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吸毒人群MRS分布特征及其影响因素

发布时间：2020-04-25 10:51
【摘要】：目的评估广州市吸毒人群的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillinresistant Staphylococcus aureus,MRSA)及耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci,MRCoNS)(合称耐甲氧西林葡萄球菌,methicillin-resistant Staphylococcus,MRS)的携带状况,探究影响吸毒人群MRS携带的危险因素,掌握菌株的耐药谱和分子特征,为采取有效的预防控制措施以遏制吸毒人群MRSA与MRCoNS的流行和传播提供科学依据。方法本研究采用横断面研究设计,通过方便抽样的方法选取广州市海珠区、越秀区3个美沙酮门诊的吸毒人员为调查对象,采用自制调查问卷对其进行问卷调查与鼻拭子采样。通过实验室标准方法和PCR扩增特征基因分离鉴定金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus,简称SA)和凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase-negative staphylococci,CoNS)菌株;采用Kirby-Bauer纸片扩散法对分离的SA和CoNS菌株进行12种抗生素的药敏试验;利用PCR技术检测SA和CoNS的DNA中mecA基因、毒素基因和耐药基因;通过葡萄球菌染色体盒(Staphylococcal Cassette Chromosome mec,SCCmec)分型技术确定MRSA型别特征,采用多位点序列分型(multilocus sequencing typing,MLST)技术分析SA的分子分型。MRSA与MRCoNS危险因素单因素分析采用χ2检验确切概率法,P0.10的因素纳入非条件Logistic回归模型进行多因素分析。耐药表型、基因型以及毒素基因的分析采用非条件Logistic回归或确切Logistic回归法。统计学检验均为双侧检验,P0.05表示具有统计学意义。采用eBURST V3软件与树状图分析软件对本研究分离出的菌株之间,以及与国际流行菌株的亲缘关系进行分析。结果人口学特征:本研究共调查353名吸毒人员,平均年龄50.75±6.09岁,调查对象均是汉族人,其中男性占87.54%,广州户籍占95.47%。MRSA及MRCoNS鼻腔携带率及危险因素:353名吸毒人员中,53名(15.01%)携带SA,其中24名携带MRSA,总体携带率为6.80%;151名(42.78%)携带CoNS,其中103名携带MRCoNS,总体携带率为(29.18%)。鼻腔携带SA的多因素分析提示,肥胖(aOR=3.018,95%CI,1.550-16.305)是吸毒人员鼻腔携带SA的危险因素。MRSA携带的多因素分析结果表明,近一年住院(aOR=2.959,95%CI,1.056-8.290)是吸毒人员鼻腔携带MRSA的危险因素。鼻腔携带CoNS的多因素分析提示,有监禁史(aOR=1.851,95%CI,1.031-3.323)是吸毒人员鼻腔携带CoNS的危险因素。MRCoNS携带的多因素分析结果表明,已婚(aOR=0.547,95%CI,0.309-0.967)是吸毒人员鼻腔携带MRCoNS的保护因素,而监禁史(aOR=2.533,95%CI,1.161-4.726)是吸毒人员鼻腔携带MRCoNS的危险因素。毒素基因和耐药基因检测:MRSA中毒素基因携带以seg基因(54.17%)为主,其次为sed基因(45.83%)、sei基因(37.50%)、selk基因(33.33%)和selu基因(29.17%)。没有检出sea基因、seb基因和see基因。耐药基因携带以blaZ基因(50.00%)为主,其次为ermC基因(20.83%)和linA基因(12.50%),没有检出tetM基因、VanA基因和VanB基因。selk基因、ermC基因、tetK和mrsA基因在MRSA与MSSA之间的检出率不同,差异有统计学意义(P0.05)。MRCoNS菌株无检出pvl基因,耐药基因携带以blaZ基因(51.79%)为主,其次为msrA基因(24.11%)、linA基因(23.21%)、ermC基因(21.43%)和tetK基因(19.64%),没有检出VanA基因和VanB基因。MSCoNS菌株的tetM基因检出率高于MRCoNS菌株,差异有统计学意义(P=0.01)。MRSA的SCCmec分型:24株MRSA菌株中,仅1株属于HA-MRSA(4.17%),18株属于CA-MRSA(75.00%),5株不可分型。19株可分型。以SCCmec IVa型(20.83%,5/24)和IVd型(50.00%,12/24)占优。MLST:MRSA菌株主要型别为ST188(25.00%,6/24)和ST59(25.00%,6/24)。而MSSA菌株主要ST型别为ST188(17.24%,5/29),ST5(13.79%,4/29)和ST7(13.79%,4/29)。通过eBURST分析,17个ST型别属于8个国际CC克隆群(CC5、CC7、CC30、CC45、CC59、CC182、CC398和CC2483)和1个单体(ST1222)。其中主要以CC5(64.15%)为主,其次为CC59(11.32%)和CC7(7.55%)。通过聚类分析发现,三个采样门诊检出的MRSA菌株ST型别存在聚合现象。药敏试验:吸毒人员鼻腔携带的MRSA对青霉素(95.83%)、红霉素(62.50%)、克林霉素(62.50%)的耐药率较高。MRSA与MSSA对替考拉宁和克林霉素的耐药率均有统计学差异(P0.05)。MRSA菌株的多重耐药率为70.83%,其多重耐药风险是MSSA的3.44倍。MDR-SA的共耐药模式是青霉素-红霉素-克林霉素。吸毒人员鼻腔携带的MRCoNS对青霉素(89.29%)、红霉素(47.32%)、复方新诺明(44.64%)的耐药率较高。MRCoNS与MSCoNS对莫西沙星、克林霉素、青霉素、四环素、庆大霉素和红霉素耐药率均有统计学差异(P0.05)。MRCoNS菌株的多重耐药率高于MSCoNS,差异有统计学意义(P0.001),其多重耐药风险是MSCoNS的4.55倍。MDR-CoNS的共耐药模式是青霉素-头孢西丁-复方新诺明。结论广州市吸毒人员SA和CoNS携带率处于国内外中等水平,而MRS携带率较高。近一年住院是吸毒人员鼻腔携带MRSA的危险因素,而监禁史是吸毒人员鼻腔携带MRCoNS的危险因素。MRSA菌株以社区来源为主,携带的毒素基因主要为sed、seg和sei,ST型别以ST188和ST59为主,与国内流行菌株相同,也与国际流行菌株密切相关。广州市吸毒人群MRS菌株的多重耐药情况较为严重,需对MRS菌株耐药水平进行长期动态检测。
【图文】：

亲缘关系,圆点


注：图中小圆点代表一种 ST 型别，圆点大小与该 ST 型别的菌株数量正相关，圆点之间连线表明菌株之间有遗传进化关系。图 3-1 SA 的亲缘关系图将本研究 53 株 SA 的 ST 型别提交至 MLST 官网与国际上分布的 ST 型别对比发现，17 个 ST 型别可分为 8 个 CC 克隆群，分别为 CC5、CC7、CC30、CC45、CC59、CC182、CC398 和 CC2483，另外 ST1222 为单体。其中主要以 CC5（64.15%，，34/53）为主，其次为 CC59（11.32%，6/53）和 CC7（7.55%， 4/53）。具体的ST 型别及克隆群分布见表 3-11。各 ST 型别与国际菌株 ST 型别关系见图 3-2 至3-9。

菌株,检出,国际


本研究检出ST5、ST6、ST15等菌株与国际克隆群CC5的联系
【学位授予单位】：广东药科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R749.64;R181.3

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本文编号：2640163

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