敦煌地区不同盐碱类型土壤中未培养细菌多样性研究
发布时间:2022-01-23 05:51
本研究利用分子生态学方法,应用Illumina Hi Seq 2500高通量测序技术和构建土壤细菌16S r RNA基因克隆文库的方法来分析敦煌地区不同类型盐碱土壤中细菌多样性、群落结构及其与土壤理化性质之间的关系,从而揭示敦煌地区不同类型盐碱土壤中细菌群落组成的多样性。主要研究结果有:(1)高通量测序技术对14个土壤样品优化后的序列进行划分共得到4997个OTUs。主要分归于厚壁菌门(Firmicutes),放线菌门(Actinobacteria),变形菌门(Proteobacteria),Deinococcus-Thermus,拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),绿弯菌门(Chloroflexi),酸杆菌门(Acidobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),纤维杆菌门(Fibrobacteres)等17个菌门以及未知类群。克隆文库构建的9个土壤样品中共得到厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)...
【文章来源】:西北师范大学甘肃省
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
样品平均序列度(bp)和样品优化序列
22图3-2 样品的 释性曲线Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤细菌群落组成特征3.2.3.1 水平上 菌类群 成图 3-3 中显示了丰度较高的细菌门类,每一个柱状图是一个样品的物种分布组成,而每种颜色的面积代表了一个物种的相对丰度。14 个土壤样品的 1229404条序列分隶属于细菌类群的 17 个门和未知菌门,主要包括细菌域的变形菌门(Proteobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),厚壁菌门(Firmicutes),纤维杆菌门(Fibrobacteres)
23图3-3 菌群落相对 度在 水平上的分布统计Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community图3-4 基于 水平上的热图分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap图3-4热图可以清晰的展现出在门水平上,细菌在各样品中的不同分布。土壤中占优势的细菌菌门为厚壁菌门(76.27%),其次是放线菌门(11.23%)和变形菌门(5.99%),研究发现在敦煌地区的土壤样品中的这三个菌门在14个
【参考文献】:
期刊论文
[1]土壤微生物多样性分析方法的研究进展[J]. 金明. 农业技术与装备. 2016(04)
[2]内蒙古河套灌区不同盐碱程度的土壤细菌群落多样性[J]. 李新,焦燕,代钢,杨铭德,温慧洋. 中国环境科学. 2016(01)
[3]河西走廊酒泉地区盐碱土未培养放线菌多样性[J]. 李海云,牛世全,孔维宝,阎薇如,耿晖,韩彩虹,达文燕,张爱梅,朱学泰. 应用生态学报. 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地区盐碱土中放线菌多样性——以民勤县为例[J]. 李海云,牛世全,孔维宝,朱学泰,张爱梅,达文燕,韩彩虹,阎薇如,耿晖. 中国环境科学. 2015(06)
[5]土壤微生物多样性研究的新进展[J]. 李旭东,徐莉娜,薛林贵. 广州化工. 2014(20)
[6]柴达木盆地达布逊盐湖微生物多样性研究[J]. 赵婉雨,杨渐,董海良,吴耿,王尚,孙永娟,赖忠平,蒋宏忱. 地球与环境. 2013(04)
[7]三峡库区小江流域消落区土壤微生物多样性[J]. 邱权,陈雯莉. 华中农业大学学报. 2013(03)
[8]微生物分子生态学发展历史及研究现状[J]. 李晓然,吕毅,宫路路,柳陈坚. 中国微生态学杂志. 2012(04)
[9]高通量测序技术及其在生命科学中的应用[J]. 李庆岗,陶立. 畜牧与饲料科学. 2012(02)
[10]土壤微生物多样性及其研究方法综述[J]. 蔡晨秋,唐丽,龙春林. 安徽农业科学. 2011(28)
博士论文
[1]库姆塔格沙漠东缘风沙活动及羽毛状沙丘剖面特征[D]. 王永胜.中国林业科学研究院 2014
