全基因外显子测序技术在肝细胞癌侵袭性研究中的应用

发布时间：2017-08-02 23:23

  本文关键词：全基因外显子测序技术在肝细胞癌侵袭性研究中的应用

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【摘要】：目的肝细胞癌(HCC)是一种常见的恶性肿瘤,全球范围内居恶性肿瘤死因第三位,HCC的发生与癌基因和(或)抑癌基因突变有关,但发病机制仍不明确,全基因组外显子测序技术(Whole exome sequence,WES)是一种经济、高效的测序方法,可用于筛选鉴定复杂疾病的相关致病基因。本实验拟采用WES技术对临床上不同转移潜能HCC组织及癌旁正常肝组织进行对比分析,初步探讨肝癌术后复发转移的基因序列改变包括各种突变。方法将10例HCC分按临床特征分为高转移潜能组和低转移潜能组,分别提取HCC组织及周围正常肝组织DNA,使用Complete Genomics(CG)Black Bird测序平台进行测序,所得数据同参考序列对比筛选变异基因,首先进行两组间对比后筛选出高潜能转移组中特有的突变,其次筛选出仅在肿瘤组织中的突变。结果1.有58个突变仅在高转移潜能组中出现;其中CCND3(rs1051130T/G)、CCRL2(rs3204849T/A)、CNTN2(rs2229866C/T)、FAT2(rs10044879G/A、rs150946802A/T*、rs2278370G/A)、MAP3K19(rs1112542G/C,rs16831235C/T)、PARP15(rs12489170G/A)、RECK(rs36108087G/A*,rs16932912G/A)、SDC1(rs10205485T/A)曾被报道过同一些肿瘤侵袭、转移有关;2.ADD1(rs4961G/T)、ALDH2(rs112235942G/T*,rs671G/A,rs145077856G/C)及FTSJ3(rs2727288A/T)频繁突变值得关注;3.有22个突变仅存在肿瘤组织中,其中ADGB(rs147022152A/T*、rs147045354G/T*)、CTNNB1(rs121913412A/G)、SAMD9L(rs92764797G/A*、rs92763885T/G*)曾被报道过同肿瘤发生有关。结论1.CCND3、CCRL2、CNTN2、FAT2、MAP3K19、PARP15、RECK、SDC1突变与HCC术后侵袭转移密切相关;2.ADD1、ALDH2及FTSJ3突变可能与HCC术后侵袭转移有关,还需进一步验证;3.ADGB、CTNNB1、SAMD9L的突变可能与HCC的发生有关。
【关键词】：肝细胞癌 外显子 外显子测序技术 侵袭 转移
【学位授予单位】：南华大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R735.7
【目录】：

• 缩略词表4-5
• 摘要5-7
• Abstract7-10
• 引言10-14
• 材料和仪器14-16
• 方法和步骤16-20
• 结果与分析20-40
• 讨论40-44
• 结论44-46
• 参考文献46-52
• 综述 全基因外显子测序在肝细胞癌复发、转移研究中的应用52-60
• 参考文献57-60
• 致谢60

【参考文献】

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本文编号：611708