焦磷酸测序技术对肠促胰素作用相关基因的SNP位点分型

发布时间：2021-12-23 07:37

　　目的探讨肠促胰素作用相关基因的5个单核苷酸多态性位点rs7903146、rs12617656、rs4664443、rs3765467、rs10423928与二肽基肽酶（DPP）-4抑制剂疗效的相关性。方法收集35例2型糖尿病（T2DM）患者的外周血样本,自行设计聚合酶链式反应（PCR）扩增引物和测序引物,优化扩增条件,应用焦磷酸测序仪进行测序和基因型分析。并使用Sanger测序法对临床样本进行二次验证,确保焦磷酸测序法的准确性。结果建立的PCR结合焦磷酸测序方法经Sanger测序验证,35例临床样本5个位点的基因分型结果完全一致。结论建立的PCR结合焦磷酸测序方法快速、准确、成本低,适用于后序研究中对肠促胰素作用相关基因的单核苷酸多态性（SNP）位点分型。 

【文章来源】：中国老年学杂志. 2020,40(16)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

2例患者5个SNP位点PCR产物凝胶电泳结果

对35例患者5个SNP位点的基因多态性进行了焦磷酸测序,检测信噪比高,非特异峰的比例均在 10%以内,多态位点基因型可清晰判断,检测成功率100%。为了验证方法的准确性,同时采用Sanger测序技术对上述患者的 5个 SNP位点进行测序,测序结果见图2～6,分型结果见表2。两种方法的基因分型结果完全一致,35例患者5个SNP位点的突变比例与已报道的文献结果相接近[5,8-10]。图3 rs10423928多态性典型测序

rs10423928多态性典型测序

【参考文献】：
期刊论文
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[3]高分辨率熔解曲线法在GLP1R基因多态性位点rs3765467检测中的应用[J]. 张远,何霞,钟磊,串俊兰,龙恩武.  中国药房. 2017(17)
[4]应用焦磷酸测序技术快速检测猪流感病毒金刚烷胺耐药性的分子标签[J]. 刘华雷,吕艳,黄伟坚,鄢明华,张维,李明义,王清华,李金明,郑东霞,赵云玲,孙承英,王志亮.  微生物学报. 2010(03)
[5]碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量[J]. 张晓丹,武海萍,陈之遥,周国华.  分析化学. 2009(08)

硕士论文
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[2]DPP-4基因多态性在中国2型糖尿病人群中的分布及其与血脂关系的研究[D]. 邢晓敏.山东大学 2015



本文编号：3548074