[2]莠去津对土壤微生物群落结构及分子多样性的影响[D]. 王军.山东农业大学 2012
硕士论文
[1]石油污染物质输入对滨海湿地根际微生物群落结构的影响研究[D]. 孙会梅.中国海洋大学 2013
[2]库姆塔格沙漠土壤微生物多样性研究[D]. 许璐.中国林业科学研究院 2013
[3]新一代高通量测序技术研究土壤微生物群落结构对环境条件的响应[D]. 张彩霞.南京农业大学 2012
[4]敦煌盆地地下水数值模拟及可视化与管理[D]. 桑学锋.兰州大学 2006
本文编号:3603731
【文章来源】:西北师范大学甘肃省
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
样品平均序列度(bp)和样品优化序列
22图3-2 样品的 释性曲线Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤细菌群落组成特征3.2.3.1 水平上 菌类群 成图 3-3 中显示了丰度较高的细菌门类,每一个柱状图是一个样品的物种分布组成,而每种颜色的面积代表了一个物种的相对丰度。14 个土壤样品的 1229404条序列分隶属于细菌类群的 17 个门和未知菌门,主要包括细菌域的变形菌门(Proteobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),厚壁菌门(Firmicutes),纤维杆菌门(Fibrobacteres)
23图3-3 菌群落相对 度在 水平上的分布统计Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community图3-4 基于 水平上的热图分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap图3-4热图可以清晰的展现出在门水平上,细菌在各样品中的不同分布。土壤中占优势的细菌菌门为厚壁菌门(76.27%),其次是放线菌门(11.23%)和变形菌门(5.99%),研究发现在敦煌地区的土壤样品中的这三个菌门在14个
【参考文献】:
期刊论文
[1]土壤微生物多样性分析方法的研究进展[J]. 金明. 农业技术与装备. 2016(04)
[2]内蒙古河套灌区不同盐碱程度的土壤细菌群落多样性[J]. 李新,焦燕,代钢,杨铭德,温慧洋. 中国环境科学. 2016(01)
[3]河西走廊酒泉地区盐碱土未培养放线菌多样性[J]. 李海云,牛世全,孔维宝,阎薇如,耿晖,韩彩虹,达文燕,张爱梅,朱学泰. 应用生态学报. 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地区盐碱土中放线菌多样性——以民勤县为例[J]. 李海云,牛世全,孔维宝,朱学泰,张爱梅,达文燕,韩彩虹,阎薇如,耿晖. 中国环境科学. 2015(06)
[5]土壤微生物多样性研究的新进展[J]. 李旭东,徐莉娜,薛林贵. 广州化工. 2014(20)
[6]柴达木盆地达布逊盐湖微生物多样性研究[J]. 赵婉雨,杨渐,董海良,吴耿,王尚,孙永娟,赖忠平,蒋宏忱. 地球与环境. 2013(04)
[7]三峡库区小江流域消落区土壤微生物多样性[J]. 邱权,陈雯莉. 华中农业大学学报. 2013(03)
[8]微生物分子生态学发展历史及研究现状[J]. 李晓然,吕毅,宫路路,柳陈坚. 中国微生态学杂志. 2012(04)
[9]高通量测序技术及其在生命科学中的应用[J]. 李庆岗,陶立. 畜牧与饲料科学. 2012(02)
[10]土壤微生物多样性及其研究方法综述[J]. 蔡晨秋,唐丽,龙春林. 安徽农业科学. 2011(28)
博士论文
[1]库姆塔格沙漠东缘风沙活动及羽毛状沙丘剖面特征[D]. 王永胜.中国林业科学研究院 2014
[2]莠去津对土壤微生物群落结构及分子多样性的影响[D]. 王军.山东农业大学 2012
硕士论文
[1]石油污染物质输入对滨海湿地根际微生物群落结构的影响研究[D]. 孙会梅.中国海洋大学 2013
[2]库姆塔格沙漠土壤微生物多样性研究[D]. 许璐.中国林业科学研究院 2013
[3]新一代高通量测序技术研究土壤微生物群落结构对环境条件的响应[D]. 张彩霞.南京农业大学 2012
[4]敦煌盆地地下水数值模拟及可视化与管理[D]. 桑学锋.兰州大学 2006
本文编号:3603731
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