火炬松生长和松脂性状相关候选基因的单核苷酸多样性分析

发布时间：2017-08-03 14:31

  本文关键词：火炬松生长和松脂性状相关候选基因的单核苷酸多样性分析

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【摘要】：【目的】对火炬松Pinus taeda生长和松脂产量相关功能基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行筛选与分析,为分子标记辅助育种提供技术基础。【方法】利用生物信息学对火炬松c DNA文库进行整理、比对、剪接、注释,挑选出与生长素、赤霉素、细胞分裂素及蒎烯合成相关的非重复序列基因(Unigene)作为候选基因片段,利用MEGA5.0和Dna SP4.0软件对火炬松36个单株的8个候选基因片段进行序列比对和分析。【结果】所测序列总长为5 177 bp,检测到184个SNP位点,平均36.9 bp的基因序列中出现1个SNP位点,其中123个为非同义突变、61个为同义突变SNP位点。核苷酸多态性πa和θw分别为0.020和0.016。对8个候选基因片段内SNP位点进行的连锁不平衡分析显示,随着核苷酸序列长度的延伸,SNP位点的连锁不平衡在基因内部迅速衰退(R2≤0.2)。【结论】在火炬松中,基于候选基因内SNP位点间的连锁不平衡作图是可行的。
【作者单位】： 广东省林业科学研究院;广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/华南农业大学林学与风景园林学院;英德市林业科学研究所;
【关键词】： 火炬松 候选基因 单核苷酸多态性 连锁不平衡
【基金】：广东省林业科技创新专项资金(2011KJCX013-02) “十二五”农村领域国家科技计划专题(2012BAD01B0203) 联合国发展计划署援建的火炬松改良种子园项目(CPR/91/153;1992-1996)
【分类号】：S718.4
【正文快照】： 优先出版网址:http://www.cnki.net/kcms/detail/44.1110.s.20151207.1133.028.html林木的重要性状大多属于数量性状,由许多基因和环境共同作用来调控其生长与发育。传统的数量遗传学不能检测控制数量性状的基因的数量、基因在染色体上的位置、每个位点的贡献大小以及基因间的

【参考文献】

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【共引文献】

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【相似文献】

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本文编号：614868