产PSP微小亚历山大藻Alexandrium minutum共生菌多样性及产毒特性研究
发布时间:2022-01-23 04:07
有害赤潮及其引发的麻痹性贝类毒素(PSP)是全球性生态灾害及重大环境问题。典型赤潮甲藻微小亚历山大藻引发赤潮在我国东海海域发生频繁,并可产生麻痹性贝毒(PSP)在内的多种赤潮毒素。严重影响海产品安全,人误食了污染了 PSP的海产品会引发人体中毒甚至死亡。然而,PSP来源问题尚未明确是由其共生菌产生还是其宿主藻类产生。因此,只有对PSP来源和产生机制深入研究,才能实现对PSP的科学防控。藻菌关系为揭示藻共生菌在PSP的产生过程中发挥何种作用以及揭示PSP产生机制奠定了基础,而目前对此尚缺乏系统性研究。因甲藻基因组庞大,全基因组测序工作难以开展,而藻共生菌相比于产毒甲藻更易于培养,且基因组小的特性。因此从自产毒菌株角度研究PSP的来源和合成机制更易取得实质性突破。本文通过免培养的高通量测序方法首次解析了产PSP典型赤潮甲藻微小亚历山大藻(Alexandrium minutum,amtk-4)共生菌群的种类及相对丰度;借助微生物纯培养方法分离获得可培养共生菌株5株;通过微生物多相分类学方法对新种Z1-D进行了细菌分类学鉴定;基于全基因组功能基因比对及蛋白结构模拟,对其可培养菌株Z1-D PS...
【文章来源】:哈尔滨商业大学黑龙江省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-2?PSP来源的3种假说??Fig.?1-2?The?three?hypothesis?of?PSP?origin??1.1.6?PSP的合成机制??--
?(Alphaproteobacteria?)和芽孢杆菌纲(Bacilli)占绝对优势,比例分别为47.1?%和??36.9%。0-变形菌纲(Betaproteobacteria)?4.6%、y-变形菌纲(Gammaproteobacteria)??3.9%、纤维粘网菌纲(Cytophagia)?2.8%、浮霉菌纲(Phycisphaerae)?1.4%、黄杆菌纲??(Flavobacteriia)?1.3%和放线菌纲(Actinobacteria)?1.1%则比例较低。??属水平(见图2-3)共包含28个属,其中优势属(>?5%)为乳球菌属??(Lactococcus?),沟鞭藻玫瑰杆菌属(Z)/仙),玫瑰杆菌属??厢厂心),芽孢杆菌属(5gcz7/ws)及红细菌科未鉴定属??unclassfied),所占比例分别为25.5%、19.8%、8.6%、6.2%及6.1%。高通量测序样品??amtk4中共生细菌未能确定的属(种)比例高达59.7%,表明微小亚历山大藻(amtk-??4)具有发现特殊生境共生菌新属(种)的巨大潜力。??10??S?#??%?I?^?才??/?I?I?\??馨I?1??I??图2-2基于OTU的微小亚历山大藻(amtk-4)共生菌群系统发育进化树??Fig.2-2?Phylogenetic?tree?of?the?bacterial?community?associated?with?Alexandrium?minutum?(amtk-4)??based?on?OUT??-15-??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]东海产麻痹性贝毒链状亚历山大藻共附生菌群多样性研究[J]. 唐莹莹,乔玉宝,蒋志伟,张静,张若男,田晓清,马丽艳,张晓玲,陆亚男,樊成奇,杨桥. 海洋渔业. 2018(06)
[2]微小亚历山大藻(Alexandrium minutum)的氮磷吸收、生长、产毒动态变化[J]. 俞群娣,王亚军,余新威,刘寅政,李叶,方力,陈成吉,罗红宇. 海洋与湖沼. 2018(02)
[3]贝类生物毒素研究进展[J]. 阮雯,纪炜炜,岳冬冬,方海,刘勤,王鲁军,王芸,张晓峰,陆亚男. 渔业信息与战略. 2017(04)
[4]高通量测序在酱香白酒微生态多样性研究中的应用[J]. 郭敏,黄永光,邱树毅,胡建峰,胡峰,钟方达. 中国酿造. 2017(05)
[5]海水赤潮的危害及防治对策[J]. 张晓冉,庞雨宁. 河北渔业. 2017(04)
[6]纳米山药多糖合生元结肠靶向微生态调节剂对大鼠肠道菌群的影响[J]. 孟德欣,于莲,李雪欣,苏瑾,马淑霞,张涛,许月明. 中国新药杂志. 2016(23)
[7]休眠孢囊作为甲藻有害藻华年际频发和地理扩散一种关键机制的研究进展[J]. 唐赢中,胡章喜,邓蕴彦. 海洋科学集刊. 2016(00)
[8]我国近海有毒藻和藻毒素的研究现状与展望[J]. 于仁成,罗璇. 海洋科学集刊. 2016(00)
[9]产麻痹性贝毒塔玛亚历山大藻共培养菌群的物种多样性研究[J]. 刘巧红,苑丽东,田晓清,马丽艳,周宏农,樊成奇,杨宪时,杨桥,张晓玲. 海洋渔业. 2016(06)
[10]拟南芥转酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及与α-三联噻吩结合作用分析[J]. 赵斌,霍静倩,邢继红,齐萌,张金林,董金皋. 高等学校化学学报. 2015(04)
博士论文
[1]基于肠道菌群、代谢组学分析研究异常黑胆质型哮喘维西医结合治疗的临床疗效及其作用机理[D]. 玛丽叶古·阿吾提.新疆医科大学 2015
本文编号:3603565
【文章来源】:哈尔滨商业大学黑龙江省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-2?PSP来源的3种假说??Fig.?1-2?The?three?hypothesis?of?PSP?origin??1.1.6?PSP的合成机制??--
?(Alphaproteobacteria?)和芽孢杆菌纲(Bacilli)占绝对优势,比例分别为47.1?%和??36.9%。0-变形菌纲(Betaproteobacteria)?4.6%、y-变形菌纲(Gammaproteobacteria)??3.9%、纤维粘网菌纲(Cytophagia)?2.8%、浮霉菌纲(Phycisphaerae)?1.4%、黄杆菌纲??(Flavobacteriia)?1.3%和放线菌纲(Actinobacteria)?1.1%则比例较低。??属水平(见图2-3)共包含28个属,其中优势属(>?5%)为乳球菌属??(Lactococcus?),沟鞭藻玫瑰杆菌属(Z)/仙),玫瑰杆菌属??厢厂心),芽孢杆菌属(5gcz7/ws)及红细菌科未鉴定属??unclassfied),所占比例分别为25.5%、19.8%、8.6%、6.2%及6.1%。高通量测序样品??amtk4中共生细菌未能确定的属(种)比例高达59.7%,表明微小亚历山大藻(amtk-??4)具有发现特殊生境共生菌新属(种)的巨大潜力。??10??S?#??%?I?^?才??/?I?I?\??馨I?1??I??图2-2基于OTU的微小亚历山大藻(amtk-4)共生菌群系统发育进化树??Fig.2-2?Phylogenetic?tree?of?the?bacterial?community?associated?with?Alexandrium?minutum?(amtk-4)??based?on?OUT??-15-??
