几株新鞘氨醇杆菌的趋化性及其相关基因组成特点

发布时间：2017-06-03 03:03

  本文关键词：几株新鞘氨醇杆菌的趋化性及其相关基因组成特点?，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：【目的】选择了几株隶属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)的有和没有多环芳烃(PAHs)降解能力的细菌,在基因组水平比较分析它们的趋化通路,并探究其中一些菌株对芳香化合物和三羧酸(TCA)循环中间代谢产物的趋化性。【方法】通过基因组的比较分析,研究了几株新鞘氨醇杆菌的趋化蛋白组成和趋化基因分布,并采用滴定法和游动平板法检测了相关菌对芳香族化合物和TCA循环中间代谢产物的趋化性。【结果】N.pentaromativorans US6-1、N.pentaromativorans F2、Novosphingobium indicum K13、Novosphingobium stygium DSM 12445、Novosphingobium sp.C2AC等5株新鞘氨醇杆菌对芳香族化合物和TCA循环中间代谢物具有不同程度的趋化性;所选的7株已完成基因组测序的新鞘氨醇杆菌N.pentaromativorans F2、N.pentaromativorans US6-1、Novosphingobium sp.PP1Y、Novosphingobium sp.AP12、Novosphingobium sp.Rr 2-17,Novosphingobium sp.B-7和Novosphingobium sp.DSM 19370均含有趋化蛋白MCP、CheW、CheA、CheB、CheR和CheY,且亲缘关系最近的US6-1、F2和PP1Y 3株菌的che基因簇中的基因排列一致,为che W-Y-D-B-R-A-(X);新鞘氨醇杆菌的趋化系统属Fla类型。【结论】几株新鞘氨醇杆菌都具有较为完整的趋化通路,且对多种芳烃及其代谢物的趋化性各不相同,其中菌株US6-1趋化现象最明显。
【作者单位】： 厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室生命科学学院;
【关键词】： 趋化性 新鞘氨醇杆菌 趋化蛋白 芳烃化合物
【基金】：国家自然科学基金(41376117) 福建省自然科学基金(2013J01143)~~
【分类号】：X172
【正文快照】： 细菌趋化性(chemotaxis)是指有运动能力的细菌对有利环境的趋附(正趋化)和对有害环境的避离(负趋化),此行为是通过感应环境信号和调整鞭毛旋转方向获得。在大多数情况下,趋化物(chemoattractant)能作为细菌的碳源和能源。由于细菌代谢的多样性和复杂性,细菌对环境中的多种异生

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