水稻矮秆基因iga-1的序列变异和表达分析

发布时间：2017-08-02 06:06

  本文关键词：水稻矮秆基因iga-1的序列变异和表达分析

  更多相关文章： 水稻 矮秆基因 缺失突变 G蛋白α亚基 iga-

【摘要】：该研究以水稻矮秆突变体cha-2为材料,对控制其表型性状的iga-1基因进行候选基因筛选,利用基因注释数据库对定位区间进行候选基因预测,通过ORF及其上下游调控区域的测序、序列比对及关键元件分析进行序列变异研究,半定量PCR检测目标基因的表达模式,明确其在基因序列、表达模式的变异,探讨其分子遗传调控机理。结果显示:(1)在隐性核基因iga-1精细定位基础上预测得到3个ORF,其中2个编码dnaJ分子伴侣(含有dnaJ结构域的蛋白),分别是LOC_Os05g26902和LOC_Os05g26926;另外1个为已克隆的水稻矮秆基因RGA1(LOC_Os05g26890)。(2)ORF序列分析表明矮秆突变体cha-2与野生型仅在RGA1基因座存在SNP变异,但未造成氨基酸编码的改变。(3)表达模式分析发现,矮秆突变体cha-2的RGA1基因在种子萌发期、二叶期、四叶期和分蘖期等4个发育时期均不表达,且在‘中花11’、‘石狩白茅’的遗传背景下稳定遗传,均显现出失活状态,初步确定RGA1为iga-1的候选基因。(4)对RGA1基因上游和下游调控转录关键区进行测序结果表明,突变体cha-2存在865bp的大片段缺失,包括第1外显子、部分第1内含子和转录起始上游区域。研究推断,突变体cha-2的矮秆基因iga-1正是没有活性的RGA1基因,其转录关键区域的大片段缺失,导致无法正常转录表达。
【作者单位】： 华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心;
【关键词】： 水稻 矮秆基因 缺失突变 G蛋白α亚基 iga-
【基金】：国家自然科学基金(31200250) 国家“863”计划(2012AA101201) 广州市对外科技合作项目(2014J4500030) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-01-12)
【分类号】：S511.21
【正文快照】： 株高和分蘖是水稻株型结构中的两个重要农艺性状,也是影响产量的关键因素[1]。自然变异产生的半矮秆基因sd-1在水稻育种史上具有重要影响[2-3],利用sd-1系列矮源种质,中国在水稻矮化育种上取得重要进展,先后育成了大批高产、优质、抗倒伏的优良品种在生产上大面积应用。但是,

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 O.N.Singh;Mahatim Singh;于振文;;不同品种不同施氮量对矮秆小麦氮素利用的效应[J];麦类作物学报;1982年03期

2 田良才;矮兰麦矮秆基因的初步分析[J];作物品种资源;1987年04期

3 唐国顺;薛秀庄;;矮变1号小麦矮秆基因的染色体臂定位[J];陕西农业科学;1988年06期

4 M.D.Gale;S.Youssefian;郭保宏;;小麦矮秆基因(二)[J];麦类作物学报;1988年01期

5 程治军，吕知敏;小麦的矮秆基因及其研究方法[J];作物杂志;1995年04期

6 郭保宏，，宋春华，贾继增;我国46个小麦品种的矮秆基因分析[J];麦类作物学报;1996年05期

7 许琦;杨娜;柴永峰;杨淑巧;赵智勇;裴蕾;郭文治;刘跃鹏;;中国小麦主要矮秆基因的分布及其对株高的影响[J];西北农业学报;2014年05期

8 王山荭,孟凡华,杨丽,刘秉华;矮秆基因对小麦不同农艺性状的影响[J];麦类作物学报;2001年04期

9 赵和;小麦矮秆基因研究和利用现状[J];河北农业科学;2004年04期

10 康苏花;兰素缺;李杏普;柏峰;;小麦矮秆基因的研究进展[J];河北师范大学学报(自然科学版);2010年01期

中国重要会议论文全文数据库 前9条

1 程治军;张立国;秦瑞珍;邱杨;万建民;;水稻显性矮秆突变体986083D的遗传及定位[A];全国植物分子育种研讨会摘要集[C];2009年

2 罗大刚;张淑萍;;水稻矮秆小粒双隐性突变体的遗传育种研究[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年

