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宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值

发布时间:2020-11-07 18:49
   目的:探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对非结核分枝杆菌(non-tuberculosis mycobacteria,NTM)感染病原学诊断的价值。方法:回顾性选取2018年9月至2019年12月复旦大学附属中山医院感染病科收治的疑似NTM感染患者183例,共计样本388例,比较常规微生物培养法和mNGS技术对NTM病原体的检出率差异及不同样本类型的亚组分析。结果:常规微生物培养法和mNGS总体检测阳性率差异无统计学意义(21.9%vs 24.7%)。痰液样本培养法的阳性率明显高于mNGS(56.6%vs 22.9%,P0.000 1),而组织样本却低于mNGS(7.8%vs 27.8%,P0.000 1)。另外,mNGS对患者抗菌药物调整频率低于培养法(20.3%vs 40.2%,P0.05)。结论:mNGS对NTM灵敏度较低,需重点改进以促进此技术更好地应用于临床。
【部分图文】:

阳性率,样本,周期,统计学


结果(图1)显示:388例样本中,通过常规培养法检测出NTM阳性为85例,占总例数的21.9%;mNGS检测NTM阳性为96例,占总例数的24.7%。2种方法总体阳性率差异无统计学意义(P=0.29)。96例mNGS阳性样本的检测周期为48 h,85例培养法阳性样本的平均检测周期为28 d,mNGS检测周期明显较短。2.3 不同样本类型检测阳性率比较

方法,统计学,意义,抗菌药物


结果(图2)显示:3个月的随访结果表明,mNGS 3个月内抗菌药物调整频率低于培养方法,差异有统计学意义(20.3% vs 40.2%,P<0.05);患者抗NTM治疗有效率与培养法差异无统计学意义(40.7% vs 50.2%)。3 讨 论
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