若干小分子对大分子构象影响的研究
发布时间：2023-11-12 15:17
溶液中的一些小分子例如尿素、盐离子和配体分子等对大分子特别是生物大分子的行为有着重要影响。富含鸟嘌呤碱基的DNA、RNA在盐离子或者小分子配体的作用下,可以折叠成为一种特殊的二级结构,称为G-四链体。这种结构在细胞复制过程中起到调节作用。另外,在添加剂(例如,尿素或者醇)的作用下,蛋白质变性并丧失其功能。在本论文中,我们主要使用分析型超速离心(AUC)中的沉降速率法(AUC-SV)和差示扫描量热法(DSC)研究了若干小分子对溶液中生物大分子构象的影响。本论文主要结果如下:1.人类端粒DNA片段(AGGG(TTAGGG)3,Tel22)可以在一些单价阳离子存在的情况下折叠成为G-四链体。这些阳离子可以通过非特异性和特异性相互作用分别与DNA的磷酸基团和鸟嘌呤的06结合。实验表明,当钾离子浓度高于10.0 μM时,Tel22在特异性相互作用的影响下开始逐渐折叠成为G-四链体,表现为标准沉降系数(s20.w)随钾离子浓度的增加而增大。然而,只有当体系中阳离子浓度大于1.0 mM时,非特异性相互作用才起作用。另外,钾离子合适的大小以及其较易脱水化的性质使得其比其它离子如锂离子、钠离子和铯离子更...
【文章页数】：127 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
符号说明
第1章 绪论
1.1 前言
1.2 G-四链体
1.2.1 DNA的特殊结构
1.2.2 G-四链体的形成与结构
1.2.3 G-四链体的功能
1.2.4 人类端粒与端粒G-四链体
1.3 蛋白质
1.3.1 蛋白质结构和功能
1.3.2 聚(N-异丙基丙烯酰胺)的相变研究
1.3.3 大豆蛋白
1.4 我们要解决的问题
参考文献
第2章 分析型超速离心
2.1 分析型超速离心机组成
2.1.1 离心机组件
2.1.2 检测系统
2.2 分析型超速离心原理
2.2.1 Svedberg方程
2.2.2 Lamm方程
2.3 沉降速度实验
2.3.1 数据获得
2.3.2 沉降系数(s)的确定
2.3.3 标准条件下的s
2.3.4 径向稀释效应
2.3.5 偏比容
参考文献
第3章 分析型超速离心研究碱金属离子对人类端粒DNA构象的影响
3.1 前言
3.2 实验部分
3.2.1 实验原料
3.2.2 实验仪器
3.3 结果与讨论
3.3.1 钾离子对Tel22构象的影响
3.3.2 不同碱金属离子对Tel22构象的影响
3.3.3 不同碱金属离子对Tel22分子量的影响
3.4 本章小结
参考文献
第4章 沉降速度法对TMPyP4和人类端粒G-四链体相互作用的研究
4.1 前言
4.2 实验部分
4.2.1 DNA溶液的制备
4.2.2 实验仪器
4.3 结果和讨论
4.3.1 TMPyP4与Tel22的结合
4.3.2 TMPyP4可以促进二聚体复合物的形成
4.3.3 TMPyP4/Tel22的结合形式对二聚体复合物形成的影响
4.4 本章小结
参考文献
第5章 尿素及其衍生物对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.1 前言
5.2 差示扫描量热法
5.3 尿素对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.3.1 实验原料
5.3.2 实验步骤
5.3.3 结果与讨论
5.4 甲基化尿素对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.4.1 实验原料
5.4.2 实验步骤
5.4.3 结果与讨论
5.5 本章小结
参考文献
第6章 分析型超速离心对11S球蛋白的研究
6.1 前言
6.2 实验部分
6.2.1 实验试剂
6.2.2 大豆蛋白11S的提取
6.2.3 ConA-琼脂糖4B的装柱
6.2.4 11S蛋白的提纯
6.2.5 电泳实验
6.2.6 分析型超速离心法
6.3 结果与讨论
6.3.1 溶解条件对大豆蛋白提取的影响
6.3.2 还原剂2-ME对11S蛋白的影响
6.3.3 ConA-琼脂糖4B对11S粗产物的纯化
6.3.4 离子强度和pH对溶液中11S蛋白的影响
6.4 本章小结
参考文献
结论
致谢
在读期间已发表和拟发表的学术论文
本文编号：3863414
【文章页数】：127 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
符号说明
第1章 绪论
1.1 前言
1.2 G-四链体
1.2.1 DNA的特殊结构
1.2.2 G-四链体的形成与结构
1.2.3 G-四链体的功能
1.2.4 人类端粒与端粒G-四链体
1.3 蛋白质
1.3.1 蛋白质结构和功能
1.3.2 聚(N-异丙基丙烯酰胺)的相变研究
1.3.3 大豆蛋白
1.4 我们要解决的问题
参考文献
第2章 分析型超速离心
2.1 分析型超速离心机组成
2.1.1 离心机组件
2.1.2 检测系统
2.2 分析型超速离心原理
2.2.1 Svedberg方程
2.2.2 Lamm方程
2.3 沉降速度实验
2.3.1 数据获得
2.3.2 沉降系数(s)的确定
2.3.3 标准条件下的s
2.3.4 径向稀释效应
2.3.5 偏比容
参考文献
第3章 分析型超速离心研究碱金属离子对人类端粒DNA构象的影响
3.1 前言
3.2 实验部分
3.2.1 实验原料
3.2.2 实验仪器
3.3 结果与讨论
3.3.1 钾离子对Tel22构象的影响
3.3.2 不同碱金属离子对Tel22构象的影响
3.3.3 不同碱金属离子对Tel22分子量的影响
3.4 本章小结
参考文献
第4章 沉降速度法对TMPyP4和人类端粒G-四链体相互作用的研究
4.1 前言
4.2 实验部分
4.2.1 DNA溶液的制备
4.2.2 实验仪器
4.3 结果和讨论
4.3.1 TMPyP4与Tel22的结合
4.3.2 TMPyP4可以促进二聚体复合物的形成
4.3.3 TMPyP4/Tel22的结合形式对二聚体复合物形成的影响
4.4 本章小结
参考文献
第5章 尿素及其衍生物对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.1 前言
5.2 差示扫描量热法
5.3 尿素对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.3.1 实验原料
5.3.2 实验步骤
5.3.3 结果与讨论
5.4 甲基化尿素对聚(N-异丙基丙烯酰胺)相转变的影响
5.4.1 实验原料
5.4.2 实验步骤
5.4.3 结果与讨论
5.5 本章小结
参考文献
第6章 分析型超速离心对11S球蛋白的研究
6.1 前言
6.2 实验部分
6.2.1 实验试剂
6.2.2 大豆蛋白11S的提取
6.2.3 ConA-琼脂糖4B的装柱
6.2.4 11S蛋白的提纯
6.2.5 电泳实验
6.2.6 分析型超速离心法
6.3 结果与讨论
6.3.1 溶解条件对大豆蛋白提取的影响
6.3.2 还原剂2-ME对11S蛋白的影响
6.3.3 ConA-琼脂糖4B对11S粗产物的纯化
6.3.4 离子强度和pH对溶液中11S蛋白的影响
6.4 本章小结
参考文献
结论
致谢
在读期间已发表和拟发表的学术论文
本文编号：3863414
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