利用GEO数据库分析结肠癌中EZH2及其相关基因的表达与意义
发布时间:2017-07-18 06:08
本文关键词:利用GEO数据库分析结肠癌中EZH2及其相关基因的表达与意义
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【摘要】:目的探讨果蝇Zeste基因增强子人类同源物(EZH2)在结肠癌的表达情况、评估对结直肠癌患者预后的意义,并分析预测与其相关的基因及细胞通路。方法通过GEO数据库下载基因芯片GSE17538数据内包含232例结直肠癌病例;结合R2平台,筛选出与EZH2表达显著相关的基因并进行GO和KEGG通路分析;通过Kaplan-Meier法绘制生存曲线,研究EZH2与患者预后、生存之间的关系。结果 232例结肠癌标本中,EZH2的表达与年龄(χ2=4.426,P=0.035)、AJCC分期(χ2=8.259,P=0.041)和分化程度(χ2=7.301,P=0.026)有关,与性别(χ2=0.622,P=0.430)无关。全部检测出与EZH2表达显著相关基因共4 305个(其中正相关2 240个、负相关2 065个),对GO及KEGG通路分析后发现其中1 509个相关基因涉及细胞周期、RNA的转录、DNA复制等多个肿瘤发生、发展过程。Kaplan-Meier法分析,EZH2的表达与患者的无病生存期有相关性(P0.05)。结论推测EZH2可成为研究患者预后的分子标志物,为未来深入研究提供参考。
【作者单位】: 哈尔滨医科大学附属第二医院结直肠肿瘤外科;哈尔滨医科大学大肠癌研究所;国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院结直肠外科;
【关键词】: 结直肠肿瘤 基因表达 EZH 细胞周期 基因芯片
【基金】:黑龙江省医学科学院科研计划项目(No.201504) 哈尔滨医科大学科研基金(No.KYB2015-30)
【分类号】:R735.35
【正文快照】: 结直肠肿瘤是目前第3常见的恶性肿瘤。根据中国癌症统计分析数据,2015年结直肠癌的发病率和死亡率均位于第5位,并且发病率和死亡率均呈逐年上升趋势[1]。结直肠癌的发生与发展是一个多步骤、多因素的过程。随着近20年来,以核酸测序为代表的高通量组学分析技术的日趋成熟,结直
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本文编号:556308
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