水稻Xa5和ROS1a基因在控制细菌性条斑病抗性中的作用分析
发布时间：2021-12-27 22:06
水稻细菌性条斑病（bacterial leaf streak,简称细条病或BLS）是一种由细菌（Xanthomonas oryzae pv.Oryzicole,Xoc）引起的检疫性病害。水稻细条病抗性属于数量性状。本实验室定位克隆了一个细条病抗性主效QTL（qBlsr5a）,发现其功能基因LOCOs05g01710就是白叶枯病抗性基因xa5,但关于该基因控制细条病抗性的分子机理还不清楚。另外,本实验室研究发现,水稻去甲基化酶基因OsROS1a和OsROS1c的表达对细条病病菌侵染具有明显响应,这暗示它们可能与细条病抗病有关,但还有待实验证明。本论文针对上述问题开展了研究。主要结果如下:（1）对Xa5-RNAi株系及其野生型对照明恢86进行细条病抗性鉴定,发现前者病斑长度显著小于后者,证明xa5确实是qBlsr5a的功能基因。（2）用RNA-Seq分析比较Xa5-RNAi植株和明恢86对细条病菌侵染（接种后9 h）的转录响应。在Xa5-RNAi植株和明恢86中分别检测到3115和157个差异表达基因,说明前者对细条病菌的响应要比后者强烈得多。GO分析表明:Xa5-R...
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Xa5干扰材料与对照明恢86病斑情况
图 2-2 样品总 RNA 电泳检测结果Fig.2-2 The result of agarose gel lectrophoresis of total RNA注：1-3：Xa5-RNAi 接种（XRI）; 4-6：Xa5-RNAi 模拟接种(XRM); 7-9：对照接种(WTI); 10-12：照模拟接种(WTM)。2.5 测序质量评估2.5.1 比对结果分析12个样品均获得五千万以上的读段，将测序数据与参考基因组进行比对，结果如表2-3所示，12个样品测序读段的匹配率均高于80%，并且所有样品中多匹配读段数（Multiple Mapped Reads or Fragments）的比例均低于4%（表2-3），该结果表明测序质量良好，满足后续分析的要求。表2-3 不同样品间的比对结果Table.2-3 The comparison result of the blast in different samples样本 Sample 总读段数Total reads比对率Overallalignmentrate未匹配读段数Unmapped单一匹配读段数Unique多个匹配读段数Multiple
不同样品的FPKM箱线图
【参考文献】：
期刊论文
[1]Identification and characterization of rice blast resistance gene Pid4 by a combination of transcriptomic profiling and genome analysis[J]. Zhixiong Chen,Wen Zhao,Xiaobo Zhu,Chengdong Zou,Junjie Yin,Mawsheng Chern,Xiaogang Zhou,Heng Ying,Xin Jiang,Yongzhen Li,Haicheng Liao,Mengping Cheng,Weitao Li,Min He,Jing Wang,Jichun Wang,Bingtian Ma,Jirui Wang,Shigui Li,Lihuang Zhu,Xuewei Chen. Journal of Genetics and Genomics. 2018(12)
[2]水稻白叶枯病和细条病稻兼抗资源筛选及兼抗基因分析[J]. 秦钢,阎勇,马增凤,陈远孟,秦媛媛,岑贞陆,罗同平,刘驰,张月雄,黄大辉. 西南农业学报. 2017(02)
[3]水稻纹枯病改良新抗源YSBR1的抗性评价[J]. 左示敏,王子斌,陈夕军,顾芳,张亚芳,陈宗祥,潘学彪. 作物学报. 2009(04)
[4]野生稻细菌性条斑病抗性资源筛选及遗传分析[J]. 黄大辉,岑贞陆,刘驰,贺文爱,陈英之,马增凤,杨朗,韦绍丽,刘亚利,黄思良,杨新庆,李容柏. 植物遗传资源学报. 2008(01)
[5]稻种材料抗细菌性条斑病性鉴定[J]. 岑贞陆,黄思良,李容柏,李卫民,覃丽萍,谢玲,胡春锦,李小勇,付岗. 安徽农业科学. 2007(22)
[6]水稻细条病抗性QTL qBlsr5a的验证和更精确定位[J]. 陈志伟,景艳军,李小辉,周元昌,刁志娟,李生平,吴为人. 福建农业大学学报. 2006(06)
[7]水稻第2染色体上细菌性条斑病抗性QTL的检测[J]. 郑景生,李义珍,方宣钧. 中国农业科学. 2005(09)
