低温及激素对毛百合甘油-3-磷酸酰基转移酶（LpGPAT）基因表达的影响
发布时间：2021-12-19 04:58
低温胁迫是花卉栽培常见的一种灾害,是影响花卉生产质量的重要因素之一;同时,激素参与花卉生长发育以及低温、干旱、盐胁迫等非生物胁迫的响应机制,为花卉提供抗逆性。对花卉抗性的研究是科研服务于生产的需要,因此研究花卉的抗性机制,掌握低温胁迫及激素处理下基因表达变化规律,对于提高花卉的生产质量、选育抗性新品种等方面具有十分重要的意义。因此,耐冷性强,抗旱性强的毛百合（Lilium dauricum）,同时也是作为园林杂交育种的重要野生资源,探究其具体的抗性机制是十分必要的。在本课题组早期研究基础上,选取毛百合LpGPAT基因作为探究百合抗性机制的目的基因。本研究利用生物信息学分析对毛百合LpGPAT氨基酸序列9个其他物种的同源质体GPAT氨基酸序列及拟南芥中10个GPAT氨基酸序列进行系统发育进化树构建,对LpGPAT与同源GPAT进行氨基酸序列比对,分析蛋白在保守结构域的差异,以此探究GPAT蛋白结构与功能的关系。运用实时荧光定量技术分析在低温和不同激素（50μM脱落酸、100μM水杨酸、50μM乙烯利、10μM茉莉酸甲酯）诱导下,LpGPAT基因在毛百合叶片的转录表达水平。同时根据LpGP...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
GPAT基因系统发育进化树（采用邻比法）
沈阳农业大学硕士学位论文15软件中进行序列比对，并利用Bio-linux系统meme-v4.12.0程序包运算获得11个GPAT蛋白的保守motof分布。结果表明：11个质体GPAT蛋白的氨基酸序列比较保守，同源性非常高，11个氨基酸序列比对的一致性高达60.64%，且都具有甘油3磷酸酰基转移酶家族保守结构域（BOXⅠ~BOXⅣ）（图2-2）。另外，在Bio-linux系统预测GPAT蛋白的保守motif中，一共鉴定了10个保守motif（motif1~10）。毛百合LpGPAT与同在一分支的凤梨GPAT相差一个motif6，11个GPAT蛋白都含有8个保守motif。由此可见质体GPAT进化上是保守的（图2-3）。图2-2质体GPAT蛋白氨基酸序列比对结果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein图2-3质体GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小结生物信息学分析发现毛百合LpGPAT基因及同源基因成员与拟南芥的质体GPAT（ATS1）在系统发育树中聚集在一起，与拟南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚类，BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ
沈阳农业大学硕士学位论文15软件中进行序列比对，并利用Bio-linux系统meme-v4.12.0程序包运算获得11个GPAT蛋白的保守motof分布。结果表明：11个质体GPAT蛋白的氨基酸序列比较保守，同源性非常高，11个氨基酸序列比对的一致性高达60.64%，且都具有甘油3磷酸酰基转移酶家族保守结构域（BOXⅠ~BOXⅣ）（图2-2）。另外，在Bio-linux系统预测GPAT蛋白的保守motif中，一共鉴定了10个保守motif（motif1~10）。毛百合LpGPAT与同在一分支的凤梨GPAT相差一个motif6，11个GPAT蛋白都含有8个保守motif。由此可见质体GPAT进化上是保守的（图2-3）。图2-2质体GPAT蛋白氨基酸序列比对结果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein图2-3质体GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小结生物信息学分析发现毛百合LpGPAT基因及同源基因成员与拟南芥的质体GPAT（ATS1）在系统发育树中聚集在一起，与拟南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚类，BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ
【参考文献】：
期刊论文
[1]外源水杨酸对低温胁迫下海滨雀稗抗寒生理特征的影响[J]. 张翔,杨勇,刘学勇,向佐湘. 草业学报. 2020(01)
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[4]油葵HaGPAT1基因的克隆及表达分析[J]. 卢天信,成丽颖,刘文豪,吕新华,孙黎. 西北植物学报. 2019(03)
[5]中国水仙DFR基因启动子的克隆及功能[J]. 姚红,周平,范雨昕,孙瑞琦,Muhammad Anwar,曾黎辉. 应用与环境生物学报. 2019(04)
[6]大豆油脂的合成途径及关键酶GPAT基因的研究进展[J]. 鲁中爽,刘思言,李广隆,王蕊,刘明明,么梦凡,关淑艳,姚丹. 广东农业科学. 2018(11)
[7]非生物胁迫对芍药属植物生长发育影响的研究进展[J]. 张夏燕,刘慧娜,苏江洪,陶俊,赵大球. 分子植物育种. 2018(15)
[8]甘油-3-磷酸酰基转移酶在植物脂质代谢、生长及逆境反应中的作用[J]. 陈文玲,张晴晴,唐韶华,龚伟,洪月云. 植物生理学报. 2018(05)
[9]花生甘油-3-磷酸酰基转移酶（GPAT）基因的克隆及表达分析[J]. 郝翠翠,梁成伟,石蕾,李昊远,陈明娜,潘丽娟,王通,王冕,禹山林,陈娜,迟晓元. 花生学报. 2018(01)
