利用多信息融合方法预测蛋白质亚核定位

发布时间：2024-01-22 08:13

　　细胞核是真核细胞内最重要的细胞器,它是基因复制、RNA转录的中心,是细胞活动的控制中心。蛋白质的功能与蛋白质在细胞内的位置密切相关,因此,如何从大量蛋白质中精确地识别出核定位蛋白,并且进一步预测亚核定位非常重要。本文基于最新更新的UniProtKB/Swiss-Prot数据库,构建了相似性小于等于25%的核定位蛋白和非核定位蛋白数据集,选取氨基酸序列N端单肽组分信息、蛋白质骨架二肽组分信息、氨基酸指数信息、蛋白质相互作用信息及基因本体注释信息为特征信息,利用支持向量机算法对构建的数据集进行预测。单特征信息中,基因本体注释信息与蛋白质相互作用信息两种特征信息的总预测成功率较好,且总预测成功率都达到了 80%以上,对特征信息进行筛选融合,在5折交叉检验下总预测成功率达到89.11%。本文进一步构建了相似性小于等于25%蛋白质亚核定位数据集N1127和N1044。并选取4种特征信息:氨基酸组分信息、蛋白质骨架二肽组分信息、基因本体注释信息和蛋白质相互作用信息,利用支持向量机算法对构建的数据集进行预测。单特征信息中,基因本体注释信息与蛋白质相互作用信息两种特征信息的总预测成功率较好,将特征信息...

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

本文编号：3882510