通过嫁接传染的不同阶段黄龙病对椪柑转录组的影响

发布时间：2024-01-30 23:00

　　黄龙病(huanglongbing, HLB)是华南柑橘产区最严重的病害之一,主要通过柑橘木虱和嫁接等方式传播,不同的感病方式对寄主的影响可能有所差别。本研究通过嫁接的方式,研究黄龙病对椪柑在感病早期和发病晚期转录组的影响。在早期(14 wpi),总共有6 467个基因出现了显著差异表达,而在晚期(22 wpi),总共有9 625个基因出现了显著差异表达。对差异表达的基因进行KEGG富集分析,发现14 wpi组的差异表达基因总共有14个通路出现了富集,而22 wpi组的差异表达基因总共有24个通路出现了富集。对8个差异表达的基因进行荧光定量PCR验证,结果表明这些基因在两个阶段的表达变化趋势与转录组的数据基本一致。本研究通过研究黄龙病不同发病阶段的差异基因表达,为探究黄龙病的发病机理提供了一定的理论基础。

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【部分图文】：

图1健康的和感染了黄龙病的椪柑

接种了黄龙病的椪柑(CitrusreticulataBlancocv.Ponkan)，在初期(14周,14wpi)时，一些叶片上开始出现黄化的症状。在后期(22周,22wpi)时，叶片上出现更加明显的斑驳黄化等黄龙病典型症状(图1)。通过巢式PCR检测，接种后的样品均有....

图3两组差异调控基因的火山图(Volcanoplot)和韦恩图(Vennplot)

在14wpi组的差异表达基因GO(GeneOthology)富集分析发现(图4A)，在生物学过程(BiologicalProcess,BP)分类中，有43个Terms出现了富集，显著性最高的前3小类分别为木质素代谢过程(Ligninmetabolicprocess,G....

图414wpi组（A)和22wpi组（B）差异基因的GO功能注释

经过KEGG富集分析发现，蛋白合成的相关通路核糖体(Ribosome,ko03010)、和蛋白折叠转运相关通路内质网蛋白加工(Proteinprocessinginendoplasmicreticulum,ko04141)两个通路在14wpi组的差异基因中出现显著富集....

图514wpi组（A)和22wpi组（B）差异基因的KEGG富集图

图414wpi组（A)和22wpi组（B）差异基因的GO功能注释1.9次生代谢物相关差异基因

本文编号：3890515