[10]植物应答非生物胁迫信号传导研究进展[J]. 刘铃,武小龙,诸葛强. 分子植物育种. 2018(02)
博士论文
[1]小麦抗逆相关转录因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 张丽娜.中国农业科学院 2014
硕士论文
[1]植物激素对新疆沙冬青肌醇半乳糖苷合成酶（AnGolS2）基因表达影响的研究[D]. 胡杨.沈阳农业大学 2019
[2]毛百合与松叶百合组培技术研究[D]. 汪娜.吉林农业大学 2013
[3]九种木兰科常绿植物低温冷害生理指标的测定及耐寒性评价[D]. 裴文.河南农业大学 2013
[4]低温胁迫下不同百合的抗寒生理研究[D]. 王玲丽.华中农业大学 2012
本文编号：3543806
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
GPAT基因系统发育进化树（采用邻比法）
沈阳农业大学硕士学位论文15软件中进行序列比对，并利用Bio-linux系统meme-v4.12.0程序包运算获得11个GPAT蛋白的保守motof分布。结果表明：11个质体GPAT蛋白的氨基酸序列比较保守，同源性非常高，11个氨基酸序列比对的一致性高达60.64%，且都具有甘油3磷酸酰基转移酶家族保守结构域（BOXⅠ~BOXⅣ）（图2-2）。另外，在Bio-linux系统预测GPAT蛋白的保守motif中，一共鉴定了10个保守motif（motif1~10）。毛百合LpGPAT与同在一分支的凤梨GPAT相差一个motif6，11个GPAT蛋白都含有8个保守motif。由此可见质体GPAT进化上是保守的（图2-3）。图2-2质体GPAT蛋白氨基酸序列比对结果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein图2-3质体GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小结生物信息学分析发现毛百合LpGPAT基因及同源基因成员与拟南芥的质体GPAT（ATS1）在系统发育树中聚集在一起，与拟南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚类，BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ
沈阳农业大学硕士学位论文15软件中进行序列比对，并利用Bio-linux系统meme-v4.12.0程序包运算获得11个GPAT蛋白的保守motof分布。结果表明：11个质体GPAT蛋白的氨基酸序列比较保守，同源性非常高，11个氨基酸序列比对的一致性高达60.64%，且都具有甘油3磷酸酰基转移酶家族保守结构域（BOXⅠ~BOXⅣ）（图2-2）。另外，在Bio-linux系统预测GPAT蛋白的保守motif中，一共鉴定了10个保守motif（motif1~10）。毛百合LpGPAT与同在一分支的凤梨GPAT相差一个motif6，11个GPAT蛋白都含有8个保守motif。由此可见质体GPAT进化上是保守的（图2-3）。图2-2质体GPAT蛋白氨基酸序列比对结果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein图2-3质体GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小结生物信息学分析发现毛百合LpGPAT基因及同源基因成员与拟南芥的质体GPAT（ATS1）在系统发育树中聚集在一起，与拟南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚类，BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ
【参考文献】：
期刊论文
[1]外源水杨酸对低温胁迫下海滨雀稗抗寒生理特征的影响[J]. 张翔,杨勇,刘学勇,向佐湘. 草业学报. 2020(01)
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[6]大豆油脂的合成途径及关键酶GPAT基因的研究进展[J]. 鲁中爽,刘思言,李广隆,王蕊,刘明明,么梦凡,关淑艳,姚丹. 广东农业科学. 2018(11)
[7]非生物胁迫对芍药属植物生长发育影响的研究进展[J]. 张夏燕,刘慧娜,苏江洪,陶俊,赵大球. 分子植物育种. 2018(15)
[8]甘油-3-磷酸酰基转移酶在植物脂质代谢、生长及逆境反应中的作用[J]. 陈文玲,张晴晴,唐韶华,龚伟,洪月云. 植物生理学报. 2018(05)
[9]花生甘油-3-磷酸酰基转移酶（GPAT）基因的克隆及表达分析[J]. 郝翠翠,梁成伟,石蕾,李昊远,陈明娜,潘丽娟,王通,王冕,禹山林,陈娜,迟晓元. 花生学报. 2018(01)
[10]植物应答非生物胁迫信号传导研究进展[J]. 刘铃,武小龙,诸葛强. 分子植物育种. 2018(02)
博士论文
[1]小麦抗逆相关转录因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 张丽娜.中国农业科学院 2014
硕士论文
[1]植物激素对新疆沙冬青肌醇半乳糖苷合成酶（AnGolS2）基因表达影响的研究[D]. 胡杨.沈阳农业大学 2019
[2]毛百合与松叶百合组培技术研究[D]. 汪娜.吉林农业大学 2013
[3]九种木兰科常绿植物低温冷害生理指标的测定及耐寒性评价[D]. 裴文.河南农业大学 2013
[4]低温胁迫下不同百合的抗寒生理研究[D]. 王玲丽.华中农业大学 2012
本文编号：3543806
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