赤拟谷盗磷化氢敏感和抗性品系数字基因表达谱分析

发布时间：2024-05-10 22:16

　　赤拟谷盗(Tribolium castaneum. Herbst)是广泛分布于世界各地的储粮害虫,通过直接取食、粪便污染及加速霉变等方式对储粮进行危害。目前,全球公认最优良的储粮熏蒸剂是磷化氢(PH₃)。由于长期以来对磷化氢不科学的使用,使得赤拟谷盗在全球范围内产生了不同程度的抗性。随着世界贸易不断发展,其危害范围越来越广泛,抗性越来越严重。前人对于磷化氢的研究都是从某一方面出发,缺乏系统性、完整性。mRNA基因表达谱可在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及规律,综合考虑环境与基因组相互作用,为磷化氢毒理及抗性机制的研究提供有效的研究方法,赤拟谷盗全基因组测序的完成,也为从整体水平研究熏蒸剂磷化氢提供了坚实的基础。为了进一步了解磷化氢的毒理机制和昆虫的抗性机制,本研究以赤拟谷盗为研究对象,采用高通量Illumina RNA-seq技术,构建了未熏蒸敏感品系(NF S)、未熏蒸抗性品系(NF R)、熏蒸后敏感品系(PF_S20)和熏蒸后抗性品系(PF R20)的数字基因表达谱。筛选NF_R vs NF_S、...

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３－１赤拟谷盗总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??（ＮＦ＿Ｓ：未熏蒸敏感品系，ＮＦ＿Ｒ：未熏蒸抗性品系，ＰＦ＿Ｓ２０：熏蒸巧敏感品系，ＰＦ＿Ｒ２０：??）??

３．１总ＲＮＡ提取及质量鉴定??３丄１总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳检测结果??图３－１为电泳检测结果图，从图中可看出２８Ｓ和１８Ｓ《带清晰无拖尾，说??明民ＮＡ无降解，１８Ｓ条带比２８Ｓ条带清晰，无蛋白质污染，总ＲＮＡ质量较好。??■??图３－１赤拟谷盗总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??（Ｎ....

图3一赤拟谷盗4个样本总RNAAgilent2100检测结果

陕阳师范人学硕＋巧巧论文???３．１．３?Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００?Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ?检测结果??使用Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００生物分析仪检测民ＮＡ的完整性，结果如图３－２所示。Ａｇｉｌｅｎｔ??检测图谱中，２３?Ｓ左右起峰是由于Ｍａｒｋｅｒ的存在；后面紧紧跟随的峰，是由于ｓ....

图3-3原始数据过滤图

３．２．１测序数据质量评估??木实验所用四个样木分别为ＮＦ＿Ｒ、ＮＦ＿Ｓ、ＰＦ＿Ｒ２０和ＰＦ＿Ｓ２０，共建４个文??库。经过?Ｉｌｌｈｉｍｉｎａ?出ｓ〇ｉ？２０００?测序后，ＮＦ＿Ｒ、ＮＦ＿Ｓ、ＰＦ＿Ｒ２０?和?ＰＦ＿Ｓ２０?分别得??到了?６，６６２，１９２、７，８４９，０１５....

图３－６四个不同样本基巧表达水平盒形图??Ｅｇｕｒｅ?３－６．?Ｂｏｘ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ｇｅ打ｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｌｅｖｅｌ?ｏｆ?化ｅ?ｆｏｕｒ?ｓａｍｐｌｅｓ??３．２Ａ２差异表达基因的筛选??

３．２．４．１基因表达水平对比??将基因的民ＰＫＭ值转化为ｌｏｇｉ〇（ＲＰＫＭ＋ｌ），样品名为横坐标，ｌｏｇｉ〇（ＲＰＫＭ＋ｌ）??为纵坐标作图。如图３－６所示，大多数转录本ｌｏｇｉ〇（ＲＰＩＣＭ＋ｌ）值都在０．５－２之间，??也有一些高于或者低于这个水平，这些为离群转录本，用黑....

本文编号：3969094