高通量基因测序荧光显微成像光学系统研究
发布时间:2021-09-28 13:12
随着生命科学、计算机科学和信息技术的飞速发展,生物信息学应运而生并成为人类健康、疾病防治、药物研究、生命奥秘探索等领域最有研究价值、最大收益、最受瞩目的学科之一。生物信息学的研究基础是海量生物信息的采集、处理、存储、分析和解释,其中生物信息采集的最主要手段是显微成像技术,尤其是高通量荧光显微成像系统是海量生物信息采集的最有力工具。高通量荧光显微成像系统依赖于高信息密度生物芯片、高通量光学系统和高通量图像传感器,生物芯片制备技术目前已经高度成熟,每平方毫米可容纳数百万个信息点,高通量图像传感器的发展日新月异,而商用显微镜在高通量方面却发展缓慢,光学系统已成为高通量荧光显微成像技术的瓶颈,已经不能满足高通量筛选、高通量测序等生物信息学应用领域对生物信息高通量采集的需求。本论文以高通量基因测序荧光显微成像光学系统作为研究对象,从高通量实现方式及对光学系统要求、高通量显微物镜、高精度检焦光学单元、激光照明光学单元、荧光成像仿真五个方面进行了相关研究工作:1.高通量实现方式及对光学系统的要求。从信息通量概念出发,讨论了提高测序通量的方式,包括:提高数值孔径、增大物方视场、增多荧光通道、提高样本更...
【文章来源】:中国科学院大学(中国科学院长春光学精密机械与物理研究所)吉林省
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
基因测序荧光成像示意图
图 1.2 基因测序设备厂商的全球市场份额he Global market share ofthe gene sequencing equipment m占据了全球测序设备市场三分之二的市场份额。I序仪包括五个系列:MiniSeq 系列、MiSeq 系列、Nevaseq 系列。其中,2017 年 1 月发布的 Novaseq 600实现 3000G/d 的测序通量,如图 1.3 所示[36]。南京扬vaseq6000 高通量测序仪,将成为中国最大的人类全
基因测序设备厂商的全球市et share ofthe gene sequenci测序设备市场三分之二的系列:MiniSeq 系列、M中,2017 年 1 月发布的 的测序通量,如图 1.3 所通量测序仪,将成为中国
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国、美国、英国精准医学计划比较研究[J]. 吴思竹,钱庆,杨林. 中国医院管理. 2017(09)
[2]中国国家基因库:功能及意义[J]. 崔正波. 生态经济. 2016(12)
[3]基因测序技术发展及生物医学应用[J]. 林燕敏,门振华,陈业强,兰文军. 齐鲁工业大学学报(自然科学版). 2016(05)
[4]PCR扩增循环数对细菌群落多样性测序分析的影响[J]. 安云鹤,高丽娟,李俊博,田彦捷,王金龙,郑学娟,武会娟. 生物工程学报. 2016(08)
[5]美国启动精准医疗计划[J]. 徐鹏辉. 世界复合医学. 2015(01)
[6]生物医学大数据的现状与展望[J]. 宁康,陈挺. 科学通报. 2015(Z1)
[7]高通量测序技术在动植物研究领域中的应用[J]. 岳桂东,高强,罗龙海,王军一,许姣卉,尹烨. 中国科学:生命科学. 2012(02)
[8]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才. 中国生物工程杂志. 2012(01)
[9]基于数学形态学的微阵列芯片荧光图像处理与分析[J]. 李红卫,苑伟政,叶芳. 传感技术学报. 2007(02)
[10]显微荧光光谱成像仪的研究与设计[J]. 范世福,肖松山,赵友全,李昀,赵玉春. 仪器仪表学报. 2005(10)
博士论文
[1]基于R-C系统的长焦距航空相机实时相位检焦技术研究[D]. 陈志超.中国科学院研究生院(长春光学精密机械与物理研究所) 2016
[2]基于图像处理的自动检焦技术在航空相机中的应用研究[D]. 孟繁浩.中国科学院研究生院(长春光学精密机械与物理研究所) 2016
