猕猴桃病毒A和B在陕西省的分布、分子变异与基因组研究

发布时间：2023-03-11 21:50

　　系统调查了中国陕西省猕猴桃主产区周至、眉县、杨凌和汉中‘徐香’、‘海沃德’、‘华优’和‘秦美’猕猴桃上猕猴桃病毒A(Ac VA)和猕猴桃病毒B(Ac VB)的带毒率和分布情况。结果表明,Ac VA和Ac VB在4个产区均有广泛地分布和较高的带毒率。其中,Ac VA和Ac VB分别在杨凌(36.7%)和眉县(36.9%)有最高的带毒率。按照品种划分,Ac VA(32.3%)和Ac VB(32.9%)均在‘徐香’品种上有最高的带毒率。通过高通量测序与分析获得了Ac VA和Ac VB的基因组序列,其分别由7 654和7 454个核苷酸组成,与之前报道的TP7-93A和TP7-93B分离物对应的同源率分别为82.7%和78.5%。Ac VA和Ac VB外壳蛋白基因系统发育树显示,2种病毒分成2个组,存在较大的分子变异。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 病毒的RT-PCR检测
    1.3 克隆、序列测定与分析
    1.4 转录组测序与分析
2 结果与分析
    2.1 AcVA和Ac VB的带毒率
    2.2 转录组分析结果
    2.3 AcVA和Ac VB的基因组分析
    2.4 AcVA和Ac VB的分子变异
3 讨论



本文编号：3760318