3 程治军;张立国;邱杨;秦瑞珍;万建民;;水稻显性矮秆突变体986083D的遗传及定位[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

4 刘选明;杨远柱;陈彩艳;唐平徕;刘斌;符辰建;;利用体细胞无性系变异筛选水稻株1S矮秆突变体研究[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年

5 李欣;隋炯明;梁国华;严长杰;严松;顾铭洪;;籼稻多蘖矮株高的遗传分析及其矮秆基因定位[A];江苏省遗传学会第七届代表大会暨学术研讨会论文摘要汇编[C];2006年

6 王立静;哈丽旦;张素梅;徐春花;李启芳;刘保申;;新的玉米显性矮秆突变基因的鉴定与遗传分析[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

7 杨丽;刘秉华;刘宏伟;朱光;王山荭;周阳;孟繁华;;小麦品种“轮选987”的选育与推广[A];中国作物学会2006年学术年会论文集[C];2006年

8 王晓伟;马东钦;许兰杰;朱有朋;詹克慧;;黄淮麦区部分小麦种质资源中矮秆基因的分布[A];全国植物分子育种研讨会摘要集[C];2009年

9 杨丽;王山荭;刘秉华;;利用矮败小麦建立高效育种技术新体系[A];2005年全国学术年会农业分会场论文专集[C];2005年

中国重要报纸全文数据库 前6条

1 王君平;矮败小麦成为小麦良种“加工厂”[N];人民日报;2006年

2 ;约万年前人类已选出水稻高产基因[N];新华每日电讯;2011年

3 禾军;生态条件如何影响农产品贸易[N];科技日报;2003年

4 周铮;尽快设立矮败小麦研究国家专项[N];农民日报;2006年

5 本报记者　邵文杰 　　;麦田的守望者[N];光明日报;2004年

6 本报记者 万佳怡;河南中普：打造特色食品领军企业[N];粮油市场报;2011年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 唐娜;矮秆基因在小麦抗旱节水选育中的利用研究[D];西北农林科技大学;2009年

2 张晓科;中国小麦矮秆基因和春化基因分布及小麦品质相关性状多重PCR体系建立[D];中国农业科学院;2007年

3 姜涛;小麦矮秆基因同源序列的克隆与BAC源合池的构建[D];中国农业科学院;2002年

4 武晶;小麦矮秆基因Rht3的克隆及功能研究[D];中国农业科学院;2012年

5 王立静;玉米矮秆基因Dt和坏死基因nec-t的图位克隆与功能分析[D];山东农业大学;2012年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 陈桂玲;小麦—长穗偃麦草矮秆种质系的遗传分析与矮秆基因标记定位研究[D];山东农业大学;2011年

2 关文波;植物激素对水稻矮秆培矮64S矮生性表达的影响[D];华中农业大学;2008年

3 王晓伟;黄淮麦区部分小麦种质资源中矮秆基因的分布及周88114矮矮秆基因的遗传分析[D];河南农业大学;2008年

4 于东海;小麦—长穗偃麦草杂种后代矮秆基因的鉴定和分子标记研究[D];山东农业大学;2003年

5 吴昆仑;小麦—冰草衍生系矮秆基因的分析与抗旱品种的抗旱性鉴定[D];青海大学;2007年

6 崔淑佳;小偃麦矮秆种质系的遗传分析及矮秆基因标记定位[D];山东农业大学;2014年

7 徐斌;籼稻矮秆多蘖突变体的遗传分析与基因定位研究[D];厦门大学;2007年

8 曹小迎;两个籼稻半矮秆基因的分子定位研究[D];扬州大学;2003年

9 杨松杰;我国小麦品种（系）矮秆基因的分子检测[D];新疆农业大学;2004年

10 袁小川;雄性核不育水稻矮秆突变体突变分子机制的初步研究[D];湖南大学;2005年

本文编号：607898