果生刺盘孢CfHAC1调控应答二硫苏糖醇胁迫的转录组分析
发布时间：2021-08-08 22:36
果生刺盘孢Colletotrichum fructicola是油茶炭疽病优势病原菌。前期研究发现bZIP转录因子CfHac1参与调控该菌的生长发育和致病性。为了揭示转录因子CfHac1调控果生刺盘孢响应内质网压力和致病机理,本研究测定了ΔCfhac1突变体对内质网压力胁迫剂的敏感性,发现突变体对二硫苏糖醇（dithiothreitol,DTT）的耐受性下降,说明CfHAC1基因可能参与调控果生刺盘孢响应内质网压力胁迫过程。进一步利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和CfHAC1敲除突变体菌株在DTT胁迫下的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 680个,其中上调表达基因有1 181个,下调表达基因有1 499个。Gene Ontology功能分析结果显示,差异表达基因主要参与催化活性、结合、代谢过程、细胞过程、细胞成分合成、生物过程调控和应激反应等生物学过程。KEGG功能富集分析表明,上调表达基因主要被富集到核糖体、真核细胞的核糖体生物合成、RNA转运和氰基氨基酸代谢通路中;下调表达基因显著富集在内质网蛋白质加工、N-聚糖生物合成、类固醇合成和蛋白质分泌等通路中。...
【文章来源】：菌物学报. 2020,39(10)北大核心CSCD
【文章页数】：11 页
【部分图文】：
不同菌株对DTT的敏感性测定
GO功能分析表明，差异表达基因在生物学过程分布最多，达到2 188个；在细胞组分中，有3 489个差异表达基因；在分子功能中，有2 490个差异表达基因。这些差异表达基因被聚类到41个功能组中。在生物学过程中，差异表达基因主要分布在代谢过程、细胞过程、单细胞过程、定位、细胞成分组织和合成、生物调节、生物过程调控和应激反应；细胞组分中的膜和膜组分过程类型的差异表达基因所占比例最高；分子功能组分中催化活性和结合过程类型差异表达基因所占比例最高（图3）。图3 差异表达基因GO功能分类
图2 总RNA电泳图谱以校正后的P-value进行统计检验，差异表达基因共鉴定出显著富集的GO term 240个，其中细胞组分、分子功能和生物过程分别为33、46和161个。从最显著富集的前6个GO分类可以看出，差异表达基因主要与蛋白质折叠（GO:0006457）、非折叠蛋白结合（GO:0051082）、核糖核蛋白复合体亚结构（GO:0071826）、核糖体RNA结合（GO:0019843）、核糖体亚基（GO:0044391）和核仁（GO:0005730）相关（表2）。这些差异基因的表达可能对果生刺盘孢响应DTT胁迫造成的非折叠蛋白具有十分重要的作用。
【参考文献】：
期刊论文
[1]bZIP转录因子CfHac1参与调控果生刺盘孢菌的生长发育和致病力[J]. 姚权,郭源,魏丰园,李司政,张盛培,李河. 菌物学报. 2019(10)
[2]MoHRD3基因参与调控稻瘟病菌的生长发育和致病力[J]. 王如锋,文佳,赵桂媛,王敏,陈雪杭,Osakina Aron,王宗华,汤蔚. 植物病理学报. 2020(01)
[3]尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析[J]. 丁兆建,吴小霞,孙君梅,陈丽霞,傅琪彦,许天委. 菌物学报. 2019(07)
[4]油茶苗圃炭疽病原菌鉴定及抗药性[J]. 李河,李司政,王悦辰,刘君昂,徐建平,周国英. 林业科学. 2019(05)
[5]湖南省油茶炭疽病病原鉴定[J]. 李河,李杨,蒋仕强,刘君昂,周国英. 林业科学. 2017(08)
[6]海南省油茶及其他寄主植物果生刺盘孢菌群体遗传结构分析[J]. 李河,李杨,徐建平,周国英. 林业科学. 2016(10)
[7]果生刺盘孢菌Colletotrichum fructicola群体遗传结构研究[J]. 朱丹雪,周国英,徐建平,刘君昂,李河. 菌物学报. 2015(03)
[8]一种油茶新炭疽病原的多基因系统发育分析鉴定[J]. 李河,周国英,徐建平,朱丹雪. 植物保护学报. 2014(05)
