水溶液中氨基酸侧链对G∶C碱基对间氢键影响的理论研究
发布时间:2017-10-29 05:25
本文关键词:水溶液中氨基酸侧链对G∶C碱基对间氢键影响的理论研究
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【摘要】:利用量子化学方法研究了气相和水溶液下,氨基酸侧链与鸟嘌呤和胞嘧啶间的氢键作用.应用B3LYP/6-31+G(d,p)方法优化复合物几何结构,使用MP2/aug-cc-p VDZ方法进行复合物能量、自然键轨道(NBO)电荷和二阶稳定化能的计算.结果表明,水溶液可使氨基酸侧链与碱基或碱基对之间氢键键能显著减小;带电复合物气相和水溶液氢键键能之差范围为50.63~146.48 k J/mol,中性为0.17~24.94 k J/mol;电荷的转移量与氢键键能成正比,电荷转移量越多,复合物越稳定;二阶稳定化能与氢键键长成反比,与电荷转移量成正比,且气相与水溶液氢键二阶稳定化能之比约为两相的电荷转移量之比.水溶液对该类体系中氢键作用具有明显影响.
【作者单位】: 辽宁师范大学化学化工学院;
【关键词】: 氨基酸侧链 鸟嘌呤 胞嘧啶 氢键 自然键轨道电荷
【基金】:国家自然科学基金重点项目(批准号:21133005;21473083) 辽宁省教育厅一般项目(批准号:L2014426) 辽宁师范大学实验室开放项目(批准号:cx20160111)资助~~
【分类号】:O641.3
【正文快照】: 蛋白质和DNA作为生命体中两种重要的物质,前者参与了生命活动的所有进程,如催化细胞中各类化学反应的酶,多数具有催化功能的酶常作为改变DNA结构的工具[1,2],后者具有携带和传递遗传信息的功能.蛋白质-核酸的相互作用极大地影响着许多细胞过程,如在细胞的生长和分裂过程中为了
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,本文编号:1111615
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