miRNA与疾病关联预测算法研究

发布时间：2021-09-03 10:27

　　MicroRNAs（miRNAs）是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成。随着人们对mi RNA的认知逐步深入,许多研究表明,mi RNA在生物过程中有着重要的作用,而mi RNA自身的表达和对基因的调控作用可能会影响各种疾病。因此,准确检测miRNAs与疾病之间的关联关系成为近年来的一个新的研究热点。早期研究方法主要基于生物实验,获得的结果准确度较高,也从根本上验证了mi RNA与疾病存在关联关系。然而实验方法存在成本昂贵,耗时较长,且成功率不高等缺点,研究者需要更有效的方法来解决该问题。而随着已知关联关系的增加,利用已知的关联关系而使用计算生物学方式来预测miRNAs与疾病的关联关系似乎成为了科研工作者的突破口。一方面,它的结果可以剔除大量的“错误答案”,节约宝贵的实验成本;另一方面,好的生物计算方法甚至可以替代生物实验,用极高的准确率完成miRNAs与疾病的关联关系预测。本文将当前的用于miRNAs-疾病关联关系的计算方法分为两大类:（1）基于网络拓扑结构的方法,（2）基于机器学习的方法。... 

【文章来源】：哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【图文】：

RWRMDA算法示意图

分布示意图见图3-1 和 3-2。从图中可以看到，有大量的 miRNAs 和疾病只有 1-2 个已知关联，在进行交叉检验时，这将极大的考验 miRNAs-疾病关联预测算法在未知miRNAs-疾病关联的情况下进行预测的能力。

- 21 -图 3-2 miRNA 中 miRNAs-疾病关联关系分布图3.3 实验验证本小节对本文提出的基于序列的 miRNA 功能相似度计算方法和 MISIM 进行了结果比对，这里用到了本文在第 5 章将要提出的基于矩阵分解的 miRNAs-疾病关联关系预测算法模型，模型细节将在第 5 章做出详细介绍，这里只用作说明基于序列的 miRNA 功能相似度计算方法的有效性。除此之外，还有将在第5章用于对比实验的一些现有的其他方法，如 RWRMDA、CMFMDA和RLSMDA，具体的结果如图 3-3 所示。从图 3-3 中可以看到，基于序列的 miRNA 功能相似度计算方法除了在原理上规避了多余先验信息的问题外，在结果上也取得了和使用 MISIM 时近似甚至


本文编号：3380943