基于光微流激光的DNA-HRM分析及应用
发布时间:2024-03-31 20:25
基因是决定生物性状的根本性因素,基因片段中的DNA通过转录翻译等过程从而控制生物性状的表达,DNA中的碱基序列发生变异会导致非常严重的后果。研究表明许多可遗传疾病都与DNA序列中的单碱基变异有着直接关系,因此从DNA层面检测DNA序列中是否存在碱基变异可以更快、更及时、更准确地检查出一些疾病。本课题主要以法布里-珀罗(FP)腔为检测基础,分析研究基于高品质因子光微流激光腔的高分辨率熔解曲线(HRM),本文工作中主要分析了三种类型的DNA,分别是:(1)99个碱基对和两种GC含量的130个碱基对的单碱基破坏型DNA序列:(2)四种单核苷酸多态性(SNP)变异DNA以及与实际疾病有关的三种SNP变异DNA;(3)富含G碱基的单链DNA。具体如下:1.理论分析并模拟了基于光微流激光的DNA-HRM,分析基于激光的HRM与基于荧光的HRM异同。随后通过实验分析研究了99个碱基对以及两种类型的130个碱基对的DNA序列,实验结果表明99个碱基对的DNA序列,完全配对(Target)与其单碱基错配(Mismatch)DNA之间的裂解温差为0.9至1℃,而对于130个碱基DNA(Type I)为0....
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:3944455
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图1-1DNA的双螺旋结构以及自组装原理
图1-1DNA的双螺旋结构以及自组装原理Fig.1-1DNAdoublehelixstructureandself-assemblyprincip重要的性质是DNA分子是双螺旋结构,每个螺旋碱基距离为0.34nm,一个螺旋中含有10个碱基对计依据。第三....
图2-1(a)HRM原理图(b)激光替代了荧光被用作传感信号
U为腔内的总能量,ωc为谐振频率。精细度F表示腔本身的细锐程度:F=(2-4)FSR表示自由光谱的范围,Dn为半高宽,F越大,谐振波的波峰越尖锐。2.3HRM原理介绍HRM是DNA与染料相结合时产生的荧光作为传感信息,因为不同DNA对染....
图2-2(a-c)展示了计算得到的不同样品Target和MismatchDNA激光阈值与温度
太原理工大学硕士学位论文4基于光微流激光的DNA-HRM的理论计算接下来用上述公式模拟第三章使用的99个碱基对以及130个碱基对的DNA样品。先计算可得三种样品DNA的焓熵值如下表所示:表2-2样品DNA的焓熵值Table2-2enthalpy&....
图2-2(a-c)理论计算不同样品的激光阈值Ith与温度的函数关系图
142-2(a-c)理论计算不同样品的激光阈值Ith与温度的函数关系图。(d-f)对应的激光输出与度的关系。Fig.2-2(ac)Theoreticallycalculatedlaserthreshold,Ith,asafunctionoftemp....
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