溶磷菌wj1中磷酸盐特异性转运系统相关基因的功能鉴定
发布时间:2021-10-28 08:31
无机磷酸盐是所有生物体必需的营养元素,其利用途径开始于无机磷酸盐的跨膜转运。细菌中有两个主要的无机磷酸盐转运系统:无机磷酸盐转运系统(Phosphate inorganic transport,Pit)和磷酸盐特异性转运系统(Phosphate specific transport,Pst)。Pit系统是一个低亲和力、高速的转运系统,由质子动力势提供能量。Pst系统是一类ABC转运蛋白,对无机磷酸盐的亲和力高,由ATP驱动转运无机磷酸盐。细菌通过Pit和Pst系统完成在高磷和低磷条件下无机磷酸盐的转运,满足细菌对磷素营养的需求。通过对高磷和低磷条件下培养的溶磷菌wj1的转录组测序,发现与Pst系统相关的基因,并对其进行一系列基础研究,主要取得以下成果:通过对土壤中常见细菌属的500个菌株的Pst系统进行比较,发现不同的菌株中编码Pst系统的基因有所不同,可分为三类。第一类由五个基因编码,包括pstSCAB-phoU。第二类也由五个基因编码,与第一类不同的是含有两个pstB基因,不存在phoU基因。第三类只由pstSCAB四个基因编码,没有发现phoU基因。通过PCR法得到Pst系统基因...
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Pst系统的调控模式
图 1.1 Pst 系统的调控模式[82]Fig.1.1 Model of regulation of the Pst system Pit 系统 Willsky 等[83]首次证实了大肠杆菌中存在 Pit 系统,之后 Saier[84]等菌、酵母、真菌、植物和动物中均发现 Pit 系统。Pit 系统在大肠杆。在大肠杆菌中,Pit 系统由单一的跨膜蛋白组成,其对磷的亲和力力势提供能量[85],高速转运 HPO42-,反应模式如图 1.2 所示。1980 年rg[86]证实,通过 Pit 系统转运无机磷酸盐需要二价阳离子,如 Zn2+、与。Jackson[87]等研究表明二价阳离子能够激活 Pit 系统。Grillo[88]运二价阳离子与磷酸根形成的金属磷酸盐复合物 MeHPO4(Me 代表二g2+、Ca2+)。Pit 系统是组成型表达,环境中磷酸浓度很高时才会发挥
编码 Pst 系统的基因 转录组测序结果中的基因序列pstS Unigene2256_AllpstC Unigene3428_AllpstA Unigene719_AllpstB Unigene1412_All对 Unigene3428_All 和 Unigene1412_All 进行开放阅读框(ORF)分析见图 3.1,Unigene3428_All 和 Unigene1412_All 基因序列包含多个 ORF。运用 NCBI 中的 BLAST对 Unigene3428_All 的 ORF89-1087bp 和 ORF1301-3586bp 进 行 比 对 , 发 现ORF89-1087bp 与 pstS 同源性较高;ORF1301-3586bp 与 pstC 同源性较高。对Unigene1412_All 的 ORF136-969bp 和 ORF1083-1844bp 进行比对,发现 ORF136-969bp与 pstB 的同源性较高;ORF1083-1844bp 与 phoU 的同源性较高。将 Unigene2256_All命名为pstS1,Unigene3428_All的ORF89-1087bp和ORF1301-3586bp分别命名为pstS2和 pstC,Unigene719_All 命名为 pstA,Unigene1412_All 的 ORF136-969bp 和ORF1083-1844bp 分别命名为 pstB 和 phoU。
【参考文献】:
期刊论文
[1]钼酸铵分光光度法测定水中总磷方法的改进[J]. 贾润中,李敏,杨静怡. 山东化工. 2015(20)
[2]溶磷菌分泌有机酸与溶磷能力相关性研究[J]. 张英,芦光新,谢永丽,姚拓,荣良燕,朱颖. 草地学报. 2015(05)
[3]昆虫抗菌肽的生物信息学预测及分析[J]. 苗璐,武慧,王晶,杨伟新,郝锡联,周晓馥. 广东农业科学. 2014(08)
[4]不同物种间乙酰辅酶A羧化酶的差异性和相似性[J]. 李阳,孔维宝,牛世全,武国凡. 兰州大学学报(自然科学版). 2013(05)
[5]解磷微生物的研究现状及在农业上的应用[J]. 杨艳菊,王改兰,张海鹏,赵旭. 湖南农业科学. 2012(11)
[6]细菌双组分系统的研究进展[J]. 郝艳华,张维,陈明. 中国农业科技导报. 2012(02)
[7]抗菌基本药物的合理应用及相关基础[J]. 张永信. 上海医药. 2012(04)
[8]土壤中磷的形态及转化的探讨[J]. 解锋,李颖飞. 杨凌职业技术学院学报. 2011(01)
[9]阿魏酸化学修饰溶菌酶及扩展抑菌谱的研究[J]. 庞莉,陆建安,王淼,杨严俊. 食品工业科技. 2009(11)
[10]土壤磷素形态及其分级方法研究进展[J]. 张林,吴宁,吴彦,罗鹏,刘琳,陈文年,胡红宇. 应用生态学报. 2009(07)