[3]激光差动共焦干涉元件参数测量方法与技术研究[D]. 杨佳苗.北京理工大学 2015
[4]CMOS-TDI图像传感器研究与芯片实现[D]. 聂凯明.天津大学 2014
[5]高通量基因测序图像处理与数据分析[D]. 叶丙刚.华南理工大学 2010
硕士论文
[1]基于迭代方案的亚像素插值定心算法的研究[D]. 张艳.暨南大学 2012
[2]用于高通量筛选的细胞成像系统研究[D]. 周豪.浙江大学 2011
[3]基于荧光效应的龋齿检测理论和实验研究[D]. 王守涛.浙江大学 2010
本文编号:3411965
【文章来源】:中国科学院大学(中国科学院长春光学精密机械与物理研究所)吉林省
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
基因测序荧光成像示意图
图 1.2 基因测序设备厂商的全球市场份额he Global market share ofthe gene sequencing equipment m占据了全球测序设备市场三分之二的市场份额。I序仪包括五个系列:MiniSeq 系列、MiSeq 系列、Nevaseq 系列。其中,2017 年 1 月发布的 Novaseq 600实现 3000G/d 的测序通量,如图 1.3 所示[36]。南京扬vaseq6000 高通量测序仪,将成为中国最大的人类全
基因测序设备厂商的全球市et share ofthe gene sequenci测序设备市场三分之二的系列:MiniSeq 系列、M中,2017 年 1 月发布的 的测序通量,如图 1.3 所通量测序仪,将成为中国
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国、美国、英国精准医学计划比较研究[J]. 吴思竹,钱庆,杨林. 中国医院管理. 2017(09)
[2]中国国家基因库:功能及意义[J]. 崔正波. 生态经济. 2016(12)
[3]基因测序技术发展及生物医学应用[J]. 林燕敏,门振华,陈业强,兰文军. 齐鲁工业大学学报(自然科学版). 2016(05)
[4]PCR扩增循环数对细菌群落多样性测序分析的影响[J]. 安云鹤,高丽娟,李俊博,田彦捷,王金龙,郑学娟,武会娟. 生物工程学报. 2016(08)
[5]美国启动精准医疗计划[J]. 徐鹏辉. 世界复合医学. 2015(01)
[6]生物医学大数据的现状与展望[J]. 宁康,陈挺. 科学通报. 2015(Z1)
[7]高通量测序技术在动植物研究领域中的应用[J]. 岳桂东,高强,罗龙海,王军一,许姣卉,尹烨. 中国科学:生命科学. 2012(02)
[8]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才. 中国生物工程杂志. 2012(01)
[9]基于数学形态学的微阵列芯片荧光图像处理与分析[J]. 李红卫,苑伟政,叶芳. 传感技术学报. 2007(02)
[10]显微荧光光谱成像仪的研究与设计[J]. 范世福,肖松山,赵友全,李昀,赵玉春. 仪器仪表学报. 2005(10)
博士论文
[1]基于R-C系统的长焦距航空相机实时相位检焦技术研究[D]. 陈志超.中国科学院研究生院(长春光学精密机械与物理研究所) 2016
[2]基于图像处理的自动检焦技术在航空相机中的应用研究[D]. 孟繁浩.中国科学院研究生院(长春光学精密机械与物理研究所) 2016
[3]激光差动共焦干涉元件参数测量方法与技术研究[D]. 杨佳苗.北京理工大学 2015
[4]CMOS-TDI图像传感器研究与芯片实现[D]. 聂凯明.天津大学 2014
[5]高通量基因测序图像处理与数据分析[D]. 叶丙刚.华南理工大学 2010
硕士论文
[1]基于迭代方案的亚像素插值定心算法的研究[D]. 张艳.暨南大学 2012
[2]用于高通量筛选的细胞成像系统研究[D]. 周豪.浙江大学 2011
[3]基于荧光效应的龋齿检测理论和实验研究[D]. 王守涛.浙江大学 2010
本文编号:3411965
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