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中国多中心侵袭性感染光滑念珠菌复合体流行病学及棘白菌素耐药机制研究

发布时间:2024-04-26 05:11
  目的:综合评估基因水平和蛋白水平技术对光滑念珠菌复合体菌种的鉴定能力;分析中国多中心侵袭性感染光滑念珠菌复合体的抗真菌药物敏感性;系统性研究光滑念珠菌的分子流行病学特征及对棘白菌素类药物的耐药机制。方法:本研究选取了2009年8月至2014年7月五年参加CHIF-NET的11家监测中心收集的所有非重复侵袭性感染光滑念珠菌411株及所有参与医院收集的12株尼瓦利亚念珠菌(Candidanivariensis)和1株布加拉念珠菌(Candida bracarensis)。比较表型方法、基因测序和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对光滑念珠菌复合体的鉴定能力,并在菌种准确鉴定的基础上,测定菌株对9种抗真菌药物的最低抑菌浓度(MIC)。分子流行病学方面,利用多位点序列分析(MLST)和微卫星检测方法,对411株光滑念珠菌进行分子分型,并进行聚类及同源性分析;此外,收集CHIF-NET 2015所有血流感染分离的光滑念珠菌158株,剖析PDR1和MSH2两个耐药相关基因在临床菌株中的突变率并分析其与氟康唑敏感性、分子型别的关系。耐药机制研究方面,检测411株光滑念珠菌F...

【文章页数】:128 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

图1.11家参与单位地理分布和收集的菌株数量(括号内)??Figure?1.?Geographic?distribution?of?the?11?study?centers?involved?in?this?study?and?number?of??isolates?collected?in?each?center?(shown?in?brackets)??

图1.11家参与单位地理分布和收集的菌株数量(括号内)??Figure?1.?Geographic?distribution?of?the?11?study?centers?involved?in?this?study?and?number?of??isolates?collected?in?each?center?(shown?in?brackets)??

本研宄纳入的2009年8月1日至2014年7月31日,11家监测中心五年期间共分离??侵袭性感染光滑念珠菌411株,占总体分离的酵母菌的9.5%,每年分离的菌株数在??76-95株之间,各单位收集的菌株数量见图1。??^?^7h1?(29)?"H4V12I??参??4?'"f.?....


图3.尼瓦利亚念珠菌与布加拉念珠菌ITS序列最大似然树??Figure?3.?The?maximum-likelihood?tree?of?Candida?nivariensis?an?

图3.尼瓦利亚念珠菌与布加拉念珠菌ITS序列最大似然树??Figure?3.?The?maximum-likelihood?tree?of?Candida?nivariensis?an?

得到序列号(表6)。根据ITS和D1/D2测序结果,结合两种菌在Genbank中的??其它序列,以白念珠菌ATCC?18804的序列作为树根,分别作两种菌ITS和D1/D2序??列最大似然比树状图(图3和图4)。ITS结果显示,12株尼瓦利亚念珠菌可分为两??组(Group?1和....


图6.?Bruker?ClinproTools模型遗传算法(GA)生成最大分辨能力的五个峰,红色为尼瓦??利亚念珠菌,绿色为布加拉念珠菌??Figure?6.?Five?peaks?were?determined?by?the?genetic?algorithm?(GA)?to?provide?the?highest??separation?power?to?generate?a?classificati?

图6.?Bruker?ClinproTools模型遗传算法(GA)生成最大分辨能力的五个峰,红色为尼瓦??利亚念珠菌,绿色为布加拉念珠菌??Figure?6.?Five?peaks?were?determined?by?the?genetic?algorithm?(GA)?to?provide?the?highest??separation?power?to?generate?a?classificati?

GA交叉验证值(特异性)均为100%,SNN和QC的特异性分别为99.16%和99.58%。??Bruker?ClinproTools模型遗传算法(GA)生成最大分辨能力的五个峰。GA设定:??模型的最大峰值数,5;最大代数,10及邻居数为3?(图6)。比较尼瓦利亚念珠菌??和布....


图7.?a,?Bruker?ClinproTools模型中尼瓦利亚念珠菌(红色圆圈)和布加拉念珠菌(绿色圆圈)??的菌株分布图

图7.?a,?Bruker?ClinproTools模型中尼瓦利亚念珠菌(红色圆圈)和布加拉念珠菌(绿色圆圈)??的菌株分布图

Bruker?ClinproTools模型遗传算法(GA)生成最大分辨能力的五个峰。GA设定:??模型的最大峰值数,5;最大代数,10及邻居数为3?(图6)。比较尼瓦利亚念珠菌??和布加拉念珠菌的平均谱图(图6)和菌株分布图(图7a),结果表明根据其肽质??量指纹能够明显区分两种....



本文编号:3964760

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