基于11C-PiB PET图像的阿尔茨海默病计算机辅助诊断研究
本文关键词:基于11C-PiB PET图像的阿尔茨海默病计算机辅助诊断研究
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【摘要】:阿尔茨海默病(Alzhermer’s disease,AD)是一种不可逆的神经退化性疾病。目前AD的病因仍然不明,研究表明beta淀粉样蛋白沉淀(amyloid-beta,Aβ)是AD患者大脑的显著特征之一,检测Aβ对AD的早期诊断具有十分重要的意义。近年来,作为活体人脑Aβ显像技术,碳11-匹兹堡复合物B正电子发射断层扫描(Carbon 11-labeled Pittsburgh compound B Positron Emission Tomography,11C-Pi B PET)显像技术被广泛地应用在AD的诊断,分类和康复评估。但是,目前医生基于11C-Pi B PET技术对AD诊断大多采用主观视觉评估,依赖医生经验,耗时且客观性差,无法追踪AD患者病情。因而一种基于Pi B PET图像的AD计算机辅助分析(Computed Aided AD Diagnosis,CAAD)工具对于临床AD诊断具有重要的实践意义。本研究提出一种基于11C-Pi B PET图像的CAAD方法,该方法包含4个模块:11C-Pi B PET图像预处理;基于结构先验阈值的3D格子波尔兹曼(3D Thresholding based Lattice Boltzmann Method,3D T-LB)算法的Aβ感兴趣区域(Regions of Interest,ROIs)快速分割;基于主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)和支持向量机-递归特征消除(Recursive feature elimination using the support vector machine,RFE W-map)方法的特征提取与选择;以及基于机器学习的SVM分类器。为了验证该CAAD方法的可行性和临床意义,本研究选取了华山医院和ADNI数据库共计149组11C-Pi B PET临床数据,针对CAAD中的4个模块分别进行实验验证:在预处理方面,采用临床医生和相关专业研究生的视觉评估实验验证;在ROIs分割方面,通过建立临床医生手工分割的金标准,将3D T-LB算法与PET图像中常见的分割算法对比;在特征提取和选择方面,将所提取的特征与临床精神筛查量表做统计分析,验证其临床病理学意义,并且对比了不同特征选择算法的分类性能;在分类器方面,本研究采用留一法交叉验证,同时对比三种不同的分类器对AD、MCI和HC样本的诊断准确率。结果表明,该CAAD的4个模块均能达到较理想的结果。在预处理方面,与医生和专家的视觉评估结果保持较好的一致性;在ROIs分割方面,基于3D T-LB的快速分割算法在效率和准确率上要优于其他算法,同时与金标准比较时能达到88%以上准确率;在特征提取和选择方面,所得到的特征与临床精神量表具有较好的相关性和显著的统计学意义,同时基于RFE W-map特征选择算法所得特征的分类性能最佳;在分类验证方面,基于多项式核的SVM分类器对不同的AD、MCI和HC分组都能得到最佳的分类效果。作为最终结果,本文提出的CAAD方法针对AD的分类结果可达到95.97%,优于视觉评估和文献中基于其他医学图像的CAAD分类准确率,且该方法在时耗方面能满足临床需求。
【关键词】:阿尔茨海默病 beta淀粉样蛋白沉淀 11碳-匹兹堡复合物B正电子发射断层扫描(Carbon 11-labeled Pittsburgh compound B Positron Emission Tomography Pi B PET)显像技术 图像分割 计算机辅助诊断
【学位授予单位】:上海大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R749.16;R817.4
【目录】:
- 摘要6-8
- ABSTRACT8-13
- 第一章 绪论13-20
- 1.1 引言13
- 1.2 阿尔茨海默病Aβ 级联说13-14
- 1.3 基于 11C-PiB PET技术的AD临床诊断概述14
- 1.4 基于AD诊断的计算机辅助诊断概述14-17
- 1.5 研究目的和内容17-18
- 1.5.1 研究目的17
- 1.5.2 研究内容17-18
- 1.6 本文创新点和结构安排18-20
- 1.6.1 主要创新点18
- 1.6.2 论文结构安排18-20
- 第二章 11C-PiB PET图像的获取20-22
- 2.1 11C-PiB PET图像的获取20
- 2.2 样本选取20-22
- 第三章 11C-PiB PET图像的预处理22-30
- 3.1 基于 11C-PiB PET图像预处理的现状与分析22-23
- 3.2 11C-PiB PET图像预处理流程23-24
- 3.2.1 11C-PiB PET图像配准23
- 3.2.2 11C-PiB PET图像归一化23-24
- 3.2.3 11C-PiB PET图像平滑24
- 3.3 预处理结果及评估实验24-29
- 3.3.1 预处理结果24-25
- 3.3.2 评估实验目的和内容25-26
- 3.3.3 评估实验方法26
- 3.3.4 评估实验要求26-27
- 3.3.5 评估实验步骤27-28
- 3.3.6 评估实验的结果28-29
- 3.4 讨论与小结29-30
- 第四章 11C-PiB PET图像Aβ 感兴趣区域分割30-39
- 4.1 基于PET图像的分割算法文献综述30-31
- 4.2 基于结构先验的格子波尔兹曼三维分割算法31-34
- 4.2.1 LBM算法的数学模型31-33
- 4.2.2 基于结构先验知识的 3D-LB算法33-34
- 4.3 实验部分34-38
- 4.3.1 实验目的和内容34
- 4.3.2 实验方法34-35
- 4.3.3 实验结果35-38
- 4.4 讨论与小结38-39
- 第五章 11C-PiB PET图像特征提取与选择39-50
- 5.1 11C-PiB PET图像特征提取39-40
- 5.1.1 基于PET图像的CAAD特征提取技术现状与分析39
- 5.1.2 基于PCA的特征提取方法39-40
- 5.2 特征选择40-43
- 5.2.1 W-map41-42
- 5.2.2 RFE W-map42
- 5.2.3 P-map42-43
- 5.2.4 RFE P-map43
- 5.3 实验部分43-49
- 5.3.1 实验目的和内容43
- 5.3.2 特征提取方法的验证实验43-46
- 5.3.3 特征选择方法的对比验证实验46-49
- 5.4 讨论与小结49-50
- 第六章 基于机器学习的分类器及其验证50-58
- 6.1 基于机器学习模型的分类器50-52
- 6.1.1 基于核的支持向量机分类器50
- 6.1.2 K近邻算法50-51
- 6.1.3 极限学习机51-52
- 6.2 实验部分52-57
- 6.2.1 实验目的和内容52
- 6.2.2 实验方法52-53
- 6.2.3 实验结果53-57
- 6.3 讨论与小结57-58
- 第七章 总结与展望58-61
- 7.1 结论58
- 7.2 讨论58-59
- 7.3 展望59-61
- 参考文献61-67
- 作者在攻读硕士学位期间公开发表的学术论文67-68
- 作者在攻读硕士学位期间所参与的科研项目68-69
- 致谢69
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