不同品种大豆与土壤中根瘤菌的多样性研究
发布时间:2021-01-29 17:04
大豆是重要农作物之一,大豆与根瘤菌共生固氮体系是生物固氮作用的重要代表,探究根瘤菌与大豆品种间的相互适应关系,对于大豆生产和育种材料的选择等都具有重要的意义。该试验通过根瘤菌分离技术、分子生态学技术和宏基因组测序技术,研究26个不同品种大豆与根瘤菌间选择共生的差异,分析大豆根际根瘤菌的多样性与功能,探究大豆对土壤根瘤菌群落的富集过程,阐明其结构和功能。通过分离的方法从种植在杨凌农田土壤中的26个不同品种大豆根瘤中共获得310株根瘤菌,16S rRNA基因序列分析表明这些根瘤菌分别属于中华根瘤菌属(Sinorhizobium)和根瘤菌属(Rhizobium),分别占总数的98.4%和1.6%,未分离出慢生大豆根瘤菌属(Bradyrhizobium)。通过对持家基因atpD和rpoB序列系统发育进行分析,进一步支持了基于16S rRNA基因的分类结果。可见,在同一土壤条件下,不同品种的大豆对根瘤菌的选择没有明显的差异。通过宏基因组高通量测序分析了5种大豆的根际和非根际细菌群落,结果显示,不同品种的大豆,其根际细菌群落存在差异。从根区、根际到根瘤,大豆对细菌群落的构成有明显的逐层过滤和富集作...
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
根瘤菌、土壤和豆科植物的相互关系及影响
二章 不同品种大豆与其种植土壤中根瘤菌匹配性研试验材料 品来源收集全国不同省份主栽培推广的 26 个不同品种大豆,如图 2-1 所示,下旬,种植于陕西省杨凌地区农耕试验田,该地点并无根瘤菌接种历豆品种随机种植 3 个小区,每个小区规格设置为 3m×5m,种植时确保共种植至少 40 棵大豆,同时设置 3 个不同种大豆的对照土壤。2015 年荚期,每个小区每个品种,五点法采集 5 株植株和根瘤,每个品种共,26 个不同品种的大豆植株共计 390 株,最后记录豆荚数、根瘤数、。在采集根瘤的同时,收集大豆植株根际土壤以及空白土壤,将每个品种壤样品充分混合作为一个土壤样品,装于塑封袋中,运回实验室,-8存备用。表 2-1 所示为 26 个大豆品种与种子来源单位。
16 不同品种大豆与土壤中根瘤菌的多样性研究先通过 http://www.ezbiocloud.net/eztaxon 比对,获得相似性最高的模式菌株序列,再利用这些序列与测序得到的序列利用MEGA5.0软件中ClustalW进行多序列比对。使用 neighbor joining 法建立系统发育树,选用 NJ 树的稳健性用自展法(bootstrap)评估,重复抽样 1000 次。最后,使用 MatGAT2.0 软件计算各测试菌株间 16S rRNA 基因的序列相似性。2.3 结果与分析2.3.1 26 不同品种大豆各 物性状分析各生物性状分析包括,不同品种大豆的豆荚数目、植株的干重、结瘤数以及瘤重等。2.3.1.1 不同品种大豆豆荚数目
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国大豆的生物固氮潜力研究[J]. 关大伟,李力,岳现录,马鸣超,张武,李俊. 植物营养与肥料学报. 2014(06)
[2]根瘤菌菌剂的研究与开发现状[J]. 管凤贞,邱宏端,陈济琛,林新坚. 生态学杂志. 2012(03)
[3]黄土高原地区优良大豆根瘤菌的筛选与接种方式研究[J]. 张红侠,冯瑞华,关大伟,李俊,曹凤明. 大豆科学. 2010(06)
[4]大豆根瘤菌与大豆品种共生匹配性研究[J]. 马中雨,李俊,张永芳,樊蕙,李力. 大豆科学. 2008(02)
[5]微生物有机肥料的研制、生产及应用[J]. 薛德林,胡江春,张仲良,马成新,王伟,丁庆堂,金国龙,隋国斌,王书锦. 腐植酸. 2005(02)
[6]根瘤菌-豆科植物共生多样性与地理环境的关系[J]. 陈文新,汪恩涛,陈文峰. 中国农业科学. 2004(01)
[7]大豆—根瘤菌的固氮作用[J]. 江木兰,张学江,徐巧珍,胡小加,张银波. 中国油料作物学报. 2003(01)
