印度谷螟PintGOBP2基因的全长序列克隆及其生物信息学分析

发布时间：2021-10-24 17:04

　　印度谷螟Plodiainterpunctella（Hübner）,是一种危害性较严重的仓储害虫,在我国广泛分布。在其感染寄主的过程中,气味结合蛋白（OBPs）对印度谷螟的行为反应有重要作用。通过转录组数据筛选、鉴定获得印度谷螟OBP基因序列,并命名为PintGOBP2,用DNAMAN对其进行序列分析,BLAST进行同源性比较,并使用MEGA6.0构建系统发育进化树。结果表明:印度谷螟普通气味结合蛋白PintGOBP2的编码基因开放阅读框全长426 bp,编码141个氨基酸,预测分子量为15.48 kDa,等电点为4.39;N末端具有16个氨基酸残基组成的信号肽序列,并含有由6个半胱氨酸组成的保守片段,属于ClassicalOBPs亚家族基因。同源比对结果表明,PintGOBP2基因编码蛋白与其他鳞翅目昆虫GOBP蛋白具有较高的同源性。进化树分析结果表明,PintGOBP2基因与翅目昆虫GOBP超家族内相关基因的同源很高。研究结果为进一步分析印度谷螟PintGOBP2蛋白在其嗅觉信号传导过程中的生理功能提供了基础材料。 

【文章来源】：粮油食品科技. 2019,27(05)

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试昆虫
    1.2 印度谷螟总RNA提取及cDNA合成
    1.3 PintOBP2全长cDNA序列克隆
    1.4 序列鉴定及进化树分析
2 结果与分析
    2.1 印度谷螟普通气味结合蛋白PintGOBP2基因的克隆与序列分析
    2.2 PintGOBP2氨基酸多序列比对及系统进化分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]桃蛀螟性信息素结合蛋白Cpun-PBP1的cDNA克隆、表达谱及其与配体化合物的结合特性分析[J]. 贾小俭,郝少东,杜艳丽,张民照,覃晓春,王进忠,王海香,冀卫荣.  昆虫学报. 2015(11)
[2]中国农业昆虫基因组学研究概况与展望[J]. 张传溪.  中国农业科学. 2015(17)
[3]苜蓿盲蝽气味结合蛋白基因Alin-OBP1的克隆及表达谱分析[J]. 谷少华,张雪莹,张永军,吴孔明,郭予元.  昆虫学报. 2010(05)



本文编号：3455646