cter5/〇^^?a?Solibacillus?2%??■?Rhodobacteraceae??Unclassified?6%?—????"A?Pseudomonas?2%??m?Bacillus???W?mk^^ ̄mSM1A〇21%??〇ceanicauiis?i〇/〇??_?/?oseovan’ll?、?Henriciella?1%??■?Arthrobacter?1%??■?Dinoroseobacter?20°/^??\_?Lactococcus?25%??图2-3微小亚历山大藻(amtk-4)共生菌群的属水平分布图??Fig.2-3?Microbial?distribution?at?genus?level?of?the?symbiotic?bacterial?community?oi?Alexandrium??minutum{?imXk-A)??2.3.2可培养菌株16S?rRNA系统发育分析??从微小亚历山大藻(amtk4)培养物中分离获得可培养共生菌5株。其16SrRNA序??列与GenBank数据库同源性比对结果显示其分别属深海杆状菌属??sp.)、鼠尾菌属(Mi/r/cawA??sp.)、根瘤菌属謂sp.)、亚硫酸杆菌属??sp.)及微杆菌属(Mc<9心cMr/麵sp.)?5个属,其中菌株Z1-D及Z1-4??与己有模式菌株16S?rRNA基因特异性最高值分别为97.8%及97.3%,其16S?rRNA基因??的邻接法(Neighbor-Joining)系统发育树见图4,鉴定其分别为亚硫酸杆菌属??(5Wg/^o/?ac^rsp.)及根瘤菌属(Afes^r/z/zc?6/_sp.)新种。
【参考文献】:
期刊论文
[1]东海产麻痹性贝毒链状亚历山大藻共附生菌群多样性研究[J]. 唐莹莹,乔玉宝,蒋志伟,张静,张若男,田晓清,马丽艳,张晓玲,陆亚男,樊成奇,杨桥. 海洋渔业. 2018(06)
[2]微小亚历山大藻(Alexandrium minutum)的氮磷吸收、生长、产毒动态变化[J]. 俞群娣,王亚军,余新威,刘寅政,李叶,方力,陈成吉,罗红宇. 海洋与湖沼. 2018(02)
[3]贝类生物毒素研究进展[J]. 阮雯,纪炜炜,岳冬冬,方海,刘勤,王鲁军,王芸,张晓峰,陆亚男. 渔业信息与战略. 2017(04)
[4]高通量测序在酱香白酒微生态多样性研究中的应用[J]. 郭敏,黄永光,邱树毅,胡建峰,胡峰,钟方达. 中国酿造. 2017(05)
[5]海水赤潮的危害及防治对策[J]. 张晓冉,庞雨宁. 河北渔业. 2017(04)
[6]纳米山药多糖合生元结肠靶向微生态调节剂对大鼠肠道菌群的影响[J]. 孟德欣,于莲,李雪欣,苏瑾,马淑霞,张涛,许月明. 中国新药杂志. 2016(23)
[7]休眠孢囊作为甲藻有害藻华年际频发和地理扩散一种关键机制的研究进展[J]. 唐赢中,胡章喜,邓蕴彦. 海洋科学集刊. 2016(00)
[8]我国近海有毒藻和藻毒素的研究现状与展望[J]. 于仁成,罗璇. 海洋科学集刊. 2016(00)
[9]产麻痹性贝毒塔玛亚历山大藻共培养菌群的物种多样性研究[J]. 刘巧红,苑丽东,田晓清,马丽艳,周宏农,樊成奇,杨宪时,杨桥,张晓玲. 海洋渔业. 2016(06)
[10]拟南芥转酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及与α-三联噻吩结合作用分析[J]. 赵斌,霍静倩,邢继红,齐萌,张金林,董金皋. 高等学校化学学报. 2015(04)
博士论文
[1]基于肠道菌群、代谢组学分析研究异常黑胆质型哮喘维西医结合治疗的临床疗效及其作用机理[D]. 玛丽叶古·阿吾提.新疆医科大学 2015
本文编号:3603565
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