西藏部分地区12株藏族人群C/D重组型乙型肝炎病毒全基因序列分析

发布时间：2021-01-26 08:16

　　为了解藏族人群中流行的乙型肝炎病毒（HBV）基因型及基因重组状况,收集藏族人群HBsAg阳性样本,提取HBV DNA并用巢氏PCR的方法扩增HBV全长序列,测序后用DNAstar软件拼接全基因序列,进一步利用MEGA6和Simplot软件进行序列同源性和系统进化分析。应用该方法获得12株藏族人群HBV全基因序列,分析结果显示12株样本为C/D重组型,其中9株样本的重组位点位于nt750,3株样本的重组位点位于nt 1526,以此可分为两种重组方式,分别命名为C/Da和C/Db;从总体序列同源性来分析12株样本均属于C基因型,且与现有的C1-C15亚型的核苷酸差异均大于4%,与C1亚型最为接近。从地理分布来看,C/Da来自西藏中部和北部的拉萨市、阿里和林芝地区,C/Db均来自西藏南部的山南地区,提示两种重组型C/Da和C/Db在西藏地区的地理分布具有一定规律。研究结果可为西藏地区特殊HBV基因重组、基因特征分析、病毒进化研究以及当地乙肝防控提供参考。 

【文章来源】：病毒学报. 2016,32(02)北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
材料与方法
    1样本来源
    2核酸提取
    3 PCR扩增HBV全基因组
    4 序列分析
结果
    1 概况
    2 核苷酸序列同源性和系统发育分析
    3 基因重组分析
    4 不同亚型的核苷酸差异分析
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定[J]. 潘登,周彬,杨洁,侯金林.  南方医科大学学报. 2014(10)
[2]Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes:Revised classification hurdles and updated resolutions[J]. Mahmoud Reza Pourkarim,Samad Amini-Bavil-Olyaee,Fuat Kurbanov,Marc Van Ranst,Frank Tacke.  World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
[3]一株重组乙型肝炎病毒的全基因克隆和序列分析[J]. 边涛,沈立萍,王峰,王岳,张丽文,张勇,毕胜利.  病毒学报. 2008(04)
[4]HBV基因型研究进展[J]. 刘旭锦,王凯,范玉琛.  中华实验和临床病毒学杂志. 2007(04)
[5]我国藏族居民乙型肝炎病毒基因型的初步研究[J]. 徐烟青,周永东,毕胜利.  中华实验和临床病毒学杂志. 2005(02)
[6]汉藏傣瑶维蒙黎族人群乙型肝炎病毒感染调查[J]. 骆抗先,何超,何海棠,苏振家,唐荣西,郑世可,曾家植,谢志勤,郝新保,卢桥生,梁炽森.  中华流行病学杂志. 1993 (05)



本文编号：3000781