柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达

发布时间：2022-02-16 11:29

　　【目的】前期根据转录组数据挖掘柑橘单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点,通过关联分析获得14个与柑橘溃疡病耐/感性关联的SNP。以此为基础,本研究利用柑橘杂交群体验证这些位点与柑橘溃疡耐/感性的相关性,以期获得显著相关的SNP,并对其相关的基因进行柑橘溃疡病菌（Xanthomonas citri subsp. citri,Xcc）和植物激素诱导表达分析。【方法】以抗病和敏感柑橘品种及其杂交F1代群体共143个材料为试材,采用离体叶片针刺接种法进行溃疡病抗性鉴定;利用高分辨率熔解曲线（high resolution melting,HRM）技术,对F1群体进行SNP分型;使用DPS软件对F1群体的溃疡病耐/感性表型和SNP基因型进行相关分析;实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,qRT-PCR）分析其中一个SNP相关的柑橘钙依赖性蛋白激酶基因（calcium-dependent protein kinase gene,CDPK）的诱导表达模式。【结果】供试杂交F1代群体的病斑面积在0.75—3.29... 

【文章来源】：中国农业科学. 2020,53(09)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 溃疡病抗性评价
        1.2.2 SNP分型
        1.2.3 CsCDPK生物信息学分析
        1.2.4 CsCDPK诱导表达分析
        1.2.5 数据分析
2 结果
    2.1 F1群体溃疡病抗性鉴定
    2.2 SNP分型及相关性分析
    2.3 CsCDPK生物信息学分析
    2.4 CsCDPK诱导表达分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]柑橘黄龙病病原菌Las在叶圆片嫁接接种的‘锦橙’中早期扩散研究[J]. 吴柳,白晓晶,文庆利,谢竹,何永睿,王丽娟,陈善春,邹修平.  园艺学报. 2018(11)
[2]柠檬自交后代抗柑橘溃疡病的离体鉴定[J]. 谭李梅,刘慧,朱志媚,周东,汤甜,邓子牛.  湖南农业科学. 2017(03)
[3]柑桔抗病分子育种研究进展[J]. 向旭.  分子植物育种. 2006(02)

博士论文
[1]弓形虫钙依赖性蛋白激酶的功能及免疫保护性研究[D]. 王金磊.中国农业科学院 2017
[2]柑橘高密度遗传连锁图谱的构建及落叶性状的QTL定位[D]. 刘升锐.华中农业大学 2016



本文编号：3627884