纳米二氧化硅粉尘暴露对巨噬细胞基因表达影响

发布时间：2023-05-24 23:49

　　目的检测纳米二氧化硅(SiO₂)粉尘刺激的巨噬细胞微阵列芯片差异表达基因(DEGs)表达水平,筛选纳米SiO₂粉尘暴露相关疾病的主导信号通路。方法从美国国立生物技术信息中心开发的公共基因芯片数据库获取纳米SiO₂粉尘干预的RAW264.7巨噬细胞基因芯片GSE13005。以不添加SiO₂粉尘的完全培养基培养巨噬细胞作为对照组,终质量浓度为5、20、50 mg/L的纳米SiO₂粉尘处理巨噬细胞作为暴露组。采用RMA Express 1.2.0软件、R语言3.5.1对巨噬细胞基因表达数据进行分析,筛选DEGs,并对相关基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果共筛选出67个SiO₂粉尘处理后的巨噬细胞DEGs,其中48个基因高表达,19个基因低表达。GO富集分析结果显示,DEGs主要参与胺的反应、病毒基因组复制的调控、氨基酸转运负调控、排卵、支气管扩张剂反应、趋化因子活性、肌细胞分化负调控、细胞对氨基酸缺乏的反应、...

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 数据来源
    1.2 差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)筛选
    1.3 DEGs功能注释与富集
    1.4 质量控制
2 结 果
    2.1 DEGs
    2.2 DEGs功能注释
    2.3 DEGs功能富集
3 讨 论



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