CRISPR/Cas系统间隔序列同源质粒耐药信息与志贺菌耐药的关系

发布时间：2021-01-30 19:16

　　目的比较志贺菌耐药信息与其spacer同源质粒或噬菌体耐药信息的关系。方法应用CRISPR Target和BLAST寻找spacer同源质粒和噬菌体,根据登记号在NCBI或GenBank中寻找目标质粒或噬菌体上的耐药信息;应用Bioedit软件寻找GenBank中志贺菌的的耐药信息。结果数据库及临床分离株志贺菌共52条spacer中有7个spacer与4个携带耐药基因的质粒同源;间隔序列CRISPR2-mel-3同源质粒pUMNF18_IncFV及携带该间隔序列的志贺菌mel-ss1998011/zz、mel-ss1998024/zz、mel-sf2005082/sx、mel-sf2013004/bj均含有相同耐药基因blaTEM、aadA2和dfrA12,间隔序列CRISPR-Q1-S1、CRISPR-Q4-S1同源的质粒pM5A24P及该间隔序列所在志贺菌sd1012均携带耐药基因ampC和tetB;间隔序列CRISPR3-mel-33同源质粒plasmid:5与该间隔序列所在志贺菌mel-sf2000102/zz均携带相同耐药基因ampH、mrdA,且二者均携... 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2016,11(10)北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
材料与方法
    1 材料
        1.1 Spacer来源
        1.2 耐药基因
        1.3 生物信息学软件和网络服务器
    2 方法
        2.1 志贺菌及同源序列噬菌体和质粒相关信息的获取
        2.2志贺菌毒力基因扩增
            2.1.1 引物设计与合成
            2.1.2 PCR扩增毒力基因
结果
    1 spacer同源质粒及其所在菌株信息
    2耐药基因信息
    3 耐药相关信息
    4 其他相关信息
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]天津地区福氏志贺菌整合子携带及耐药性研究[J]. 王俊,祁伟,王淑香,郭文学.  中国病原生物学杂志. 2014(02)

硕士论文
[1]CRISPR/Cas系统与志贺菌耐药的关系[D]. 王琳琳.郑州大学 2015
[2]粪肠球菌可移动元件介导的耐药性与CRISPR的关系探索[D]. 蒋伟.湖南农业大学 2012



本文编号：3009442