中山市2007—2014年1型登革病毒E基因分子特征分析

发布时间：2018-04-12 16:04

  本文选题：型登革病毒 + E基因　； 参考：《南昌大学学报(医学版)》2017年01期

【摘要】：目的分离、鉴定中山市2007—2014年1型登革病毒并获得E基因序列,从分子水平分析其系统进化和地域来源情况,了解该病毒各年份的流行性质。方法收集中山市2007—2014年登革热患者急性期血清,接种C6/36细胞分离登革病毒,应用RT-PCR技术扩增病毒的包膜蛋白E基因全长,并对序列进行系统进化和同源性分析。结果共分离到登革1型病毒流行株25株,参考国际标准株E基因序列将其分为GⅠ型和GⅤ型2个基因型。其中2007年3株,2012年3株,2013年3株,2014年7株聚集在GⅠ型中,2014年9株聚集在GⅤ型中。中山2014年登革病毒GⅠ型流行株与中山市2007年、2012年、2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分别为98.25%(99.40%)、98.18%(99.80%)、99.73%(100.00%),与珠三角2014年广州、珠海输入中山株的氨基酸序列相似度为100.00%;中山市2013年登革病毒GⅠ型流行株与广州、佛山的2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分别为99.67%(100.00%)、99.74%(100.00%)。结论 2007—2014年中山市流行的登革1型病毒有2个基因型(GⅠ型和GⅤ型)。2014年GⅤ型可能由国外输入,GⅠ型中2007年和2012年为国外输入株,2013年及2014年流行株E基因序列相似度高,2014年的登革流行可能与2013年流行株本地化有关。
[Abstract]:Objective to isolate, identify and sequence the E gene of dengue virus type 1 from 2007 to 2014 in Zhongshan City, and analyze its phylogeny and geographical origin at molecular level.Methods Serum samples of dengue fever patients from 2007 to 2014 in Zhongshan City were collected and inoculated with C6 / 36 cells to isolate dengue virus. The full length of envelope protein E gene was amplified by RT-PCR technique and the sequence was systematically evolved and homologous analyzed.Results A total of 25 strains of dengue 1 virus were isolated and classified into two genotypes, G 鈪，

本文编号：1740438