基于高通量测序技术分析2种菌草根际土壤细菌群落多样性
发布时间：2021-02-28 03:39
为详细了解福州菌草基地巨菌草和绿洲一号2种菌草的根际土壤细菌群落组成与结构,本研究应用高通量测序技术,分析了巨菌草和绿洲一号根际土壤细菌群落结构及多样性。结果表明,菌草根际土检测到细菌类群主要的优势菌门为酸杆菌门（Acidobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、绿弯菌门（Chloroflexi）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋门（Nitrospirae）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、浮霉菌门（Planctomycetes）;主要的优势菌纲为γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、芽孢杆菌纲（Bacilli）、放线菌纲（Actinobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteria-6）、β-变形菌纲（Betaproteobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteriia）、纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）、δ-变形菌纲（Deltaproteobact...
【文章来源】：热带作物学报. 2019,40(09)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
门水平TOP10的优势细菌相对丰度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel
上主要类群为酸杆菌门（Acidobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、绿弯菌门（Chloroflexi）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、浮霉菌门（Planctomycetes），相对丰度分别为87.60%、97.67%、31.70%、21.39%、13.28%、10.46%、5.98%、7.59%、7.01%。巨菌草和绿洲一号根际土变形菌门（Proteobacteria）是优势菌门，其非根际土放线菌门（Actinobacteria）是优势菌门。2.1.2纲水平群落结构分析由图2可知，巨菌图1门水平TOP10的优势细菌相对丰度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel草和绿洲一号根际土壤细菌群落在纲类水平上主要类群为γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、芽孢杆菌纲（Bacilli）、放线菌纲（Actinobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteria-6）、β-变形菌纲（Betaprote-obacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteriia）、纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）、δ-变形菌纲（Deltapro-teobacteria）相对丰度分别为34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和绿洲一号根际土γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）是优势菌纲，其非根际土DA052是优势菌纲。图2纲水平土壤细菌群落结构Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3属水平群落结构分析由图3可知，巨菌草和绿洲一号根际土壤细菌群落在属水平上主要类群为葡萄球菌属（Staphylococcus）、糖多孢菌属（Saccharopolyspora）、类芽孢杆菌属（Paeni-bacillus）、沙雷氏菌属（Serratia）、链球菌属（Strep-toc
（Bacilli）、放线菌纲（Actinobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteria-6）、β-变形菌纲（Betaprote-obacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteriia）、纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）、δ-变形菌纲（Deltapro-teobacteria）相对丰度分别为34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和绿洲一号根际土γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）是优势菌纲，其非根际土DA052是优势菌纲。图2纲水平土壤细菌群落结构Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3属水平群落结构分析由图3可知，巨菌草和绿洲一号根际土壤细菌群落在属水平上主要类群为葡萄球菌属（Staphylococcus）、糖多孢菌属（Saccharopolyspora）、类芽孢杆菌属（Paeni-bacillus）、沙雷氏菌属（Serratia）、链球菌属（Strep-tococcus）、红游动菌属（Rhodoplanes）、不动细菌属（Acinetobacter）、未确定属（CandidatusSolib-acter）、未确定属（CandidatusKoribacter）、假单胞菌属（Pseudomonas），相对丰度分别为8.92%、5.49%、1.71%、2.93%、5.52%、4.89%、2.01%、3.61%、3.31%、0.98%。巨菌草和绿洲一号根际土葡萄球菌属（Staphylococcus）是优势菌属，其图3属水平土壤细菌群落结构Fig.3Soilbacterialcommunityatgenuslevel
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序的西洋参根际土壤细菌群落分析[J]. 李丽,蒋景龙. 中药材. 2019(01)
[2]大花杓兰根际与非根际土壤真菌多样性的高通量测序分析[J]. 付亚娟,张江丽,侯晓强. 西北农业学报. 2019(02)
[3]基于高通量测序的复垦土壤细菌多样性研究[J]. 李金融,侯湖平,王琛,张绍良,马静,丁忠义,黄磊,董健,杨永均. 环境科学与技术. 2018(12)
[4]植物根际促生细菌提高植物耐盐性研究进展[J]. 刘少芳,王若愚. 中国沙漠. 2019(02)
[5]基于高通量测序的裕民红花根际土壤细菌群落特征分析[J]. 杨美玲,张霞,王绍明,刘鸯,张丽霞,赵祥. 微生物学通报. 2018(11)