[9]湖南省油茶主要病害发生规律研究[J]. 喻锦秀,聂云安,周刚,李密,廖正乾,夏永刚,刘跃进. 湖南林业科技. 2014(01)
[10]N-聚糖和O-聚糖在极性化细胞蛋白质分拣中的作用[J]. 葛长荣,辛现良,耿美玉. 现代生物医学进展. 2007(05)
博士论文
[1]油茶炭疽病菌群体遗传及MAPK基因CfPMK1功能研究[D]. 李河.中南林业科技大学 2018
[2]非折叠蛋白反应相关基因MoHAC1和MoIRE1在稻瘟病菌生长发育和致病过程中的功能分析[D]. 汤蔚.南京农业大学 2015
本文编号：3330803
【文章来源】：菌物学报. 2020,39(10)北大核心CSCD
【文章页数】：11 页
【部分图文】：
不同菌株对DTT的敏感性测定
GO功能分析表明，差异表达基因在生物学过程分布最多，达到2 188个；在细胞组分中，有3 489个差异表达基因；在分子功能中，有2 490个差异表达基因。这些差异表达基因被聚类到41个功能组中。在生物学过程中，差异表达基因主要分布在代谢过程、细胞过程、单细胞过程、定位、细胞成分组织和合成、生物调节、生物过程调控和应激反应；细胞组分中的膜和膜组分过程类型的差异表达基因所占比例最高；分子功能组分中催化活性和结合过程类型差异表达基因所占比例最高（图3）。图3 差异表达基因GO功能分类
图2 总RNA电泳图谱以校正后的P-value进行统计检验，差异表达基因共鉴定出显著富集的GO term 240个，其中细胞组分、分子功能和生物过程分别为33、46和161个。从最显著富集的前6个GO分类可以看出，差异表达基因主要与蛋白质折叠（GO:0006457）、非折叠蛋白结合（GO:0051082）、核糖核蛋白复合体亚结构（GO:0071826）、核糖体RNA结合（GO:0019843）、核糖体亚基（GO:0044391）和核仁（GO:0005730）相关（表2）。这些差异基因的表达可能对果生刺盘孢响应DTT胁迫造成的非折叠蛋白具有十分重要的作用。
【参考文献】：
期刊论文
[1]bZIP转录因子CfHac1参与调控果生刺盘孢菌的生长发育和致病力[J]. 姚权,郭源,魏丰园,李司政,张盛培,李河. 菌物学报. 2019(10)
[2]MoHRD3基因参与调控稻瘟病菌的生长发育和致病力[J]. 王如锋,文佳,赵桂媛,王敏,陈雪杭,Osakina Aron,王宗华,汤蔚. 植物病理学报. 2020(01)
[3]尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析[J]. 丁兆建,吴小霞,孙君梅,陈丽霞,傅琪彦,许天委. 菌物学报. 2019(07)
[4]油茶苗圃炭疽病原菌鉴定及抗药性[J]. 李河,李司政,王悦辰,刘君昂,徐建平,周国英. 林业科学. 2019(05)
[5]湖南省油茶炭疽病病原鉴定[J]. 李河,李杨,蒋仕强,刘君昂,周国英. 林业科学. 2017(08)
[6]海南省油茶及其他寄主植物果生刺盘孢菌群体遗传结构分析[J]. 李河,李杨,徐建平,周国英. 林业科学. 2016(10)
[7]果生刺盘孢菌Colletotrichum fructicola群体遗传结构研究[J]. 朱丹雪,周国英,徐建平,刘君昂,李河. 菌物学报. 2015(03)
[8]一种油茶新炭疽病原的多基因系统发育分析鉴定[J]. 李河,周国英,徐建平,朱丹雪. 植物保护学报. 2014(05)
[9]湖南省油茶主要病害发生规律研究[J]. 喻锦秀,聂云安,周刚,李密,廖正乾,夏永刚,刘跃进. 湖南林业科技. 2014(01)
[10]N-聚糖和O-聚糖在极性化细胞蛋白质分拣中的作用[J]. 葛长荣,辛现良,耿美玉. 现代生物医学进展. 2007(05)
博士论文
[1]油茶炭疽病菌群体遗传及MAPK基因CfPMK1功能研究[D]. 李河.中南林业科技大学 2018
[2]非折叠蛋白反应相关基因MoHAC1和MoIRE1在稻瘟病菌生长发育和致病过程中的功能分析[D]. 汤蔚.南京农业大学 2015
本文编号：3330803
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