赤拟谷盗RNAi及dsRNA脱靶效应的研究
发布时间:2021-06-11 09:51
基因干扰(RNA interference,RNAi)是现代分子生物学领域的重大发现,该机制在不同进化地位的物种中高度保守。在昆虫学领域中,RNAi技术不仅为昆虫的功能基因组研究提供了便捷的方法,也为农业害虫的防治提供了新途径。然而,脱靶效应(off target effect)给RNAi技术蒙上了阴影,是目前RNAi技术应用的最大障碍。严重的脱靶效应会导致应用RNAi进行昆虫功能基因组学研究产生错误结论,如果利用RNAi进行害虫防治出现脱靶效应,就会因为靶标的非特异性而出现严重的环境安全性问题,甚至影响人类健康。因此,在应用RNAi进行害虫防控的研究中,昆虫体内脱靶效应的评估和控制是一个亟待解决的科学问题。本文以赤拟谷盗Tribolium castaneum为研究对象,通过选择合适的RNAi物质,利用微阵列芯片研究RNAi过程中脱靶效应的发生并探讨可能存在的原因,同时评估了dsRNA脱靶效应预测软件"dsCheck"的准确性,然后研究了与序列相关脱靶效应相关的dsRNA分子特征,验证了RNAi过程中非序列特异性脱靶效应的存在。相关的研究成果可以为未来dsRNA的设计以及安全控制提供理...
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:160 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-1秀丽隐杆线虫中外源RNAi的途径(Fis油er,?2010)??Fig.1-1?The?exogenous?RNAipathw巧?in?Ce/e各幻ns?(Fischer,?2010).??1.1.3?RNAi?
在细胞自发型RNAi过程中,沉默效应仅局限在dsRNA引入或表达的细胞中。??dsRNA被RNaselll?(Dicer)剪切成2I-25bp长度的siRNA,然后这些siRNA参与形??成RISC结构,从而导致mRNA降解,详细作用机制参见图1-3。这种细胞自发型的??RNAi被广泛应用于研究经典的RNAi机制
MindeceHs?(?■■慰■?)C?^???■?^?)?(?l|?〇?J?)C^?O?|?^)??fSSasnSsM????图1-2不同的细胞RNAi示意图(Hunter宗2008)??Fig.?1-2?A?schematic?overview?of?也e?出化化!11?types?of?RNAi?主??1丄3.1细胞自发型RNAi??在细胞自发型RNAi过程中,沉默效应仅局限在dsRNA引入或表达的细胞中。??dsRNA被RNaselll?(Dicer)剪切成2I-25bp长度的siRNA,然后这些siRNA参与形??成RISC结构,从而导致mRNA降解,详细作用机制参见图1-3。这种细胞自发型的??RNAi被广泛应用于研究经典的RNAi机制
【参考文献】:
期刊论文
[1]Efficiency of Different Methods for dsRNA Delivery in Cotton Bollworm(Helicoverpa armigera)[J]. YANG Jing,HAN Zhao-jun. Journal of Integrative Agriculture. 2014(01)
[2]害虫的基因沉默控制[J]. 李飞,吴益东,韩召军. 昆虫知识. 2010(05)
[3]赤拟谷盗的综合防治[J]. 王光春. 粮油食品科技. 2007(04)
[4]RNA干扰技术的原理与应用[J]. 马鹏鹏,薛社普,韩代书. 中国组织化学与细胞化学杂志. 2003(02)
本文编号:3224305
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:160 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-1秀丽隐杆线虫中外源RNAi的途径(Fis油er,?2010)??Fig.1-1?The?exogenous?RNAipathw巧?in?Ce/e各幻ns?(Fischer,?2010).??1.1.3?RNAi?
在细胞自发型RNAi过程中,沉默效应仅局限在dsRNA引入或表达的细胞中。??dsRNA被RNaselll?(Dicer)剪切成2I-25bp长度的siRNA,然后这些siRNA参与形??成RISC结构,从而导致mRNA降解,详细作用机制参见图1-3。这种细胞自发型的??RNAi被广泛应用于研究经典的RNAi机制
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【参考文献】:
期刊论文
[1]Efficiency of Different Methods for dsRNA Delivery in Cotton Bollworm(Helicoverpa armigera)[J]. YANG Jing,HAN Zhao-jun. Journal of Integrative Agriculture. 2014(01)
[2]害虫的基因沉默控制[J]. 李飞,吴益东,韩召军. 昆虫知识. 2010(05)
[3]赤拟谷盗的综合防治[J]. 王光春. 粮油食品科技. 2007(04)
[4]RNA干扰技术的原理与应用[J]. 马鹏鹏,薛社普,韩代书. 中国组织化学与细胞化学杂志. 2003(02)
本文编号:3224305
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