2016-2018年青岛地区手足口病柯萨奇病毒CA6基因特征分析

发布时间：2023-02-22 20:08

　　研究目的:本研究通过对2016-2018年青岛地区手足口病病原学和柯萨奇病毒A6型基因组特征研究,以了解手足口病的病原谱流行特征,明确CA6的遗传变异特征,为今后CA6所致HFMD的防控奠定基础。研究方法:青岛市10个区市设有HFMD病原学监测哨点,样本全部由哨点医院根据卫生部发布的《手足口病预防控制指南(2014年版)》采集并登记病例信息。采用荧光定量PCR的方法对青岛市2016-2018年手足口病咽拭子标本进行总肠道病毒(Enterovirus,EV)检测,对EV阳性标本进行常见肠道病毒的分型鉴定(包括肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A16型、A6型和A10型),将肠道病毒的荧光RT-PCR检测CA6阳性标本接种于RD细胞上进行病毒分离,7日后收取上清进行核酸提取及逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),选取病毒量较高的(CT值小于25)CA6毒株进行VPl基因全长及全基因组扩增,测序结果用Sequencher软件进行序列拼接,用ClustalX 2.0比对序列后,导入Mega 7.0软件进行序列比对及系统进化分析,用于建立系统发生树的CA6参考序列选自GenBank中肠道病毒...

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
引言
    1.手足口病简介
    2.肠道病毒病原学
    3.手足口病流行情况
    4.手足口病临床症状
材料和方法
    1.标本来源
    2.标本的处理
    3.肠道病毒核酸提取及荧光定量RT-PCR检测
    4.肠道病毒分离培养
    5.CA6型别基因扩增
    6.VP1及全基因序列比对及系统发生分析
    7.重组分析
    8.统计学处理
结果
    1.2016-2018年青岛地区HFMD病原学流行概况
    2.基于CA6 VP1区种系进化分析
    3.基于CA6全基因种系遗传进化分析
    4.青岛CA6毒株核苷酸和氨基酸变异分析
    5.CA6全基因毒株同源性分析
    6.CA6毒株全基因序列重组分析
讨论
结论
参考文献
综述
    综述参考文献
攻读学位期间的研究成果
缩略词表
致谢



本文编号：3748214