赤霉素处理下甜樱桃果实转录组分析及成熟软化相关基因表达分析

发布时间：2024-03-23 12:12

　　果实的成熟软化是一个复杂的过程,细胞壁组分的降解和结构的改变影响着果实硬度和质地变化,是导致果实耐贮性降低的主要原因。本试验以10生的‘红灯’甜樱桃为试材,以不同浓度GA₃进行处理。利用高通量测序技术对GA₃处理下的甜樱桃果实进行转录组测序,通过生物信息学分析,选取测序结果中的细胞壁降解酶基因及调控基因MADS-box转录因子,通过实时荧光定量PCR分析这些基因在GA₃处理下基因表达水平。研究结果如下:(1)本试验共获得88593条转录本,平均长度1088bp,预测到65727条unigenes,平均长度1368bp。将unigenes在Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-prot,KEGG,GO 7大数据库中进行比对注释,共有45115条unigenes得到注释。对不同GA₃处理浓度和不同时期的差异基因进行分析,筛选出PG、PME、α-L-Af、Cx、β-Gal、XTH、PEL 7个细胞壁降解相关酶基因,其中PG,β-Gal基因上调表达,PME、α-L-Af、Cx、XTH、PEL基因...

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【部分图文】：

图2甜樱桃果实unigenes的GO功能分类Fig.2GOcategoriesofsweetcherryfruitunigenes

是一套国际标准的基因功能分类体系，本研究中用该体系对甜樱桃果实转录组的unigenes进行功能分类，结果发现有31782条unigenes映射到不同的功能节点上。如图2所示，这些unigenes分别归到生物学过程、细胞组分和分子功能三大类中，更进一步划分到5....

图3甜樱桃果实转录组在不同时期、不同浓度GA3处理下基因表达的热图分析

１８3.1.3GA3处理的甜樱桃果实成熟软化过程中转录组变化对不同浓度GA3处理的甜樱桃果实在转色期和成熟期的基因表达情况进行热图分析，如图3所示，不同成熟期基因表达水平明显被分为2类，两个时期被明显分开，表明不同浓度GA3处理甜樱桃果实中的基因表达情况虽有差异，但在同一时期相似....

图4GA3处理的甜樱桃果实在不同时期差异基因GO分类Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟时期差异基因分子功能中富集差异基因最多的前3条GO条目分别是氧化还原酶活性、作用于配对供体的氧化还原酶活性、水解酶活性，作用于糖基键（表

２０图4GA3处理的甜樱桃果实在不同时期差异基因GO分类Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟时期差异基因分子功能中富集差异基因最多的前3条GO条目分别是氧化....

图5甜樱桃果实发育过程中PG、PME基因表达水平Fig.5PGandPMEgeneexpressionduringthedevelopmentofsweetcherryfruit

２４3.2GA3处理对甜樱桃成熟软化相关基因表达和酶活性的影响3.2.1细胞壁降解酶相关基因表达与果实硬度的相关性分析对甜樱桃果实发育过程中的细胞壁降解酶相关基因的表达水平与果实硬度变化的相关性进行分析（表8），PG基因和XTH基因表达水平与果实硬度的相关性系数分别为-0.920....

本文编号：3935901