不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构变化及其多样性分析
发布时间:2024-01-27 14:36
目的:研究不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构及其多样性,为阐释丹参连作障碍的形成提供理论依据。方法:分别采集未种植丹参(CK)、种植1年(Y1)及种植2年(Y2)的根际土壤,基于Illumina公司Miseq高通量测序平台,进行细菌16S rRNA序列V3-V4区的高通量测序,对不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构及其多样性分析进行研究。结果:CK、Y1及Y2处理中分别得到28 205、13 847及9 296条有效序列,注释为3 832、1 989及1 295种细菌操作分类单元(OTU),其中随着连作年限的增加,根际土壤细菌群落的种类及多样性均呈现下降趋势。在细菌门分类水平上,3个处理土壤中主要优势菌群落为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和细菌变形菌门(Proteobacteria);在纲分类水平上优势菌株相差较大,CK及Y2中所占比例最大的为拟杆菌纲(Bacteroidia),分别为26.40%及38.90%,Y1中所占比例最大的为芽孢杆菌纲(Bacilli),为25.06%;在目分类水平上优势菌株相差明显,CK和Y2中所占比例最大...
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本文编号:3887141
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图2不同连作年限山地丹参土壤细菌在门分类水平群落结构
图3不同连作年限山地丹参土壤细菌在纲分类水平群落结构
图4不同连作年限山地丹参土壤细菌在目分类水平群落结构
图6不同连作年限山地丹参土壤细菌群落OTU维恩图及种类数目注:A.OTU维恩图;B.不同连作年限山地丹参土壤细菌群落1024
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