[6]玉米根际细菌群落特征及生防菌筛选[J]. 刘泉成,张茜茜,田雪亮,刘文德. 中国生物防治学报. 2018(05)
[7]基于高通量测序的两种典型忽地笑栽培土壤根际真菌群落多样性[J]. 全妙华,佘朝文,陈东明,胡朝暾,赵丽娟. 微生物学通报. 2018(10)
[8]锰化厂土壤重金属污染及微生物群落结构特征[J]. 蔡茜茜,袁勇,余震,裴东辉,黄雷,周巍. 生态环境学报. 2018(06)
[9]岩溶石灰土微生物丰度的影响因素及其指示意义[J]. 朱美娜,梁月明,刘畅,靳振江,李强. 生态环境学报. 2018(03)
[10]不同荒漠植物根际土壤微生物群落结构特征[J]. 李欣玫,左易灵,薛子可,张琳琳,赵丽莉,贺学礼. 生态学报. 2018(08)
本文编号：3055261
【文章来源】：热带作物学报. 2019,40(09)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
门水平TOP10的优势细菌相对丰度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel
上主要类群为酸杆菌门（Acidobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、绿弯菌门（Chloroflexi）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、浮霉菌门（Planctomycetes），相对丰度分别为87.60%、97.67%、31.70%、21.39%、13.28%、10.46%、5.98%、7.59%、7.01%。巨菌草和绿洲一号根际土变形菌门（Proteobacteria）是优势菌门，其非根际土放线菌门（Actinobacteria）是优势菌门。2.1.2纲水平群落结构分析由图2可知，巨菌图1门水平TOP10的优势细菌相对丰度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel草和绿洲一号根际土壤细菌群落在纲类水平上主要类群为γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、芽孢杆菌纲（Bacilli）、放线菌纲（Actinobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteria-6）、β-变形菌纲（Betaprote-obacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteriia）、纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）、δ-变形菌纲（Deltapro-teobacteria）相对丰度分别为34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和绿洲一号根际土γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）是优势菌纲，其非根际土DA052是优势菌纲。图2纲水平土壤细菌群落结构Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3属水平群落结构分析由图3可知，巨菌草和绿洲一号根际土壤细菌群落在属水平上主要类群为葡萄球菌属（Staphylococcus）、糖多孢菌属（Saccharopolyspora）、类芽孢杆菌属（Paeni-bacillus）、沙雷氏菌属（Serratia）、链球菌属（Strep-toc
（Bacilli）、放线菌纲（Actinobacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteria-6）、β-变形菌纲（Betaprote-obacteria）、酸杆菌纲（Acidobacteriia）、纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）、δ-变形菌纲（Deltapro-teobacteria）相对丰度分别为34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和绿洲一号根际土γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）是优势菌纲，其非根际土DA052是优势菌纲。图2纲水平土壤细菌群落结构Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3属水平群落结构分析由图3可知，巨菌草和绿洲一号根际土壤细菌群落在属水平上主要类群为葡萄球菌属（Staphylococcus）、糖多孢菌属（Saccharopolyspora）、类芽孢杆菌属（Paeni-bacillus）、沙雷氏菌属（Serratia）、链球菌属（Strep-tococcus）、红游动菌属（Rhodoplanes）、不动细菌属（Acinetobacter）、未确定属（CandidatusSolib-acter）、未确定属（CandidatusKoribacter）、假单胞菌属（Pseudomonas），相对丰度分别为8.92%、5.49%、1.71%、2.93%、5.52%、4.89%、2.01%、3.61%、3.31%、0.98%。巨菌草和绿洲一号根际土葡萄球菌属（Staphylococcus）是优势菌属，其图3属水平土壤细菌群落结构Fig.3Soilbacterialcommunityatgenuslevel
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序的西洋参根际土壤细菌群落分析[J]. 李丽,蒋景龙. 中药材. 2019(01)
[2]大花杓兰根际与非根际土壤真菌多样性的高通量测序分析[J]. 付亚娟,张江丽,侯晓强. 西北农业学报. 2019(02)
[3]基于高通量测序的复垦土壤细菌多样性研究[J]. 李金融,侯湖平,王琛,张绍良,马静,丁忠义,黄磊,董健,杨永均. 环境科学与技术. 2018(12)
[4]植物根际促生细菌提高植物耐盐性研究进展[J]. 刘少芳,王若愚. 中国沙漠. 2019(02)
[5]基于高通量测序的裕民红花根际土壤细菌群落特征分析[J]. 杨美玲,张霞,王绍明,刘鸯,张丽霞,赵祥. 微生物学通报. 2018(11)
[6]玉米根际细菌群落特征及生防菌筛选[J]. 刘泉成,张茜茜,田雪亮,刘文德. 中国生物防治学报. 2018(05)
[7]基于高通量测序的两种典型忽地笑栽培土壤根际真菌群落多样性[J]. 全妙华,佘朝文,陈东明,胡朝暾,赵丽娟. 微生物学通报. 2018(10)
[8]锰化厂土壤重金属污染及微生物群落结构特征[J]. 蔡茜茜,袁勇,余震,裴东辉,黄雷,周巍. 生态环境学报. 2018(06)
[9]岩溶石灰土微生物丰度的影响因素及其指示意义[J]. 朱美娜,梁月明,刘畅,靳振江,李强. 生态环境学报. 2018(03)
[10]不同荒漠植物根际土壤微生物群落结构特征[J]. 李欣玫,左易灵,薛子可,张琳琳,赵丽莉,贺学礼. 生态学报. 2018(08)
本文编号：3055261
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