基于分子模拟与微卫星的微生物酶解木质素机制及基因组特征研究

发布时间：2024-03-31 06:17

　　微生物与环境保护及人类健康的关系是当前研究的热点。自然界中的微生物可划分为与污染物降解有关的微生物及与污染物降解无关的微生物。与污染物降解有关的微生物可直接应用于污染物的分解。一些与污染物降解无关的微生物例如大肠杆菌（Escherichia coli）可用于环境监测，而另外一些例如人类免疫缺陷病毒1型(Human Immunodeficiency Virus Type1，HIV-1)和丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus，HCV）威胁人类的健康。研究微生物酶解污染物的机制、微生物基因组或其小RNA的组织规律或序列差异，可以从根本上提高我们对污染物降解进程、微生物基因组进化和调控的理解，对微生物降解污染物效率的提高、环境监测过程中微生物的鉴定及微生物引发的疾病的治疗、控制都具有非常重要的意义。 木质素是一种极难降解的生物高聚物。它的累积引发了严重的环境污染问题。微生物可通过分泌木质素降解酶分解木质素废物。该降解能力与木质素降解酶与木质素之间的相互作用有关。木质素降解酶主要包括漆酶（laccase，Lac）、木质素过氧化物酶（lignin peroxidase， LiP）和锰过...

【文章页数】：154 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.1本研究技术路线图

博士学位论文率较高，而CG/GC,CGA/AGC,AAC/CAA和GCT/TCG极少出现文结构与主要内容题背景界中的微生物分为两类：与污染物降解有关的微生物及与污染物降物。自然界中与污染物降解有关的微生物种类繁多，有的与木质素的与纤维素降解有关，有的与农药降解有关，有....

图2.1底物在最优的Lac-lignin,LiP-lignin和MnP-lignin复合物中的结合口袋及结合取向

或Lac-lignin的可比。特别地，无论标准是基于MolDock评分函数还是Re-Ranking评分函数，复合物LiP-lignin和MnP-lignin的分值比复合物Lac-lignin更低。Lac的对接取向与LiP和MnP的对接取向不同(图2.1)。在复合物Lac-li....

图2.2木质素降解酶与底物之间结合模式的3D模型（颜色：绿色，木质素降解酶；蓝色，底物）

-28-2.2.2相互作用分析和分子动力学模拟底物与三个木质素降解酶的最佳结合模式如图2.2所示。不同的木质素降解酶降解木质素的能力存在差异[8]。该差异在一定程度上与木质素降解酶和木质素之间不同的相互作用有关[9]。复合物Lac-lignin，LiP-lignin和MnP....

图2.3木质素降解酶与底物之间联系的数量Figure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninandMnP-lignincomplexes.Analyzedligand–proteincontactsincludehydrogenbonding(Hb),

图2.3木质素降解酶与底物之间联系的数量ure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninnP-lignincomplexes.Analyzedligan....

本文编号：3943577