光肩星天牛不同越冬时期幼虫相关耐寒基因的表达规律

发布时间：2023-03-24 18:22

　　光肩星天牛(Anoplophora glabripennis)是我国重要的林业蛀干害虫,也是国际重要的检疫对象。寄主广泛,主要以幼虫在寄主内蛀道危害并越冬,而冬季的低温条件直接影响着越冬昆虫的发育生长以及繁殖扩散,因此昆虫的耐寒性已成为其种群得以生存和繁衍的重要条件。通过近年来的追踪调查发现光肩星天牛正在向高纬度高海拔地区进行扩散,推测与其耐寒性的增强相关。本文以光肩星天牛不同越冬时期的幼虫为研究对象,利用转录组测序技术,探究目标基因以及可变剪切事件在不同越冬时期的表达规律以揭示其耐寒性的影响因素及相关耐寒适应机制。主要结果如下:1.获得了不同越冬时期的光肩星天牛转录水平的遗传信息。对5个不同越冬阶段的15个样本分别进行转录组测序,共获得822,365,302条clean reads,注释22319个基因,在COG、GO、KEGG注释的基因分别为3909、8103和4581个基因,3个数据库中共注释基因1518个。2.明确了不同越冬时期光肩星天牛幼虫的转录差异。对显著差异表达基因的9种聚类子集中5个聚类子集分析表明,5个子集的基因表达量变化趋势各不相同,2、4、6、7、8类子集中基因的...

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摘要
Abstract
1 引言
    1.1 光肩星天牛的概况
        1.1.1 光肩星天牛及其分布危害
        1.1.2 光肩星天牛的研究进展
    1.2 昆虫耐寒性概况
        1.2.1 昆虫的耐寒性
        1.2.2 影响昆虫耐寒性的因素
        1.2.3 昆虫的耐寒策略
        1.2.4 昆虫耐寒性研究技术发展
        1.2.5 昆虫耐寒性分子生物学研究
        1.2.6 光肩星天牛耐寒性研究概况
    1.3 可变剪切事件的研究概况
    1.4 研究的目的与意义
    1.5 研究思路与技术路线
2 转录组测序分析不同越冬阶段光肩星天牛幼虫的耐寒基因
    2.1 材料与方法
        2.1.1 虫源
        2.1.2 光肩星天牛的RNA提取和文库构建
        2.1.3 转录组数据质量控制
        2.1.4 与参考基因组比对
        2.1.5 转录组功能注释与分类
        2.1.6 差异表达分析
        2.1.7 荧光定量PCR验证
    2.2 结果与分析
        2.2.1 Illumina测序和从头组装
        2.2.2 基因注释结果
        2.2.3 基因的表达量分析
        2.2.4 差异基因分析
        2.2.5 荧光定量结果分析
    2.3 结论与讨论
        2.3.1 转录组测序结果分析
        2.3.2 差异基因的表达分析
3 基于RNA-seq技术对不同越冬阶段光肩星天牛幼虫的可变剪切事件分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 数据来源
        3.1.2 可变剪切事件鉴定方法
        3.1.3 差异可变剪切事件的鉴定方法
    3.2 结果与分析
        3.2.1 相邻阶段可变剪切事件及产生的新可变剪切事件
        3.2.2 差异可变剪切事件分析
    3.4 结论与讨论
4 结论与展望
    4.1 研究结论
    4.2 创新点
    4.3 问题与展望
参考文献
个人简介
导师简介
致谢



本文编号：3769617