丝氨酸构象异构化机理的密度泛函理论研究
发布时间:2021-04-09 00:23
采用M06/6-31++G**方法研究了丝氨酸构象异构化机理,得到15种丝氨酸稳定构象和15个过渡态。构象间可以通过分子内化学键的旋转相互转化,氨基旋转的能垒低于10.16 kJ?mol-1;C-C键旋转的能垒低于23.31 kJ?mol-1,侧链羟基旋转的能垒低于24.13 kJ?mol-1,羧羟基的旋转能垒在39.68~54.80 kJ?mol-1之间。最稳定构象A转化为次稳定构象B的路径为A→A-O→O→N-O→N→I-N→I→I-J→J→D-J→D→D-H→H→G-H→G→B-G→B,该路径的最高能垒为54.80 kJ?mol-1。
【文章来源】:唐山师范学院学报. 2020,42(06)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
丝氨酸构象及其转化途径
图1 丝氨酸构象及其转化途径C1-O1键的旋转导致J经由过渡态D-J转变为D,二面角ΦH1–O1–C1–O2相应地变化,由-0.6°到-97.7°再到176.5°,能量先升高49.72 k J?mol-1,再降低54.80 k J?mol-1。C3—C2键的旋转导致D经由D-H变为H,二面角ΦO3–C3–C2–C1由64.8°到123.1°再到103.9°,能量先升高23.31 k J?mol-1,再降低18.64 k J?mol-1。O3-C3键的旋转导致H经由过渡态G-H转变为G,二面角ΦH4–O3–C3–C2由-123.3°到3.4°再到179.6°,能量先升高14.87 k J?mol-1,再降低15.49 k J?mol-1。构象G通过C3-C2键的旋转经由B-G变为B,二面角ΦO3–C3–C2–C1由-179.3°到4.5°再到-63.3°,能量先升高7.49 k J?mol-1,再降低14.43 k J?mol-1。
本文编号:3126550
【文章来源】:唐山师范学院学报. 2020,42(06)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
丝氨酸构象及其转化途径
图1 丝氨酸构象及其转化途径C1-O1键的旋转导致J经由过渡态D-J转变为D,二面角ΦH1–O1–C1–O2相应地变化,由-0.6°到-97.7°再到176.5°,能量先升高49.72 k J?mol-1,再降低54.80 k J?mol-1。C3—C2键的旋转导致D经由D-H变为H,二面角ΦO3–C3–C2–C1由64.8°到123.1°再到103.9°,能量先升高23.31 k J?mol-1,再降低18.64 k J?mol-1。O3-C3键的旋转导致H经由过渡态G-H转变为G,二面角ΦH4–O3–C3–C2由-123.3°到3.4°再到179.6°,能量先升高14.87 k J?mol-1,再降低15.49 k J?mol-1。构象G通过C3-C2键的旋转经由B-G变为B,二面角ΦO3–C3–C2–C1由-179.3°到4.5°再到-63.3°,能量先升高7.49 k J?mol-1,再降低14.43 k J?mol-1。
本文编号:3126550
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