基于分布式信源编码的微生物基因组序列压缩算法

发布时间：2017-08-21 23:10

  本文关键词：基于分布式信源编码的微生物基因组序列压缩算法

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【摘要】：提出一种基于分布式信源编码的微生物基因组序列压缩算法,用于改进微生物基因组序列压缩效率不高的现状.首先将微生物基因组序列映射为两条二进制序列并映射为两幅二值图像以便使用更多的信源相关性.然后构建分布式信源编码来同时传输两个二值图像.同时,为保证边信息传输的高效,优化Context加权方法被用于边信息压缩.实验结果表明,与现有微生物基因组序列压缩算法相比较,该算法能获得更高的压缩效率,并且保持较合理的运算复杂度.
【作者单位】： 云南警官学院信息网络安全学院;昆明学院学报编辑部;
【关键词】： 分布式信源编码 微生物基因组序列压缩 边信息 Context加权 希尔伯特空间填充
【基金】：国家自然科学基金资助项目(61062005) 云南省自然科学基金青年基金资助项目(2013FD042)
【分类号】：Q933;TN911.21
【正文快照】： 第二代基因组测序技术使得获得的基因组序列数据呈指数级增长,也对存储这些数据提出了更高的要求[1].在近20 a的研究中,前人基本上给出了三大类针对基因组序列的压缩算法.一类是基于字典的压缩,另一类是使用无损熵编码进行压缩的方法,第三类是最近几年研究的热点,基于Referenc

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本文编号：715662