基于基因组学的肺炎克雷伯菌噬菌体安全性评估

发布时间：2018-05-18 22:31

  本文选题：肺炎克雷伯菌 + 噬菌体　； 参考：《基因组学与应用生物学》2017年03期

【摘要】：泛耐药肺炎克雷伯菌的流行,使得临床面临无药可用,越来越多的肺炎克雷伯菌噬菌体近年来被报道,并在动物模型中证明了它们用于防控细菌感染的有效性。然而,噬菌体作为病毒的一类,不同于传统的抗菌药物,在临床应用之前需要进行更为全面的评估,本研究将基于基因组学对已报道的肺炎克雷伯菌噬菌体安全性进行评估。通过生物信息学分析噬菌体基因组上是否含有肺炎克雷伯菌限制性内切酶识别位点来评估其基因组稳定性,并就其是否携带有害基因和是否属于溶原性噬菌体等方面进行分析研究。目前已报道22株肺炎克雷伯菌噬菌体的全基因组,7株属于肌尾科,12株属于短尾科,3株属于长尾科;而本研究基于噬菌体全基因组同源性分析结果将短尾科、长尾科和肌尾科中的JD001归为一类,定义为Kp_PhageⅠ;肌尾科分为Kp_phageⅡa和Kp_PhageⅡb两类。噬菌体基因组上含有数目不等的肺炎克雷伯菌限制性内切酶识别位点,不携带有毒力基因和耐药基因。5株属于温和噬菌体,17株属于烈性噬菌体。研究显示肺炎克雷伯菌噬菌体在基因组水平具有良好的安全性,但是基因组上较多的肺炎克雷伯菌限制性内切酶识别位点,使其抗菌谱可能较窄。在使用噬菌体用于防控细菌感染时部分温和噬菌体需要谨慎排除。
[Abstract]:In this study , we have reported that there are 22 strains of Klebsiella pneumoniae phage genome , 7 strains belong to Mycoridae and 12 strains belong to short - tailed families .
【作者单位】： 上海交通大学附属上海市第一人民医院检验医学科;上海交通大学医学院基础部免疫学与微生物学系;
【基金】：国家青年科学基金项目(No.31500154) 上海市科学技术委员会“扬帆计划”项目(No.15YF1409500) 上海市卫生和计划生育委员会课题(No.201440289) 上海市第一人民医院“优青前计划”(No.06N1503012)共同资助
【分类号】：R440

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本文编号：1907503