博士论文
[1]解磷微生物溶解磷矿粉和土壤难溶磷的特性及其溶磷方式研究[D]. 钟传青.南京农业大学 2004
[2]北方石灰性土壤中青霉菌P8(Penicillium oxalicum)活化难溶磷的作用和机理研究[D]. 范丙全.中国农业科学院 2001
硕士论文
[1]低磷胁迫下草酸青霉菌BK溶磷的分子机制[D]. 张健.大连理工大学 2014
[2]玉米根际高效溶磷菌株的分离鉴定、室内溶磷条件和溶磷效果研究[D]. 朱斌.西南大学 2012
本文编号:3462556
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Pst系统的调控模式
图 1.1 Pst 系统的调控模式[82]Fig.1.1 Model of regulation of the Pst system Pit 系统 Willsky 等[83]首次证实了大肠杆菌中存在 Pit 系统,之后 Saier[84]等菌、酵母、真菌、植物和动物中均发现 Pit 系统。Pit 系统在大肠杆。在大肠杆菌中,Pit 系统由单一的跨膜蛋白组成,其对磷的亲和力力势提供能量[85],高速转运 HPO42-,反应模式如图 1.2 所示。1980 年rg[86]证实,通过 Pit 系统转运无机磷酸盐需要二价阳离子,如 Zn2+、与。Jackson[87]等研究表明二价阳离子能够激活 Pit 系统。Grillo[88]运二价阳离子与磷酸根形成的金属磷酸盐复合物 MeHPO4(Me 代表二g2+、Ca2+)。Pit 系统是组成型表达,环境中磷酸浓度很高时才会发挥
编码 Pst 系统的基因 转录组测序结果中的基因序列pstS Unigene2256_AllpstC Unigene3428_AllpstA Unigene719_AllpstB Unigene1412_All对 Unigene3428_All 和 Unigene1412_All 进行开放阅读框(ORF)分析见图 3.1,Unigene3428_All 和 Unigene1412_All 基因序列包含多个 ORF。运用 NCBI 中的 BLAST对 Unigene3428_All 的 ORF89-1087bp 和 ORF1301-3586bp 进 行 比 对 , 发 现ORF89-1087bp 与 pstS 同源性较高;ORF1301-3586bp 与 pstC 同源性较高。对Unigene1412_All 的 ORF136-969bp 和 ORF1083-1844bp 进行比对,发现 ORF136-969bp与 pstB 的同源性较高;ORF1083-1844bp 与 phoU 的同源性较高。将 Unigene2256_All命名为pstS1,Unigene3428_All的ORF89-1087bp和ORF1301-3586bp分别命名为pstS2和 pstC,Unigene719_All 命名为 pstA,Unigene1412_All 的 ORF136-969bp 和ORF1083-1844bp 分别命名为 pstB 和 phoU。
【参考文献】:
期刊论文
[1]钼酸铵分光光度法测定水中总磷方法的改进[J]. 贾润中,李敏,杨静怡. 山东化工. 2015(20)
[2]溶磷菌分泌有机酸与溶磷能力相关性研究[J]. 张英,芦光新,谢永丽,姚拓,荣良燕,朱颖. 草地学报. 2015(05)
[3]昆虫抗菌肽的生物信息学预测及分析[J]. 苗璐,武慧,王晶,杨伟新,郝锡联,周晓馥. 广东农业科学. 2014(08)
[4]不同物种间乙酰辅酶A羧化酶的差异性和相似性[J]. 李阳,孔维宝,牛世全,武国凡. 兰州大学学报(自然科学版). 2013(05)
[5]解磷微生物的研究现状及在农业上的应用[J]. 杨艳菊,王改兰,张海鹏,赵旭. 湖南农业科学. 2012(11)
[6]细菌双组分系统的研究进展[J]. 郝艳华,张维,陈明. 中国农业科技导报. 2012(02)
[7]抗菌基本药物的合理应用及相关基础[J]. 张永信. 上海医药. 2012(04)
[8]土壤中磷的形态及转化的探讨[J]. 解锋,李颖飞. 杨凌职业技术学院学报. 2011(01)
[9]阿魏酸化学修饰溶菌酶及扩展抑菌谱的研究[J]. 庞莉,陆建安,王淼,杨严俊. 食品工业科技. 2009(11)
[10]土壤磷素形态及其分级方法研究进展[J]. 张林,吴宁,吴彦,罗鹏,刘琳,陈文年,胡红宇. 应用生态学报. 2009(07)
博士论文
[1]解磷微生物溶解磷矿粉和土壤难溶磷的特性及其溶磷方式研究[D]. 钟传青.南京农业大学 2004
[2]北方石灰性土壤中青霉菌P8(Penicillium oxalicum)活化难溶磷的作用和机理研究[D]. 范丙全.中国农业科学院 2001
硕士论文
[1]低磷胁迫下草酸青霉菌BK溶磷的分子机制[D]. 张健.大连理工大学 2014
[2]玉米根际高效溶磷菌株的分离鉴定、室内溶磷条件和溶磷效果研究[D]. 朱斌.西南大学 2012
本文编号:3462556
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