基于DNA宏条形码的莼菜大田土壤真菌多样性研究

发布时间：2022-09-17 14:32

　　高通量测序与DNA条形码结合产生的DNA宏条形码技术（DNA-Metabarcoding）,能快速鉴定混合样本中的物种,现已成为检测群类物种多样性和丰富度的常用方法.本试验采用这一方法分析了莼菜大田不同种植年限土壤真菌多样性,结果表明:10年生土壤中含有最多的真菌种类,多样性及丰富度最高;在属水平上表现为蛙粪霉属、裂梗霉属、酵母属等占优势;群类组成分析显示,种植年限的变化对土壤真菌群落组成有一定的影响;聚类分析中10年与15年生莼菜土壤物种多样性相似度较高. 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集与准备
    1.2 样品总DNA提取
    1.3 PCR扩增及测序
    1.4 数据处理与分析
        1.4.1 原始数据整理、 过滤及质量评估
        1.4.2 OTU划分和分类地位鉴定
        1.4.3 Alpha多样性分析
        1.4.4 分类学组成分析
2 结 果
    2.1 OTU分类学鉴定
    2.2 Alpha多样性分析
    2.3 不同年限莼菜土壤真菌群落的组成
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3679408