咖啡酸与小牛胸腺DNA的相互作用

发布时间：2018-05-08 10:26

  本文选题：咖啡酸 + 小牛胸腺DNA　； 参考：《南昌大学学报(理科版)》2017年04期

【摘要】：在生理酸度条件下(pH 7.4),运用紫外-可见吸收光谱、多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCR-ALS)、圆二色谱(CD)、傅立叶红外光谱(FT-IR)并结合分子模拟,研究了咖啡酸(CA)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。实验结果表明,CA与ctDNA的结合未引起ctDNA的熔点和粘度产生明显变化,NaCl浓度的增加,对CA-ctDNA体系紫外吸光度无明显影响,且单链DNA与CA的结合常数大于双链DNA,表明二者是以沟槽方式结合。计算出的热力学参数表明,疏水作用是CA与ctDNA相互作用的主要驱动力。FT-IR和分子模拟结果显示,CA主要与胸腺嘧啶(T碱基)结合。CD光谱分析结果表明,CA诱导ctDNA构象发生由B型向A型转变。
[Abstract]:The interaction between caffeic acid (CA) and calf thymus DNA (ctDNA) was studied under physiological acidity condition by UV-Vis absorption spectrum, multivariate curve resolution, alternating least square method (MCR-ALS), circular dichroism (CD), Fourier infrared spectroscopy (FTIR) and molecular simulation. The experimental results showed that the combination of CA and ctDNA did not cause obvious changes in the melting point and viscosity of ctDNA, but had no obvious effect on the UV absorbance of CA-ctDNA system. The binding constant of single strand DNA and CA was higher than that of double strand DNA, which indicated that the binding between single strand DNA and CA was grooved. The calculated thermodynamic parameters show that, Hydrophobic interaction is the main driving force for the interaction between CA and ctDNA. FT-IR and molecular simulation results show that CA mainly binds to thymidine T base. The results of CD spectra show that CA induces the conformation of ctDNA from type B to type A.
【作者单位】： 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(3146042,221167013) 江西省自然科学基金项目(20143ACB20006,20171BAB204029) 食品科学与技术国家重点实验室目标导向课题(SKLF-ZZA-201612)
【分类号】：O641.3

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本文编号：1861029