[8]中国大豆(Glycine max)品种资源保存与更新状况分析[J]. 邱丽娟,常汝镇,陈可明,谢华,李向华,关荣霞,孙建英. 植物遗传资源科学. 2002(02)
[9]中国大豆品种生态区域划分的研究[J]. 盖钧镒,汪越胜. 中国农业科学. 2001(02)
硕士论文
[1]四川大豆根瘤菌遗传多样性和系统发育研究[D]. 熊峰.四川农业大学 2014
[2]成都平原大豆根瘤中细菌的分子生态学特征研究[D]. 贾健.四川农业大学 2012
[3]西北部分地区野大豆根瘤菌遗传多样性及系统发育的研究[D]. 沈耀耀.西北农林科技大学 2011
本文编号:3007249
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
根瘤菌、土壤和豆科植物的相互关系及影响
二章 不同品种大豆与其种植土壤中根瘤菌匹配性研试验材料 品来源收集全国不同省份主栽培推广的 26 个不同品种大豆,如图 2-1 所示,下旬,种植于陕西省杨凌地区农耕试验田,该地点并无根瘤菌接种历豆品种随机种植 3 个小区,每个小区规格设置为 3m×5m,种植时确保共种植至少 40 棵大豆,同时设置 3 个不同种大豆的对照土壤。2015 年荚期,每个小区每个品种,五点法采集 5 株植株和根瘤,每个品种共,26 个不同品种的大豆植株共计 390 株,最后记录豆荚数、根瘤数、。在采集根瘤的同时,收集大豆植株根际土壤以及空白土壤,将每个品种壤样品充分混合作为一个土壤样品,装于塑封袋中,运回实验室,-8存备用。表 2-1 所示为 26 个大豆品种与种子来源单位。
16 不同品种大豆与土壤中根瘤菌的多样性研究先通过 http://www.ezbiocloud.net/eztaxon 比对,获得相似性最高的模式菌株序列,再利用这些序列与测序得到的序列利用MEGA5.0软件中ClustalW进行多序列比对。使用 neighbor joining 法建立系统发育树,选用 NJ 树的稳健性用自展法(bootstrap)评估,重复抽样 1000 次。最后,使用 MatGAT2.0 软件计算各测试菌株间 16S rRNA 基因的序列相似性。2.3 结果与分析2.3.1 26 不同品种大豆各 物性状分析各生物性状分析包括,不同品种大豆的豆荚数目、植株的干重、结瘤数以及瘤重等。2.3.1.1 不同品种大豆豆荚数目
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国大豆的生物固氮潜力研究[J]. 关大伟,李力,岳现录,马鸣超,张武,李俊. 植物营养与肥料学报. 2014(06)
[2]根瘤菌菌剂的研究与开发现状[J]. 管凤贞,邱宏端,陈济琛,林新坚. 生态学杂志. 2012(03)
[3]黄土高原地区优良大豆根瘤菌的筛选与接种方式研究[J]. 张红侠,冯瑞华,关大伟,李俊,曹凤明. 大豆科学. 2010(06)
[4]大豆根瘤菌与大豆品种共生匹配性研究[J]. 马中雨,李俊,张永芳,樊蕙,李力. 大豆科学. 2008(02)
[5]微生物有机肥料的研制、生产及应用[J]. 薛德林,胡江春,张仲良,马成新,王伟,丁庆堂,金国龙,隋国斌,王书锦. 腐植酸. 2005(02)
[6]根瘤菌-豆科植物共生多样性与地理环境的关系[J]. 陈文新,汪恩涛,陈文峰. 中国农业科学. 2004(01)
[7]大豆—根瘤菌的固氮作用[J]. 江木兰,张学江,徐巧珍,胡小加,张银波. 中国油料作物学报. 2003(01)
[8]中国大豆(Glycine max)品种资源保存与更新状况分析[J]. 邱丽娟,常汝镇,陈可明,谢华,李向华,关荣霞,孙建英. 植物遗传资源科学. 2002(02)
[9]中国大豆品种生态区域划分的研究[J]. 盖钧镒,汪越胜. 中国农业科学. 2001(02)
硕士论文
[1]四川大豆根瘤菌遗传多样性和系统发育研究[D]. 熊峰.四川农业大学 2014
[2]成都平原大豆根瘤中细菌的分子生态学特征研究[D]. 贾健.四川农业大学 2012
[3]西北部分地区野大豆根瘤菌遗传多样性及系统发育的研究[D]. 沈耀耀.西北农林科技大学 2011
本文编号:3007249
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