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蔗糖诱导马铃薯(S.tuberosum L.)试管薯形成的转录组分析与关键基因筛选

发布时间:2021-12-24 20:42
  马铃薯是世界四大粮食作物之一,随着我国马铃薯主粮化战略的启动,马铃薯在国家粮食安全中的作用也越发显著。马铃薯块茎既是食用器官又是繁殖器官,作为繁殖器官其质量直接影响马铃薯的产量和品质。由于无性繁殖的病毒性退化是影响马铃薯种薯质量的关键,因此,脱毒种薯生产技术研究一直是马铃薯种薯繁殖的重要领域。马铃薯试管薯是由脱毒苗在培养容器中形成的块茎生长发育而来,不仅不带病毒而且不带任何病原菌,因此,试管薯的应用成为近年来马铃薯种薯技术的热点。本实验室长期致力于试管薯发育机理和应用研究,前期已在试管薯形成的生理机制中进行了系统研究,近年又定位了一些与试管薯形成有关的QTL,同时针对光照的影响筛选出一些关键调控基因。但在试管薯诱导形成中,几乎所有的研究均显示需要较高浓度的蔗糖,但有关蔗糖调控试管薯形成的分子机理到目前还不清楚,其研究报道也十分有限。本研究利用本实验室建立的试管薯生产体系,从转录组分析入手,筛选分析高蔗糖浓度影响试管薯形成的差异表达基因,并通过不同基因型之间多种处理的实时定量表达分析,探索蔗糖诱导试管薯形成的关键基因,为解析蔗糖在试管薯形成过程中的作用机理奠定基础。主要研究结果如下:1.... 

【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:130 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

蔗糖诱导马铃薯(S.tuberosum L.)试管薯形成的转录组分析与关键基因筛选


马铃薯块茎形成事件发生顺序

流程图,测序,高通量,文库


24RNA-seq 高通量测序文库的制备及测ation of high-throughput sequencing DNase I 处理后,用带有 Oligo试剂将 mRNA 打断成短片段,ndom hexamers)合成一链 cDNA成 cDNA 第二链,经试剂盒纯化测序接头后,得到的片段进行大100 Bioanalyzer和ABI StepOnea 测序平台进行测序。

蔗糖诱导马铃薯(S.tuberosum L.)试管薯形成的转录组分析与关键基因筛选


生物信息分析流程

【参考文献】:
期刊论文
[1]从世界马铃薯产业发展谈中国马铃薯的主粮化[J]. 李文娟,秦军红,谷建苗,仇志军,周俊,谢开云,卢肖平.  中国食物与营养. 2015(07)
[2]基于高通量测序的数字基因表达谱技术研究进展[J]. 张渝,刘玉洁,郭丹妮,李惠敏,秦新民.  北方园艺. 2015(10)
[3]糖调控植物根系生长发育的研究进展[J]. 李慧敏,梁永书,南文斌,张汉马.  中国农学通报. 2015(14)
[4]高通量测序技术的发展及其在生命科学中的应用[J]. 杜玲,刘刚,陆健,刘丑生,哈福.  中国畜牧兽医. 2014(12)
[5]世界马铃薯生产发展基本态势及特点[J]. 刘洋,高明杰,何威明,张晴,罗其友.  中国农学通报. 2014(20)
[6]光周期诱导马铃薯块茎形成的分子机理研究进展[J]. 谢婷婷,柳俊.  中国农业科学. 2013(22)
[7]高通量测序技术在动植物研究领域中的应用[J]. 岳桂东,高强,罗龙海,王军一,许姣卉,尹烨.  中国科学:生命科学. 2012(02)
[8]马铃薯产业的现状与发展[J]. 谢从华.  华中农业大学学报(社会科学版). 2012(01)
[9]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才.  中国生物工程杂志. 2012(01)
[10]我国马铃薯产业技术研究现状及展望[J]. 柳俊.  中国农业科技导报. 2011(05)

博士论文
[1]马铃薯(Solanum tuberosum L.)试管块茎形成的QTL定位及遗传分析[D]. 周俊.华中农业大学 2014
[2]光诱导的马铃薯试管薯形成相关基因转录组分析[D]. 单建伟.华中农业大学 2013

硕士论文
[1]StPP2C和StABF对马铃薯块茎形成的影响[D]. 叶晖.华中农业大学 2014



本文编号:3551160

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