,研究数据对近平滑念珠菌院内感染控制制定相关政策提供了理论依据。全国首家医院通过国际认可的药敏板YeastOne检测到存在唑类耐药的近平滑念珠菌,并通过比较基因组学筛选近平滑念珠菌耐药相关基因,并且找到了耐药相关基因MRR1,并首次在临床菌株中发现MDR1的高表达是导致近平滑念珠菌对唑类药物耐药的重要原因,但完整的耐药机制阐述还有待于进一步的研究。
[Abstract]:Objective To evaluate the primary identification and mass spectrum identification of Candida albicans complex collected by invasive fungal monitoring network ( CHIF - NET ) 10 and 11 in China Hospital : the epidemiological characteristics of Candida albicans isolated from CHIF - NET 10 and 11 were analyzed .
In order to evaluate the drug resistance of Candida parapsilosis complex in vitro and to explore its mechanism of resistance to azole drugs .
In the elderly patients , the median age was 59 years , 16 % were more than 80 years old , and the main characteristics of these patients were catheters or gastrointestinal nutrition , which were considered as the major risk factors for colonization or infection .
The results showed that the sensitivity of the isolates were 93 . 8 % and 97 . 0 % , respectively .
The MIC50 and MIC90 of Itraconazole and posaconazole were basically consistent with those reported abroad . The results showed that the resistance - related genes MRR1 , MRR1 gene mutation ( T2957C ) were higher than other Candida spp .

【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R446.5

【共引文献】