一个拓扑指数系列及其在化合物唯一性描述中的应用

发布时间：2021-07-19 21:02

　　拓扑指数主要应用于两个方面:构效关系研究;化学信息管理。其中化学信息管理要求拓扑指数具有高选择性,需要用含有大量化合物的数据集检验其唯一性。基于此前工作（如结构生成器）所产生的虚拟数据集,本论文中开展了拓扑指数的生成、唯一性验证和应用研究,具体如下:1.高选择性分子拓扑指数研究有时一个化合物可以采用不同的化学结构图来表示,对于化学家来说这些图是化学等价的,他们常常希望能用一个描述符表示这些结构。为了解决此问题,本论文基于3-EAID指数提出了一个高选择性分子拓扑指数—ATID（adjacent topology identification）。首先,采用两个虚拟数据集检验该指数的唯一性,未出现简并,即ATID具有高区分能力。这两个虚拟数据集是:1)含1-25个碳原子的6000多万个链烷烃异构体;2)含1-14个苯环的1900多万个苯环型化合物。然后,将ATID应用于实际数据库中重复结构的检索。结果显示,在含20多万个化学结构的NCI数据库中有13对等价化学结构;在含2000多万个结构的ZINC数据库中有8万多对等价化学结构。这些等价化学结构主要是由某个共轭体系或电荷分布不同所形成。2.... 

【文章来源】：河南大学河南省

【文章页数】：77 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

C7H16的穷举结果

2图 1-3 结构生成器的特点当分子比较简单时，化学家可以手动画出同分异构体，但是这种方法仅仅对小分子有效。随着碳原子数量增加，其同分异构体的数量迅速增加，就链烷烃 C20H42为例，其同分异构体数量已经达到 36 万多，显然，这已经不是人力所能解决的问题，而结构生成器为我们提供了一种可行的技术手段。目前的结构生成器是以中国科学院长春应化所所建立的结构解析系统ESESOC[17-18

图 1-5 化学键的分层示意图nce Matrix)的生成示分子中的每个原子，其中，Z 是原子δV= 4 - 2 = 2。CVM 矩阵的衍生，见公0,1,...,Vkd D 为 d 的原子集合；D 为 i 与分子中任意d Matrix)的生成）计算。 ;1,...,kmm nda d D 原子 i 距离为 d 和 d-1 的原子集合；分

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3291426