甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性
发布时间:2017-09-08 08:05
本文关键词:甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性
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【摘要】:系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中,与酰胺-Ⅰ带在气/液相中的频率差相关联,并引入酰胺-Ⅰ带简正模式随二级结构变化的规律,将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内,构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图,实现溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ带的快速准确预测。
【作者单位】: 福建师范大学化学与化工学院;福建省理论与计算化学重点实验室;
【关键词】: 甘氨酸二肽 酰胺-Ⅰ带 振动光谱 静电频率图
【基金】:国家自然科学基金(21103021) 福建省高校杰出青年科学人才培育计划(JA13063)资助项目~~
【分类号】:O621.13
【正文快照】: 1引言要发挥正常的物理、化学以及生物学功能,蛋白质需要通过大量氢键、范德华力和疏水作用等非共价相互作用来正确折叠形成一个特定构型。组织中特定蛋白质如果发生错误折叠,将会引起空间构象变化,进而发生自组装形成难溶的 纤维聚集体,引发如阿尔茨海默病、II型糖尿病、汉,
本文编号:812846
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