[8]水稻抗病育种研究进展[J]. 雷财林,凌忠专,王久林,万建民. 生物学通报. 2004(11)
[9]两个籼稻品种对水稻细菌性条斑病抗性遗传的研究[J]. 周明华,许志刚,粟寒,游泳,周毓珍. 南京农业大学学报. 1999(04)
[10]水稻细菌性条斑病的抗性遗传[J]. 唐定中,李维明,吴为人. 福建农业大学学报. 1998(02)
本文编号：3552822
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Xa5干扰材料与对照明恢86病斑情况
图 2-2 样品总 RNA 电泳检测结果Fig.2-2 The result of agarose gel lectrophoresis of total RNA注：1-3：Xa5-RNAi 接种（XRI）; 4-6：Xa5-RNAi 模拟接种(XRM); 7-9：对照接种(WTI); 10-12：照模拟接种(WTM)。2.5 测序质量评估2.5.1 比对结果分析12个样品均获得五千万以上的读段，将测序数据与参考基因组进行比对，结果如表2-3所示，12个样品测序读段的匹配率均高于80%，并且所有样品中多匹配读段数（Multiple Mapped Reads or Fragments）的比例均低于4%（表2-3），该结果表明测序质量良好，满足后续分析的要求。表2-3 不同样品间的比对结果Table.2-3 The comparison result of the blast in different samples样本 Sample 总读段数Total reads比对率Overallalignmentrate未匹配读段数Unmapped单一匹配读段数Unique多个匹配读段数Multiple
不同样品的FPKM箱线图
【参考文献】：
期刊论文
[1]Identification and characterization of rice blast resistance gene Pid4 by a combination of transcriptomic profiling and genome analysis[J]. Zhixiong Chen,Wen Zhao,Xiaobo Zhu,Chengdong Zou,Junjie Yin,Mawsheng Chern,Xiaogang Zhou,Heng Ying,Xin Jiang,Yongzhen Li,Haicheng Liao,Mengping Cheng,Weitao Li,Min He,Jing Wang,Jichun Wang,Bingtian Ma,Jirui Wang,Shigui Li,Lihuang Zhu,Xuewei Chen. Journal of Genetics and Genomics. 2018(12)
[2]水稻白叶枯病和细条病稻兼抗资源筛选及兼抗基因分析[J]. 秦钢,阎勇,马增凤,陈远孟,秦媛媛,岑贞陆,罗同平,刘驰,张月雄,黄大辉. 西南农业学报. 2017(02)
[3]水稻纹枯病改良新抗源YSBR1的抗性评价[J]. 左示敏,王子斌,陈夕军,顾芳,张亚芳,陈宗祥,潘学彪. 作物学报. 2009(04)
[4]野生稻细菌性条斑病抗性资源筛选及遗传分析[J]. 黄大辉,岑贞陆,刘驰,贺文爱,陈英之,马增凤,杨朗,韦绍丽,刘亚利,黄思良,杨新庆,李容柏. 植物遗传资源学报. 2008(01)
[5]稻种材料抗细菌性条斑病性鉴定[J]. 岑贞陆,黄思良,李容柏,李卫民,覃丽萍,谢玲,胡春锦,李小勇,付岗. 安徽农业科学. 2007(22)
[6]水稻细条病抗性QTL qBlsr5a的验证和更精确定位[J]. 陈志伟,景艳军,李小辉,周元昌,刁志娟,李生平,吴为人. 福建农业大学学报. 2006(06)
[7]水稻第2染色体上细菌性条斑病抗性QTL的检测[J]. 郑景生,李义珍,方宣钧. 中国农业科学. 2005(09)
[8]水稻抗病育种研究进展[J]. 雷财林,凌忠专,王久林,万建民. 生物学通报. 2004(11)
[9]两个籼稻品种对水稻细菌性条斑病抗性遗传的研究[J]. 周明华,许志刚,粟寒,游泳,周毓珍. 南京农业大学学报. 1999(04)
[10]水稻细菌性条斑病的抗性遗传[J]. 唐定中,李维明,吴为人. 福建农业大学学报. 1998(02)
本文编号：3552822
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3552822.html
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